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六倍体小麦CBS基因家族全基因组分析
被引量:
1
1
作者
郭富烨
苍晶
+7 位作者
卢秋巍
田宇
宋春华
任志鹏
孙仙泽
樊晓培
王多佳
付连双
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期425-433,共9页
Cystathionineβ-synthase(CBS)基因家族在植物生长发育以及响应胁迫过程中具有重要作用,目前对CBS基因家族的研究报道较少。异源六倍体普通小麦(Triticum aestivum L.,AABBDD)作为重要的粮食作物,其CBS基因尚未得到系统研究。为研究小...
Cystathionineβ-synthase(CBS)基因家族在植物生长发育以及响应胁迫过程中具有重要作用,目前对CBS基因家族的研究报道较少。异源六倍体普通小麦(Triticum aestivum L.,AABBDD)作为重要的粮食作物,其CBS基因尚未得到系统研究。为研究小麦中CBS基因的特征,本研究对小麦全基因组进行了分析,共发现136个属于32个同源组的CBS基因,系统发育树分析将其分为8组。将这些基因定位于小麦染色体上,并对它们的基因结构、保守基序以及结构域做进一步分析,发现三联体中的CBS结构域蛋白(CDCP)具有相似的结构。在不同温度下,大多数CBS基因的三联体具有相似的表达模式。在低温及冻害条件下CBS基因在小麦抗寒过程中发挥重要作用。
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关键词
小麦
CBS
进化
基因家族
胁迫
下载PDF
职称材料
东农冬麦1号TabZIP2基因的克隆及低温和ABA作用下的表达调控
被引量:
4
2
作者
关荧
刘楠
+5 位作者
苍晶
魏铁锁
吴晶晶
齐越
郭富烨
李沅珊
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2021年第4期75-81,共7页
东农冬麦1号(Dn1)是首例能够在黑龙江地区安全过冬的强抗寒冬小麦品种,目前其体内很多相关抗寒基因已被研究。为了探索外源ABA对冬小麦TabZIP2基因在低温胁迫下的影响,以强抗寒冬小麦品种东农冬麦1号(Dn1)为试验材料,克隆了TabZIP2基因...
东农冬麦1号(Dn1)是首例能够在黑龙江地区安全过冬的强抗寒冬小麦品种,目前其体内很多相关抗寒基因已被研究。为了探索外源ABA对冬小麦TabZIP2基因在低温胁迫下的影响,以强抗寒冬小麦品种东农冬麦1号(Dn1)为试验材料,克隆了TabZIP2基因的CDS序列全长,并且利用生物信息学手段对其进行了预测分析。之后又以弱抗寒冬小麦品种济麦22(JM22)为对比材料,应用RT-PCR技术对TabZIP2基因进行逆境下不同冬小麦品种的组织表达分析,并且探讨不同温度下外源ABA对Dn1分蘖节和叶片中TabZIP2相对表达量的影响。生物信息学分析结果表明:TabZIP2基因包含759 bp的完整开放阅读框,其编码的蛋白由252个氨基酸组成,是一个分子量为26.5956 ku的不稳定蛋白;二级结构预测α-螺旋(H)和无规则卷曲(C)占大部分;该蛋白无跨膜区和信号肽,亚细胞定位表示该蛋白在细胞核中,亲水能力较强,并且与二穗短柄草以及水稻亲缘关系较近,而且该蛋白有保守的碱性亮氨酸拉链结构域。表达分析结果显示:寒胁迫下,Dn1叶片要比分蘖节提前应答低温胁迫;Dn1分蘖节和叶片中的TabZIP2表达量明显高于JM22;经过ABA处理后,-10,-25℃下Dn1分蘖节和叶片中TabZIP2的表达增加,即ABA正向调节TabZIP2的表达,初步判断ABA可以提高冬小麦抗寒性。本研究初步探究了TabZIP2在Dn1抗寒方面发挥的功能,也为低温下ABA信号调控机制提供了支持。
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关键词
冬小麦
TabZIP2
低温
ABA
生物信息学
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职称材料
题名
六倍体小麦CBS基因家族全基因组分析
被引量:
1
1
作者
郭富烨
苍晶
卢秋巍
田宇
宋春华
任志鹏
孙仙泽
樊晓培
王多佳
付连双
机构
东北农业大学生命科学学院
东北农业大学农学院
出处
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期425-433,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31971831)。
文摘
Cystathionineβ-synthase(CBS)基因家族在植物生长发育以及响应胁迫过程中具有重要作用,目前对CBS基因家族的研究报道较少。异源六倍体普通小麦(Triticum aestivum L.,AABBDD)作为重要的粮食作物,其CBS基因尚未得到系统研究。为研究小麦中CBS基因的特征,本研究对小麦全基因组进行了分析,共发现136个属于32个同源组的CBS基因,系统发育树分析将其分为8组。将这些基因定位于小麦染色体上,并对它们的基因结构、保守基序以及结构域做进一步分析,发现三联体中的CBS结构域蛋白(CDCP)具有相似的结构。在不同温度下,大多数CBS基因的三联体具有相似的表达模式。在低温及冻害条件下CBS基因在小麦抗寒过程中发挥重要作用。
关键词
小麦
CBS
进化
基因家族
胁迫
Keywords
Wheat
CBS
Evolution
Gene family
Stress
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
S330 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
东农冬麦1号TabZIP2基因的克隆及低温和ABA作用下的表达调控
被引量:
4
2
作者
关荧
刘楠
苍晶
魏铁锁
吴晶晶
齐越
郭富烨
李沅珊
机构
东北农业大学生命科学学院
北京卓诚惠生生物科技股份有限公司
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2021年第4期75-81,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31471423,31601236)。
文摘
东农冬麦1号(Dn1)是首例能够在黑龙江地区安全过冬的强抗寒冬小麦品种,目前其体内很多相关抗寒基因已被研究。为了探索外源ABA对冬小麦TabZIP2基因在低温胁迫下的影响,以强抗寒冬小麦品种东农冬麦1号(Dn1)为试验材料,克隆了TabZIP2基因的CDS序列全长,并且利用生物信息学手段对其进行了预测分析。之后又以弱抗寒冬小麦品种济麦22(JM22)为对比材料,应用RT-PCR技术对TabZIP2基因进行逆境下不同冬小麦品种的组织表达分析,并且探讨不同温度下外源ABA对Dn1分蘖节和叶片中TabZIP2相对表达量的影响。生物信息学分析结果表明:TabZIP2基因包含759 bp的完整开放阅读框,其编码的蛋白由252个氨基酸组成,是一个分子量为26.5956 ku的不稳定蛋白;二级结构预测α-螺旋(H)和无规则卷曲(C)占大部分;该蛋白无跨膜区和信号肽,亚细胞定位表示该蛋白在细胞核中,亲水能力较强,并且与二穗短柄草以及水稻亲缘关系较近,而且该蛋白有保守的碱性亮氨酸拉链结构域。表达分析结果显示:寒胁迫下,Dn1叶片要比分蘖节提前应答低温胁迫;Dn1分蘖节和叶片中的TabZIP2表达量明显高于JM22;经过ABA处理后,-10,-25℃下Dn1分蘖节和叶片中TabZIP2的表达增加,即ABA正向调节TabZIP2的表达,初步判断ABA可以提高冬小麦抗寒性。本研究初步探究了TabZIP2在Dn1抗寒方面发挥的功能,也为低温下ABA信号调控机制提供了支持。
关键词
冬小麦
TabZIP2
低温
ABA
生物信息学
Keywords
Winter wheat
TabZIP2
Low temperature
ABA
Bioinformatics
分类号
Q94 [生物学—植物学]
S512.03 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
六倍体小麦CBS基因家族全基因组分析
郭富烨
苍晶
卢秋巍
田宇
宋春华
任志鹏
孙仙泽
樊晓培
王多佳
付连双
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
1
下载PDF
职称材料
2
东农冬麦1号TabZIP2基因的克隆及低温和ABA作用下的表达调控
关荧
刘楠
苍晶
魏铁锁
吴晶晶
齐越
郭富烨
李沅珊
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2021
4
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职称材料
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