六个转录因子在人类全基因组中结合位点数的估计

转录因子是一种与DNA上特定序列相结合,进而对基因的转录和表达进行调控的蛋白质。利用理论方法对细胞或组织特异的转录因子结合位点进行预测时,负集的大小和选择往往会影响预测模型性能的评估。通过估计转录因子在人类基因组中结合位点的数量,可以准确评估预测模型的性能。因此,本文利用不同细胞系中CTCF、POLR2A、EZH2、REST、MAX、RAD21六个转录因子的ChIP-Seq数据,对转录因子在人类基因组中的结合位点数进行拟合和估计,为构建转录因子预测模型负集的选择提供参考。

抗冻糖蛋白在冰晶表面吸附结合的随机不可逆吸附模型

某些寒冷环境中生存的生物体内有可以通过吸附在冰晶表面来抑制冰晶生长的蛋白质。这些特殊的蛋白质分子降低冰晶生长点温度的同时不会对冰晶熔点温度造成明显影响,这种现象被称为热滞现象。根据吸附抑制理论,提出了一个随机不可逆吸附模型来描述抗冻糖蛋白(Antifreeze glycoprotein,AFGP)的冰晶表面吸附结合。解释了抗冻糖蛋白在冰晶表面的覆盖率随时间的变化规律,分析了相同曝光时间不同浓度条件下抗冻糖蛋白的热滞活性。理论计算结果与已报道的实验研究结果基本符合。