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绵羊OSBPL11、PAEP、ALDH1A2基因多态性与胸椎数关联分析 被引量:2
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作者 郭思武 钟英杰 +3 位作者 刘秋月 陶林 刘玉芳 储明星 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2021年第9期51-56,共6页
为探究OSBPL11、PAEP、ALDH1A2基因多态性与胸椎数之间的关联性,筛选胸椎数相关重要分子标记,本研究利用Sequenom Mass ARRAY?SNP技术检测苏尼特羊和小尾寒羊与胸椎数相关的重要候选基因OSBPL11、PAEP、ALDH1A2的单核苷酸多态性(SNPs)位... 为探究OSBPL11、PAEP、ALDH1A2基因多态性与胸椎数之间的关联性,筛选胸椎数相关重要分子标记,本研究利用Sequenom Mass ARRAY?SNP技术检测苏尼特羊和小尾寒羊与胸椎数相关的重要候选基因OSBPL11、PAEP、ALDH1A2的单核苷酸多态性(SNPs)位点,开展群体遗传学分析,并与胸椎数进行关联分析。结果显示,小尾寒羊和苏尼特羊群体中OSBPL11基因g.188064535A>G位点含有AA、AG和GG 3种基因型,PAEP基因g.3541777A>G位点含有AA、AG和GG3种基因型,ALDH1A2基因g.49249275G>A含有GG和AG 2种基因型。OSBPL11基因g.188064535A>G位点中小尾寒羊和苏尼特羊均为低度多态(PIC<0.25);PAEP基因g.3541777A>G位点中小尾寒羊和苏尼特羊均为中度多态(0.25A位点中小尾寒羊和苏尼特羊均为低度多态(PIC<0.25)。小尾寒羊和苏尼特羊3个候选基因的SNPs均处于哈代温伯格平衡状态(P>0.05)。关联分析结果表明,在苏尼特羊中ALDH1A2基因g.49249275G>A位点野生型(GG)的胸椎数显著低于杂合型(AG),其他位点在小尾寒羊和苏尼特羊中与胸椎数均没有显著关系。综上所述,ALDH1A2基因g.49249275G>A位点可作为潜在的绵羊多胸椎数分子标记。本研究结果为提高绵羊胸椎数、改良绵羊生长发育提供了理论基础。 展开更多
关键词 绵羊(苏尼特羊与小尾寒羊) OSBPL11 PAEP ALDH1A2 SNPS 胸椎数
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绵羊KIAA2012与UTP20多态、胴体品质性状关联与生物信息学分析 被引量:1
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作者 郭思武 储明星 刘玉芳 《畜牧与兽医》 北大核心 2022年第3期1-10,共10页
为探究KIAA2012和UTP20多态性与胸椎数间的关联性,筛选胸椎数相关重要分子标记,利用Sequenom MassARRAY^(■)SNP技术检测苏尼特羊和小尾寒羊中与胸椎数相关候选基因KIAA2012和UTP20的单核苷酸多态性(SNPs)位点,开展群体遗传学分析,并与... 为探究KIAA2012和UTP20多态性与胸椎数间的关联性,筛选胸椎数相关重要分子标记,利用Sequenom MassARRAY^(■)SNP技术检测苏尼特羊和小尾寒羊中与胸椎数相关候选基因KIAA2012和UTP20的单核苷酸多态性(SNPs)位点,开展群体遗传学分析,并与胸椎数进行关联分析;利用生物信息学分析工具对KIAA2012和UTP20的遗传特征进行分析。结果表明,UTP20 g.170058254G>A位点在苏尼特羊群体中突变型(GA)胸椎数显著(P<0.05)高于野生型(GG),g.170053888G>A和g.170072471G>A在小尾寒羊和苏尼特羊中均与胸椎数没有显著相关;KIAA2012 g.203440537A>G、g.203424302A>G、g.203440384A>T在小尾寒羊和苏尼特羊中与胸椎数均没有显著相关(P>0.05)。SNPs与胴体长度分析结果表明,在小尾寒羊KIAA2012 g.203440537A>G中,突变型(GA)胴体长度显著(P<0.05)高于野生型(GG)。生物信息学分析表明,KIAA2012为亲水蛋白,UTP20为疏水蛋白,两者蛋白结构均不稳定,无跨膜结构域。综上所述,UTP20 g.170058254G>A位点与苏尼特羊胸椎数性状显著相关,KIAA2012 g.203440537A>G与小尾寒羊胴体长度性状显著相关,可作为调控绵羊胸椎数变异潜在的分子辅助标记。 展开更多
关键词 KIAA2012 UTP20 SNPS 胸椎数 绵羊
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绵羊IQCA1、PARS2及ANO7多态性与胴体性状的关联分析
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作者 郭思武 刘玉芳 储明星 《中国草食动物科学》 CAS 2022年第3期6-14,共9页
旨在探究IQCA1、PARS2及ANO7多态性与胸椎数和胴体长的相关性,筛选提高绵羊胴体品质的重要分子标记。利用Sequenom MassARRAY^(■)SNP技术检测苏尼特羊和小尾寒羊2个绵羊群体与胴体性状相关候选基因IQCA1、PARS2及ANO7单核苷酸多态性(SN... 旨在探究IQCA1、PARS2及ANO7多态性与胸椎数和胴体长的相关性,筛选提高绵羊胴体品质的重要分子标记。利用Sequenom MassARRAY^(■)SNP技术检测苏尼特羊和小尾寒羊2个绵羊群体与胴体性状相关候选基因IQCA1、PARS2及ANO7单核苷酸多态性(SNPs)位点,进行群体遗传学分析,并与表型性状进行关联分析。结果表明,IQCA1基因g.4692837G>A,PARS2基因g.30789785C>T、g.30789946T>A、g.30789995C>T、g.30790544T>C和ANO7基因g.535119G>A、g.535343T>C、g.541221C>T、g.541186T>C共计9个SNPs位点在小尾寒羊和苏尼特羊中均与胸椎数不显著相关(P>0.05)。SNPs与胴体长相关性分析结果表明,小尾寒羊群体中,IQCA1 g.4692837G>A,PARS2 g.30789785C>T、g.30789946T>A、g.30789995C>T、g.30790544T>C,ANO7 g.535119G>A、g.535343T>C、g.541221C>T、g.541186T>C位点均与胴体长不显著相关(P>0.05)。综上所述,在苏尼特羊群体中,IQCA1、PARS2与ANO7的SNPs位点与胸椎数性状均不显著相关。在小尾寒羊群体中,IQCA1、PARS2与ANO7的SNPs位点与胸椎数和胴体长性状也均不显著相关。 展开更多
关键词 绵羊 IQCA1 PARS2 ANO7 胸椎数 胴体长
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绵羊HERC1和ALDH6A1多态性与胴体性状的关联分析
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作者 郭思武 刘玉芳 储明星 《特产研究》 2022年第3期18-26,共9页
本研究旨在探究绵羊HERC1与ALDH6A1多态性与胸椎数和胴体体长间的相关性,筛选提高绵羊胴体品质的重要分子标记。利用Sequenom MassARRAY SNP技术检测苏尼特羊和小尾寒羊两个绵羊群体与胴体性状相关候选基因HERC1和ALDH6A1单核苷酸多态性... 本研究旨在探究绵羊HERC1与ALDH6A1多态性与胸椎数和胴体体长间的相关性,筛选提高绵羊胴体品质的重要分子标记。利用Sequenom MassARRAY SNP技术检测苏尼特羊和小尾寒羊两个绵羊群体与胴体性状相关候选基因HERC1和ALDH6A1单核苷酸多态性(SNPs)位点,进行群体遗传学分析,并与表型性状关联;利用生物信息学工具对HERC1分子结构进行预测分析。结果表明,HERC1 c.8950G>A、g.43407058T>G、c.11902A>G和ALDH6A1 c.1126A>G在小尾寒羊和苏尼特羊中均与胸椎数不显著相关。SNPs与胴体体长分析结果表明,在小尾寒羊HERC1 c.8950G>A中,野生型(GG)胴体体长显著高于突变型(GA)(P<0.05)。生物信息学分析表明,HERC1为亲水蛋白,蛋白结构不稳定,突变前后均无跨膜结构域,可能不参与跨膜间生化反应。综上所述,HERC1 c.8950G>A位点与小尾寒羊胴体体长显著相关,可作为提高绵羊胴体性状的潜在分子辅助标记。 展开更多
关键词 HERC1 ALDH6A1 SNPS 胸椎数 绵羊
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后牙悬空式固定桥53件临床分析
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作者 郭思武 黄建生 《广东牙病防治》 1997年第3期54-55,共2页
后牙悬空式固定桥53件临床分析广东省大埔县人民医院口腔科(514200)郭思武广东省口腔医院(510260)黄建生后牙常规固定桥的桥体龈面与牙槽嵴是贴附性接触,这种接触关系可因修复体制作的误差及牙槽骨生理性吸收导致其... 后牙悬空式固定桥53件临床分析广东省大埔县人民医院口腔科(514200)郭思武广东省口腔医院(510260)黄建生后牙常规固定桥的桥体龈面与牙槽嵴是贴附性接触,这种接触关系可因修复体制作的误差及牙槽骨生理性吸收导致其间潜在间隙的产生,造成食物滞留,引... 展开更多
关键词 后牙缺失 悬空式固定桥 临床分析
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金华猪PPARGC1A基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究 被引量:5
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作者 刘玉芳 郭思武 +3 位作者 张清阳 张鑫 杨俊琦 白莹 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第3期696-705,共10页
试验旨在研究过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅助激活因子1α(PPARGC1A)在金华猪和大白猪中的遗传特征和表达情况,探究PPARGC1A基因在mRNA水平和蛋白质水平的表达模式。以金华猪和大白猪为试验动物,分别提取背脂组织的总RNA,根据GenBank... 试验旨在研究过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅助激活因子1α(PPARGC1A)在金华猪和大白猪中的遗传特征和表达情况,探究PPARGC1A基因在mRNA水平和蛋白质水平的表达模式。以金华猪和大白猪为试验动物,分别提取背脂组织的总RNA,根据GenBank中公布的猪PPARGC1A基因序列(登录号:NM_213963.2)设计编码区和实时定量PCR引物,以猪GAPDH基因和β-actin蛋白作为内参,应用多种生物信息学方法对PPARGC1A基因编码蛋白进行功能分析,并通过实时荧光定量PCR及Western blotting检测其在金华猪背脂中的表达水平。结果表明,金华猪PPARGC1A基因CDS区全长2361 bp,编码786个氨基酸,该蛋白分子大小90336.01 u,其中丝氨酸(ser)所占比例最高(13.7%),色氨酸(Trp)所占比例最低(0.8%)。同源性比对结果显示,金华猪PPARGC1A基因与山羊、牛和绵羊的同源性较高,分别为95.0%、94.9%和94.9%,在物种进化中具有较强的保守性;金华猪PPARGC1A蛋白不稳定指数为74.88,属于不稳定亲水蛋白,无跨膜结构,其二级结构由α-螺旋、延伸链、β-转角及无规则卷曲4种结构组成,所占比例分别为26.59%、5.73%、5.73%和61.96%,PPARGC1A蛋白同源建模经折叠、弯曲等一系列复杂的过程获得三级结构模型;实时荧光定量PCR试验和Western blotting试验结果一致,显示PPARGC1A基因在背脂较厚的金华猪中表达量显著低于瘦肉型的大白猪(P<0.05)。本研究为探明PPARGC1A基因对猪脂肪沉积的分子生物学功能提供了理论基础。 展开更多
关键词 金华猪 PPARGC1A基因 生物信息学分析 组织表达 脂肪沉积
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太行鸡麻羽系产蛋率与累计产蛋量曲线拟合分析 被引量:6
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作者 刘玉芳 范业锴 +3 位作者 郭思武 韩海银 杨俊琦 张伟峰 《畜牧与兽医》 北大核心 2021年第7期1-5,共5页
为探究太行鸡麻羽系的产蛋规律,利用不同统计学方法对其产蛋率和累计产蛋量进行曲线拟合分析,确定最佳模型。选用Wood、McMillan、Yang和Ali-Schaeffer 4种模型对太行鸡麻羽系蛋鸡产蛋率曲线进行拟合分析,选用Gompertz、Logistic和von B... 为探究太行鸡麻羽系的产蛋规律,利用不同统计学方法对其产蛋率和累计产蛋量进行曲线拟合分析,确定最佳模型。选用Wood、McMillan、Yang和Ali-Schaeffer 4种模型对太行鸡麻羽系蛋鸡产蛋率曲线进行拟合分析,选用Gompertz、Logistic和von Bertalanffy 3种模型对其累计产蛋数曲线进行拟合分析。统计结果表明:Yang模型的产蛋率曲线拟合效果最好,拟合度(R^(2))为0.989;von Bertalanffy模型的累计产蛋量曲线拟合效果最佳,拟合度(R^(2))为0.998,累计产蛋量的拐点周龄为38.37,拐点产蛋数为66.95。因此,Yang和von Bertalanffy模型为太行鸡麻羽系产蛋率和累计产蛋量曲线拟合的最佳模型。 展开更多
关键词 太行鸡麻羽系 产蛋率 累计产蛋量 拟合统计模型 产蛋曲线
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绵羊EVA1C、GLT6D1和TRAK2基因多态性与胸椎数关联分析
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作者 赵福林 梁琛 +1 位作者 郭思武 储明星 《中国草食动物科学》 CAS 2021年第6期18-23,共6页
为分析EVA1C、GLT6D1和TRAK2基因多态性与胸椎数之间的关联性,通过MassARRAY■SNP分型技术对EVA1C、GLT6D1和TRAK2基因的单核苷酸多态性(SNPs)位点进行分型,在2个群体中做群体遗传学分析,并分析研究其单核苷酸多态性对胸椎数和胴体长的... 为分析EVA1C、GLT6D1和TRAK2基因多态性与胸椎数之间的关联性,通过MassARRAY■SNP分型技术对EVA1C、GLT6D1和TRAK2基因的单核苷酸多态性(SNPs)位点进行分型,在2个群体中做群体遗传学分析,并分析研究其单核苷酸多态性对胸椎数和胴体长的影响。群体遗传学统计表明,在EVA1C基因的g.121232134C>A位点,TRAK2基因的g.202614768C>A位点中小尾寒羊和苏尼特羊均属于中度多态(0.25<PIC<0.50);在TRAK2基因的g.202621909G>A位点,GLT6D1基因的g.3559794G>A位点中小尾寒羊和苏尼特羊均为低度多态(PIC<0.25)。卡方适应性检验结果表明,小尾寒羊和苏尼特羊EVA1C基因的SNPs不处于哈代-温伯格(Hardy-Weinberg)平衡状态(P<0.05),GLT6D1和TRAK2基因的SNPs均处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05)。关联分析结果表明,在苏尼特羊和小尾寒羊中EVA1C、GLT6D1和TRAK2基因的突变位点与胸椎数均没有显著影响(P>0.05)。综上所述,EVA1C、GLT6D1和TRAK2基因的候选位点可能不是小尾寒羊和苏尼特羊潜在的多胸椎数的关键性位点。 展开更多
关键词 绵羊 EVA1C GLT6D1 TRAK2 胸椎数
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