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疫苗环形接种阻断猴痘传播的可行性建模
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作者 郭晓豪 杨诗婷 陈田木 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期396-409,共14页
[目的]探讨在男-男性行为(men sex with men,MSM)人群中开展环形接种从而阻断猴痘传播的可行性.[方法]将人群接触区分为固定与非固定接触两部分,建立描述环形接种的常微分方程猴痘传播数学模型.进而基于该模型的数值模拟,评估并探讨环... [目的]探讨在男-男性行为(men sex with men,MSM)人群中开展环形接种从而阻断猴痘传播的可行性.[方法]将人群接触区分为固定与非固定接触两部分,建立描述环形接种的常微分方程猴痘传播数学模型.进而基于该模型的数值模拟,评估并探讨环形接种在群体层面的防传播效果,以及接种过程中涉及的若干环节实施力度的影响.[结果]模拟显示,在基线场景的200 d传播模拟中,仅追踪接种80%和90%密接的环形接种方案可以分别使人群中平均每7.00和9.18 d产生一个病例,二者均大于病例的实际传染期,意味着发生传播阻断.密接追踪比例α1≥0.5时,继续提高α1可以减少疫苗消耗,提高有限疫苗资源的利用率.额外针对次密接的追踪接种将消耗与大规模接种类似的大量疫苗资源,效益较低,仅适用于疫情传播早期病例数极少的情形.[结论]对于猴痘这种自限性疾病,仅针对密切接触者的追踪接种可以很好地控制猴痘传播,同时对局部暴发具有较好的控制效果.然而为进一步减少聚集性暴发带来的额外负担,仍应预先提高MSM人群的疫苗覆盖率. 展开更多
关键词 疫苗 环形接种 猴痘 疾病传播 数值模拟 数学模型 常微分方程
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个体随机模型驱动的疫苗直接和间接效果评估
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作者 郭怡超 郭晓豪 +1 位作者 赵泽宇 陈田木 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期410-420,共11页
[目的]丰富国内疫苗效果评估策略,为制定免疫计划或筛选/候选疫苗提供科学依据.[方法]采用基于人群均匀混合假设的个体随机模型,以新型冠状病毒Omicron变异株为例,考虑疾病自然史、人群接触度、疫苗覆盖率和效果等因素,将个体层面疫苗... [目的]丰富国内疫苗效果评估策略,为制定免疫计划或筛选/候选疫苗提供科学依据.[方法]采用基于人群均匀混合假设的个体随机模型,以新型冠状病毒Omicron变异株为例,考虑疾病自然史、人群接触度、疫苗覆盖率和效果等因素,将个体层面疫苗的防感染和防传播效果推及群体层面的直接和间接效果.[结果]模拟结果分4个场景讨论仅提升疫苗覆盖率(vaccine coverage,VC)或仅提升疫苗效果(vaccine effectiveness,VE)的结局指标.当VE分别为0.5和0.9时,将VC从50%提升至90%,受间接效果保护人群的日新增感染率峰值的降幅分别为31.1%和72.1%,大于仅提升VE的场景;但仅提升VE的场景的直接效果不论在累积感染率还是日新增感染率指标上,均优于仅提升VC的场景.疫苗混合效果受直接效果影响较大;要实现10%以上的间接效果,至少需要接种覆盖90%以上的易感者,且疫苗防传播和防感染效果均超过85%,或其中一者接近90%,另一者接近80%.[结论]上述结果表明提升VE相比于提升VC在群体层面上更具有公共卫生学意义.但当前的新型冠状病毒疫苗防感染和防传播效果均不理想,因此加强个体接种来提升VC仍具有重要意义.间接效果随着VC的增加而增加,这将为群体中无法接种的个体提供一定保护作用. 展开更多
关键词 个体随机模型 疫苗效果 群体免疫 新冠病毒 疫苗覆盖率 免疫计划
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基于两个陆地棉低世代群体定位纤维品质相关QTL 被引量:2
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作者 郭晓豪 王寒涛 +5 位作者 魏鑫 张晶晶 付小康 马亮 魏恒玲 喻树迅 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2021年第1期33-41,共9页
【目的】定位棉花纤维品质性状相关的数量性状位点(Quantitative trait locus,QTL)。【方法】以陆地棉高强纤维品系中棉所679和纤维品质一般的农垦5号为亲本构建包含200个单株的F2群体及对应的F2:3家系群体,对2个群体的纤维长度、断裂... 【目的】定位棉花纤维品质性状相关的数量性状位点(Quantitative trait locus,QTL)。【方法】以陆地棉高强纤维品系中棉所679和纤维品质一般的农垦5号为亲本构建包含200个单株的F2群体及对应的F2:3家系群体,对2个群体的纤维长度、断裂比强度等5个纤维品质性状进行检测。用6 688对简单重复序列(Simple sequence repeat, SSR)引物在双亲间筛选,得到149对多态性引物,以F2为作图群体,使用QTL IciMapping软件进行连锁图谱构建,并对F2及F2:3群体进行QTL定位。【结果】根据F2群体基因型信息构建了1张包含119个标记、28个连锁群、总长为1 173.5 cM(centiMorgan)的遗传连锁图谱。分别在F_2、F2:3群体中检测到9个和11个与纤维品质性状相关的QTLs,这些QTLs分布在11个连锁群上。其中F2群体的qFL-D11-1、q BT-D11-1与F2:3群体的qFL-D11-1、q MIC-D11-1均定位在标记DPL0062与HAU0423之间,推测这些位点可能是控制纤维品质性状的重要QTL。【结论】利用多个群体进行QTL定位有益于发现稳定的QTL位点,控制纤维品质性状的基因可能成簇存在,为挖掘纤维品质性状相关基因及分子标记辅助育种奠定基础。 展开更多
关键词 陆地棉 纤维品质 SSR 连锁图谱 QTL
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