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两种分子分型技术在乳制品克诺罗杆菌污染溯源分析上的比较
被引量:
5
1
作者
郭清艳
钮冰
杨捷琳
《中国乳品工业》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第8期13-17,20,共6页
对2005-2006年进口婴幼儿配方奶粉等乳制品的原料及产品中分离获得的49株阪崎肠杆菌(Enterobacter sakazakii),通过二代测序技术获得其全基因组序列,并比较两种分子分型技术的优缺点。通过二代测序技术获得49个菌株的全基因组序列,通过f...
对2005-2006年进口婴幼儿配方奶粉等乳制品的原料及产品中分离获得的49株阪崎肠杆菌(Enterobacter sakazakii),通过二代测序技术获得其全基因组序列,并比较两种分子分型技术的优缺点。通过二代测序技术获得49个菌株的全基因组序列,通过fusA确定菌株种属,根据多位点序列分型(Multi-locus Sequence Typing, MLST)确定序列型(ST, Sequence type)。再对32株ST13菌株进行单核苷酸多态性位点分析(single nucleotide polymorphism, SNP),并构建进化树。结果 49株阪崎肠杆菌均确认为阪崎克罗诺杆菌(C.sakazakii)。49株C.sakazakii由8个ST(Sequence type,序列型)组成。ST13的菌株占分离菌株的绝对优势(65.3%, 32/49)。ST13菌株的SNP结果显示32株菌被分成4个组和5个独立的菌株。表明随着高通量测序技术的不断完善,通过全基因组序列的MLST分型方法完成初步分型,而针对遗传相似性很高的菌株,应用SNP分析深入分型,能对被克罗诺杆菌属(Cronobacter spp.)污染的乳粉进行快速溯源,对全球疫情调查有重要意义。
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关键词
阪崎克罗诺杆菌
全基因组测序
多位点序列分型
单核苷酸多态性位点
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职称材料
下一代测序技术在食源性致病菌研究中的应用
被引量:
5
2
作者
郭清艳
钮冰
杨捷琳
《食品安全质量检测学报》
CAS
2017年第4期1332-1338,共7页
下一代测序技术是DNA测序的一项革命性创新技术,其特点是方便快速、高效准确、信息容量大,可实现物种基因组或转录组的深入研究。现阶段,食源性致病微生物导致的全球食品安全问题不断发生,下一代测序技术可在信息缺乏或多种微生物存在...
下一代测序技术是DNA测序的一项革命性创新技术,其特点是方便快速、高效准确、信息容量大,可实现物种基因组或转录组的深入研究。现阶段,食源性致病微生物导致的全球食品安全问题不断发生,下一代测序技术可在信息缺乏或多种微生物存在的情况下对食源性致病微生物进行检测判定,可在基因序列的背景下更科学地认识食源性致病菌的遗传特性、代谢能力、致病机制等,为食源性微生物疾病预防和控制提供重要的依据。本文主要介绍了在第一代测序技术的基础上发展起来的下一代测序技术,包括第二代测序技术和第三代测序技术的原理、发展历程及优劣势,着重概述了下一代测序技术在食源性致病菌检测鉴定中的应用,并展望该技术在食源性致病菌检测应用中的发展趋势。
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关键词
食源性致病菌
深度测序
第二代测序技术
第三代测序技术
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职称材料
平凡的故事带我走进幸福——在叙事研究中获取智慧促进教育教学
被引量:
1
3
作者
郭清艳
《长春教育学院学报》
2006年第2期60-62,共3页
今天(2006年4月7日),能有机会参加这次"长春市中小学教师叙事研究经验交流会",我感到很荣幸.我这里讲的只能说是在叙事研究中的一些做法和体会.以前我对"教育叙事"了解并不多,自从在教师中开始"开展叙事...
今天(2006年4月7日),能有机会参加这次"长春市中小学教师叙事研究经验交流会",我感到很荣幸.我这里讲的只能说是在叙事研究中的一些做法和体会.以前我对"教育叙事"了解并不多,自从在教师中开始"开展叙事性研究"我才发现:其实,叙事研究在我校早已经开展了,只不过那时并没有叫叙事研究.……
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关键词
教育教学
叙事研究
文本对话
故事
民间文学
幸福
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职称材料
走出“关系经济”困局:从关系到契约
4
作者
何娜娜
郭清艳
《中南财经政法大学研究生学报》
2010年第3期38-43,共6页
中国社会,是一个"讲交情、攀关系"的社会。这种因血缘、地缘和业缘等组成的"关系"纽带在经济发展和人民的日常生活中发挥着重要作用。但是,随着市场经济的发展,"关系经济"的弊端逐渐凸显。"关系经济...
中国社会,是一个"讲交情、攀关系"的社会。这种因血缘、地缘和业缘等组成的"关系"纽带在经济发展和人民的日常生活中发挥着重要作用。但是,随着市场经济的发展,"关系经济"的弊端逐渐凸显。"关系经济"高昂的总交易成本造成了社会资源的扭曲和浪费,也造成了寻租和搭便车行为,因此必须要逐步转化为契约经济。基于分析,文章最后尝试性地提出了走出"关系经济"困局的理论性建议。
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关键词
“关系经济”
圈外人
圈内人
契约经济
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职称材料
题名
两种分子分型技术在乳制品克诺罗杆菌污染溯源分析上的比较
被引量:
5
1
作者
郭清艳
钮冰
杨捷琳
机构
上海大学生命科学学院
上海出入境检验检疫局
出处
《中国乳品工业》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第8期13-17,20,共6页
基金
国家自然基金(31671936)
上海市自然基金(16ZR1410900)
上海市长三角科技联合攻关项目(16395810100)
文摘
对2005-2006年进口婴幼儿配方奶粉等乳制品的原料及产品中分离获得的49株阪崎肠杆菌(Enterobacter sakazakii),通过二代测序技术获得其全基因组序列,并比较两种分子分型技术的优缺点。通过二代测序技术获得49个菌株的全基因组序列,通过fusA确定菌株种属,根据多位点序列分型(Multi-locus Sequence Typing, MLST)确定序列型(ST, Sequence type)。再对32株ST13菌株进行单核苷酸多态性位点分析(single nucleotide polymorphism, SNP),并构建进化树。结果 49株阪崎肠杆菌均确认为阪崎克罗诺杆菌(C.sakazakii)。49株C.sakazakii由8个ST(Sequence type,序列型)组成。ST13的菌株占分离菌株的绝对优势(65.3%, 32/49)。ST13菌株的SNP结果显示32株菌被分成4个组和5个独立的菌株。表明随着高通量测序技术的不断完善,通过全基因组序列的MLST分型方法完成初步分型,而针对遗传相似性很高的菌株,应用SNP分析深入分型,能对被克罗诺杆菌属(Cronobacter spp.)污染的乳粉进行快速溯源,对全球疫情调查有重要意义。
关键词
阪崎克罗诺杆菌
全基因组测序
多位点序列分型
单核苷酸多态性位点
Keywords
C.sakazakii
WGS
MLST
SNP
分类号
Q93-331 [生物学—微生物学]
Q933 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
下一代测序技术在食源性致病菌研究中的应用
被引量:
5
2
作者
郭清艳
钮冰
杨捷琳
机构
上海大学生命科学学院
上海出入境检验检疫局
出处
《食品安全质量检测学报》
CAS
2017年第4期1332-1338,共7页
文摘
下一代测序技术是DNA测序的一项革命性创新技术,其特点是方便快速、高效准确、信息容量大,可实现物种基因组或转录组的深入研究。现阶段,食源性致病微生物导致的全球食品安全问题不断发生,下一代测序技术可在信息缺乏或多种微生物存在的情况下对食源性致病微生物进行检测判定,可在基因序列的背景下更科学地认识食源性致病菌的遗传特性、代谢能力、致病机制等,为食源性微生物疾病预防和控制提供重要的依据。本文主要介绍了在第一代测序技术的基础上发展起来的下一代测序技术,包括第二代测序技术和第三代测序技术的原理、发展历程及优劣势,着重概述了下一代测序技术在食源性致病菌检测鉴定中的应用,并展望该技术在食源性致病菌检测应用中的发展趋势。
关键词
食源性致病菌
深度测序
第二代测序技术
第三代测序技术
Keywords
foodborne pathogens
deep sequencing
the second generation sequencing technology
the third generation sequencing technology
分类号
R155.5 [医药卫生—营养与食品卫生学]
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职称材料
题名
平凡的故事带我走进幸福——在叙事研究中获取智慧促进教育教学
被引量:
1
3
作者
郭清艳
机构
长春市明德小学
出处
《长春教育学院学报》
2006年第2期60-62,共3页
文摘
今天(2006年4月7日),能有机会参加这次"长春市中小学教师叙事研究经验交流会",我感到很荣幸.我这里讲的只能说是在叙事研究中的一些做法和体会.以前我对"教育叙事"了解并不多,自从在教师中开始"开展叙事性研究"我才发现:其实,叙事研究在我校早已经开展了,只不过那时并没有叫叙事研究.……
关键词
教育教学
叙事研究
文本对话
故事
民间文学
幸福
分类号
G4 [文化科学—教育技术学]
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职称材料
题名
走出“关系经济”困局:从关系到契约
4
作者
何娜娜
郭清艳
机构
中南财经政法大学经济学院
中南财经政法大学法学院
出处
《中南财经政法大学研究生学报》
2010年第3期38-43,共6页
文摘
中国社会,是一个"讲交情、攀关系"的社会。这种因血缘、地缘和业缘等组成的"关系"纽带在经济发展和人民的日常生活中发挥着重要作用。但是,随着市场经济的发展,"关系经济"的弊端逐渐凸显。"关系经济"高昂的总交易成本造成了社会资源的扭曲和浪费,也造成了寻租和搭便车行为,因此必须要逐步转化为契约经济。基于分析,文章最后尝试性地提出了走出"关系经济"困局的理论性建议。
关键词
“关系经济”
圈外人
圈内人
契约经济
Keywords
Guanxi Economy
The Outsiders
Coterie
Contract Economy
分类号
F124 [经济管理—世界经济]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
两种分子分型技术在乳制品克诺罗杆菌污染溯源分析上的比较
郭清艳
钮冰
杨捷琳
《中国乳品工业》
CAS
CSCD
北大核心
2018
5
下载PDF
职称材料
2
下一代测序技术在食源性致病菌研究中的应用
郭清艳
钮冰
杨捷琳
《食品安全质量检测学报》
CAS
2017
5
下载PDF
职称材料
3
平凡的故事带我走进幸福——在叙事研究中获取智慧促进教育教学
郭清艳
《长春教育学院学报》
2006
1
下载PDF
职称材料
4
走出“关系经济”困局:从关系到契约
何娜娜
郭清艳
《中南财经政法大学研究生学报》
2010
0
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职称材料
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