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苹果属无融合生殖SERK1基因的克隆与生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
张丽杰
Mohamed hamad
+2 位作者
董文轩
郭苏漫
孟庆娇
《林业科学研究》
CSCD
北大核心
2016年第1期67-73,共7页
[目的]为探讨苹果属植物无融合生殖分子机制。[方法]以苹果属平邑甜茶及杂种后代33#为试材,以苹果基因组CDS序列设计引物,通过PCR扩增技术克隆出SERK同源基因的c DNA全长序列,命名为Mh SERK1和MhdSERK1(Gen Bank登录号JQ231273和JQ23127...
[目的]为探讨苹果属植物无融合生殖分子机制。[方法]以苹果属平邑甜茶及杂种后代33#为试材,以苹果基因组CDS序列设计引物,通过PCR扩增技术克隆出SERK同源基因的c DNA全长序列,命名为Mh SERK1和MhdSERK1(Gen Bank登录号JQ231273和JQ231272),利用实时定量RTq PCR的方法检测了这两个基因在平邑甜茶和杂种后代各组织和器官中的表达模式。[结果]序列分析显示Mh SERK1和Mhd SERK1编码区序列全长为1 899 bp和1 881 bp,分别编码632和626个氨基酸,其氨基酸序列与其他植物的SERK1同源基因所编码的氨基酸同源性都在80%以上,特别是与葡萄科龙眼品种同源性最高,高达92.56%,与模式植物拟南芥、烟草等植物的SERK同源基因都具有很高的同源性。实时定量PCR结果表明,在平邑甜茶和杂种后代不同组织、花器官中SERK1基因的表达量存在差异,其中在子房中的表达量最高,在营养生长的组织中表达量很低,在平邑甜茶花蕾期的子房中表达量最高。[结论]推测该基因在平邑甜茶和杂种后代的生殖发育过程中可能发挥重要作用。
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关键词
苹果属
SERK
同源基因
生物信息学分析
下载PDF
职称材料
苹果属无融合生殖SERKs基因家族的克隆和表达分析
被引量:
1
2
作者
张丽杰
郭苏漫
董文轩
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期1033-1039,共7页
本研究利用同源克隆法以苹果属平邑甜茶和杂种后代叶片为试验材料,克隆得到4个SERK基因家族片段,并分析了SERKs家族基因在平邑甜茶和杂种后代不同器官和组织中的表达情况。研究结果表明:分离获得的4个SERK基因家族片段的氨基酸序列与模...
本研究利用同源克隆法以苹果属平邑甜茶和杂种后代叶片为试验材料,克隆得到4个SERK基因家族片段,并分析了SERKs家族基因在平邑甜茶和杂种后代不同器官和组织中的表达情况。研究结果表明:分离获得的4个SERK基因家族片段的氨基酸序列与模式植物拟南芥、烟草等植物的同源性均在84%以上,同时与其他物种的氨基酸序列进行Blast比对都具有较高的同源性;RT-PCR定量分析结果表明SERK1、SERK2、SERK3、SERK4基因主要在生殖器官中表达。因此,推测SERKs基因在平邑甜茶和杂种后代生殖发育过程中起着重要的调控作用。本研究结果为进一步揭示无融合生殖的发生机理奠定了基础。
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关键词
平邑甜茶和杂种后代
SERKs
基因克隆
RT-PCR
原文传递
题名
苹果属无融合生殖SERK1基因的克隆与生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
张丽杰
Mohamed hamad
董文轩
郭苏漫
孟庆娇
机构
沈阳农业大学林学院
沈阳农业大学园艺学院
辽宁省本溪市桓仁县林业局
出处
《林业科学研究》
CSCD
北大核心
2016年第1期67-73,共7页
基金
国家自然科学基金"苹果属四倍性皱叶矮生株系的生殖特征及形成机理研究"(30971975)
文摘
[目的]为探讨苹果属植物无融合生殖分子机制。[方法]以苹果属平邑甜茶及杂种后代33#为试材,以苹果基因组CDS序列设计引物,通过PCR扩增技术克隆出SERK同源基因的c DNA全长序列,命名为Mh SERK1和MhdSERK1(Gen Bank登录号JQ231273和JQ231272),利用实时定量RTq PCR的方法检测了这两个基因在平邑甜茶和杂种后代各组织和器官中的表达模式。[结果]序列分析显示Mh SERK1和Mhd SERK1编码区序列全长为1 899 bp和1 881 bp,分别编码632和626个氨基酸,其氨基酸序列与其他植物的SERK1同源基因所编码的氨基酸同源性都在80%以上,特别是与葡萄科龙眼品种同源性最高,高达92.56%,与模式植物拟南芥、烟草等植物的SERK同源基因都具有很高的同源性。实时定量PCR结果表明,在平邑甜茶和杂种后代不同组织、花器官中SERK1基因的表达量存在差异,其中在子房中的表达量最高,在营养生长的组织中表达量很低,在平邑甜茶花蕾期的子房中表达量最高。[结论]推测该基因在平邑甜茶和杂种后代的生殖发育过程中可能发挥重要作用。
关键词
苹果属
SERK
同源基因
生物信息学分析
Keywords
Malus
SERK
homologue gene
bioinformatics analysis
分类号
S661.1 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
苹果属无融合生殖SERKs基因家族的克隆和表达分析
被引量:
1
2
作者
张丽杰
郭苏漫
董文轩
机构
沈阳农业大学林学院
沈阳农业大学园艺学院
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期1033-1039,共7页
基金
国家自然科学基金(30971975)资助
文摘
本研究利用同源克隆法以苹果属平邑甜茶和杂种后代叶片为试验材料,克隆得到4个SERK基因家族片段,并分析了SERKs家族基因在平邑甜茶和杂种后代不同器官和组织中的表达情况。研究结果表明:分离获得的4个SERK基因家族片段的氨基酸序列与模式植物拟南芥、烟草等植物的同源性均在84%以上,同时与其他物种的氨基酸序列进行Blast比对都具有较高的同源性;RT-PCR定量分析结果表明SERK1、SERK2、SERK3、SERK4基因主要在生殖器官中表达。因此,推测SERKs基因在平邑甜茶和杂种后代生殖发育过程中起着重要的调控作用。本研究结果为进一步揭示无融合生殖的发生机理奠定了基础。
关键词
平邑甜茶和杂种后代
SERKs
基因克隆
RT-PCR
Keywords
Pingyitiancha and hybrid offspring
SERKs
Gene cloning
RT-PCR
分类号
S661.1 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
苹果属无融合生殖SERK1基因的克隆与生物信息学分析
张丽杰
Mohamed hamad
董文轩
郭苏漫
孟庆娇
《林业科学研究》
CSCD
北大核心
2016
1
下载PDF
职称材料
2
苹果属无融合生殖SERKs基因家族的克隆和表达分析
张丽杰
郭苏漫
董文轩
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2015
1
原文传递
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
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