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萝卜花叶性状的遗传分析及基因定位
1
作者
李雪微
郭超程
+4 位作者
宋瑶
高长斌
张小康
熊秋芳
刘克德
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期139-145,共7页
为筛选控制萝卜花叶性状的候选基因,以萝卜花叶品种J4和板叶品种WA构建F_(2)分离群体,在F_(2)群体中,选择20个花叶和20个板叶单株,分别构成花叶和板叶DNA混合池,分析花叶性状的遗传规律。结果显示:萝卜花叶性状受1对基因控制,且花叶对...
为筛选控制萝卜花叶性状的候选基因,以萝卜花叶品种J4和板叶品种WA构建F_(2)分离群体,在F_(2)群体中,选择20个花叶和20个板叶单株,分别构成花叶和板叶DNA混合池,分析花叶性状的遗传规律。结果显示:萝卜花叶性状受1对基因控制,且花叶对板叶呈不完全显性;结合集团分离分析(bulked segregant analysis,BSA)与简化基因组测序基因型分析技术(genotyping by sequencing,GBS),将花叶基因定位在R7染色体0.07~7.97 Mb区间内;通过萝卜全基因组与甘蓝型油菜全基因组的共线性分析发现,萝卜候选区间内0.87~1.32 Mb与油菜A10染色体的16.35~16.80 Mb存在很好的共线性;对共线性区段进行基因功能注释确认Rs390250(899863~901651 bp)为萝卜花叶的候选基因;该基因编码1个HD-ZipⅠ(the class Ⅰ homeodomain leucine-zipper)转录因子,其位于第二外显子的非同义突变位点T425C会导致LZ(leucinezipper)结构域内保守氨基酸的改变,可能是导致叶形变异的关键位点。
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关键词
萝卜(Raphanussativus
L.)
花叶性状
BSA-Seq
叶形变异
候选基因
共线性
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题名
萝卜花叶性状的遗传分析及基因定位
1
作者
李雪微
郭超程
宋瑶
高长斌
张小康
熊秋芳
刘克德
机构
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室
武汉市农业科学院蔬菜研究所
武汉莱菔农业科技有限公司
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期139-145,共7页
基金
湖北省重点研发计划(2021BBA097)。
文摘
为筛选控制萝卜花叶性状的候选基因,以萝卜花叶品种J4和板叶品种WA构建F_(2)分离群体,在F_(2)群体中,选择20个花叶和20个板叶单株,分别构成花叶和板叶DNA混合池,分析花叶性状的遗传规律。结果显示:萝卜花叶性状受1对基因控制,且花叶对板叶呈不完全显性;结合集团分离分析(bulked segregant analysis,BSA)与简化基因组测序基因型分析技术(genotyping by sequencing,GBS),将花叶基因定位在R7染色体0.07~7.97 Mb区间内;通过萝卜全基因组与甘蓝型油菜全基因组的共线性分析发现,萝卜候选区间内0.87~1.32 Mb与油菜A10染色体的16.35~16.80 Mb存在很好的共线性;对共线性区段进行基因功能注释确认Rs390250(899863~901651 bp)为萝卜花叶的候选基因;该基因编码1个HD-ZipⅠ(the class Ⅰ homeodomain leucine-zipper)转录因子,其位于第二外显子的非同义突变位点T425C会导致LZ(leucinezipper)结构域内保守氨基酸的改变,可能是导致叶形变异的关键位点。
关键词
萝卜(Raphanussativus
L.)
花叶性状
BSA-Seq
叶形变异
候选基因
共线性
Keywords
radish(Raphanus sativus L.)
lobed-leaf
BSA-Seq
variation of leaf morphology
can⁃didate gene
collinearity
分类号
S631.103.2 [农业科学—蔬菜学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
萝卜花叶性状的遗传分析及基因定位
李雪微
郭超程
宋瑶
高长斌
张小康
熊秋芳
刘克德
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
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