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富集文库-菌落原位杂交法筛选仿刺参微卫星标记
被引量:
3
1
作者
卢超
包振民
+3 位作者
彭薇
鄢婧婧
吕雅萌
胡景杰
《中国海洋大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第S1期137-141,共5页
应用微卫星富集文库—菌落原位杂交的方法,筛选得到了33个仿刺参的微卫星标记。富集文库中900个重组克隆经过菌落原位杂交后,415个(46.1%)为阳性克隆。随机挑取100个阳性克隆进行测序,结果显示这些克隆都含有微卫星位点。设计了57对特异...
应用微卫星富集文库—菌落原位杂交的方法,筛选得到了33个仿刺参的微卫星标记。富集文库中900个重组克隆经过菌落原位杂交后,415个(46.1%)为阳性克隆。随机挑取100个阳性克隆进行测序,结果显示这些克隆都含有微卫星位点。设计了57对特异性PCR引物,33对能扩增出清晰的条带。利用48个野生仿刺参个体对33个微卫星位点进行评价,结果显示位点都具有多态性。33个多态位点共获得222个等位基因,平均每个位点获得6.7个等位基因。观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)的范围分别为0.050 0~1.000 0和0.203 2~0.915 9。结果表明,富集文库—菌落原位杂交法筛选微卫星标记比较高效,获得的微卫星标记可以用于仿刺参的分子遗传学研究。
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关键词
仿刺参
富集文库
菌落原位杂交
微卫星标记
多态性
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职称材料
题名
富集文库-菌落原位杂交法筛选仿刺参微卫星标记
被引量:
3
1
作者
卢超
包振民
彭薇
鄢婧婧
吕雅萌
胡景杰
机构
中国海洋大学海洋生物遗传育种教育部重点实验室海洋生命学院
出处
《中国海洋大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第S1期137-141,共5页
基金
国家高技术研究发展计划项目(2006AA10A411)
十一五国家科技支撑计划项目(2006BAD09A09)
十一五国家科技支撑计划(2006BAD09A10)资助
文摘
应用微卫星富集文库—菌落原位杂交的方法,筛选得到了33个仿刺参的微卫星标记。富集文库中900个重组克隆经过菌落原位杂交后,415个(46.1%)为阳性克隆。随机挑取100个阳性克隆进行测序,结果显示这些克隆都含有微卫星位点。设计了57对特异性PCR引物,33对能扩增出清晰的条带。利用48个野生仿刺参个体对33个微卫星位点进行评价,结果显示位点都具有多态性。33个多态位点共获得222个等位基因,平均每个位点获得6.7个等位基因。观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)的范围分别为0.050 0~1.000 0和0.203 2~0.915 9。结果表明,富集文库—菌落原位杂交法筛选微卫星标记比较高效,获得的微卫星标记可以用于仿刺参的分子遗传学研究。
关键词
仿刺参
富集文库
菌落原位杂交
微卫星标记
多态性
Keywords
Apostichopus japonicus
SSR-enrichmed library
colony hybridization
microsatellite
polymorphic
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
富集文库-菌落原位杂交法筛选仿刺参微卫星标记
卢超
包振民
彭薇
鄢婧婧
吕雅萌
胡景杰
《中国海洋大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2010
3
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