问号赖型钩体重组质粒pDJH_2 DNA 序列测定及其与其它细菌omp基因序列比较分析

对ｐＤＪＨ２片段ＤＮＡ进行了序列测定，结果：插入片段为１８１１个核苷酸；可读框２个：ＯＲＦ１，１－５６５ｂｐ；ＯＲＦ２（从最后一个密码倒算）１－６６２ｂｐ，计算机序列同源性或类似性匹配（ａｌｉｇｎｍｅｎｔ）表明，ＯＲＦ１与ＯＲＦ２的核苷酸类似性为４９．３６％；ＯＲＦ１与Ｌ．ｋｉｒｓｃｈｎｅｒｉ（Ｌ．ａｌｓｔｏｎｉ）流感伤寒型ｏｍｐ核苷酸序列类似性为４９．２６％；ＯＲＦ２与Ｌ．ａｌｓｔｏｎｉ类似性为５１．５６％；ＯＲＦ１与其它细菌（包括螺旋体）ｏｍｐ核苷酸序列对准比较，序列类似性均在４３％以上。经查阅ＥＭＢＬＤＮＡ序列数据库未见类似序列。作者认为ｐＤＪＨ２的１．９ｋｂ插入ＤＮＡ片段（ＯＲＦ１与ＯＲＦ２）可能是具有保护作用的ｏｍｐ基因片段。

问号钩体(狭义)种特异探针重组质粒pCX7插入片段核苷酸序列分析

为了建立敏感和特异的鉴别致病性钩体菌株的方法，用ＡＢＩ自动测序仪对问号钩体（Ｌ．ｉｎｔｅｒｒｏｇａｎｓｓｅｎｓｕｓｔｒｉｃｔｏ）种特异探针ＤＮＡ重组质粒ｐＣＸ７，１．７ｋｂＰｓｔⅠ部分插入片段进行了核苷酸序列测定。结果：该部分插入片段ｂｐ总数为１～５０１ｂｐ，其中可读框（ＯＲＦ）１个，序列为８７～３９３，共３０６ｂｐ。ＯＲＦ除去一些核苷酸不能确定外（图中以Ｎ表示），绝大多数在一个ＯＲＦ。计算机检索有关同源序列１８个，较高序列类似性５个，均在４１％以下。经查ＥＭＢＬＤＮＡ序列数据库未见类似序列。由此提示，以ｐＣＸ７作为探针可用于钩体菌株鉴定。