2018-2019年福建省禽类外环境H5亚型禽流感病毒分子特征和遗传进化分析

目的分析2018-2019年福建省禽类外环境H5亚型禽流感病毒的分子特征和遗传进化特点,为禽流感防控提供参考依据。方法对2018-2019年福建省禽类外环境H5亚型单阳性标本进行复核,筛选出Ct值小于30的标本,对HA和NA基因进行靶向扩增和二代测序,从NCBI和GISAID数据库下载参考序列,使用生物信息学软件分别对HA和NA基因进行分子突变位点和遗传进化分析。结果共完成12株H5亚型HA和NA全基因测序。序列比对结果显示,HA基因最高一致性在98.59%~99.89%,NA基因最高一致性在98.19%~99.85%。遗传进化分析显示,HA基因归属于Clade 2.3.4.4h分支,NA基因归属于欧亚谱系H5N6和H6N6分支。12株毒株的裂解位点均为高致病性禽流感病毒分子特征,受体结合位点为禽源受体,但S123P、S133A、I151T、T156A突变可增强病毒与人源受体的亲和力。HA基因糖基化位点分析显示,常见154位糖基化位点缺失,在124位(-NHTS)新增潜在糖基化位点。结论2018-2019年福建省禽类外环境中存在Clade 2.3.4.4h进化分支H5N6高致病性禽流感病毒,并且N6基因在进化上具有多样性,提示基因进化重组的可能,需加强对病毒分子进化的持续监测。

新型冠状病毒肺炎确诊病例粪便标本的病毒核酸检测

目的了解新型冠状病毒肺炎(COVID-19)确诊病例粪便中2019-nCoV感染情况。方法收集36例确诊病例的粪便标本/肛拭子标本,采用实时荧光RT-PCR检测2019-nCoV载量,利用统计分析软件SPSS 19.0比较病例的带毒率。结果36份标本共检出2019-nCoV核酸阳性20份(55.56%),危重症病例(2/3)和重症病例标本阳性率均为66.67%(6/9)、普通肺炎病例阳性率为62.50%(10/16)、轻症肺炎病例阳性率为25.00%(2/8)。36例确诊病例包括男性22例、女性14例,检出率分别为54.55%和57.14%;病例年龄分布于17~86岁之间,平均为48.75岁。36份标本其中5份肛拭子标本检出阳性标本2份,31份粪便标本检出阳性标本18。临床分型、性别、年龄和标本类型各组间阳性检出率均无统计学差异。结论本研究发现COVID-19患者,无论重症、轻症患者粪便标本均存在2019-nCoV基因检测阳性,提示消化道可能是该病毒排泄渠道,因此可能存在粪-口传播途径,研究结果具有重要的临床和流行病学意义。

福建省新型冠状病毒的分离和全基因组特征分析

目的从福建省早期新型冠状病毒肺炎(COVID-19)病例中分离新型冠状病毒(2019-nCoV)并了解病毒基因组特征。方法将福建省早期COVID-19患者的咽拭子样本接种至Vero-E6细胞,培养上清提取核酸,经real-time RT-PCR法验证后,利用Ion Torrent S5深度测序仪做全基因组测序,分析病毒株全基因组序列与参考序列的一致性和进化情况。结果12份咽拭子样本经培养后有2份样本病毒滴度明显上升,表明分离到2株2019-nCoV,其全基因组结构蛋白与Wuhan-Hu-1株的一致性超过99.9%。结论成功自福建省早期COVID-19病例中分离到2019-nCoV,病毒分离株的基因序列与湖北武汉流行的2019-nCoV高度同源,提示病毒尚未发生明显变异。

新型冠状病毒在Vero-E6细胞中的增殖特征分析

目的了解新型冠状病毒(2019-nCoV)在Vero-E6细胞中的增殖特征,为病毒的分离培养、抗病毒药物研究以及疫苗研制等工作提供基础。方法将2019-nCoV做半对数系列稀释,测定病毒的半数组织培养感染剂量(TCID 50);以1.74×10^-4 TCID 50/cell的病毒量感染Vero-E6细胞,在病毒吸附后第0~6 d分别收集病毒培养上清,测定上清中病毒感染滴度和病毒核酸拷贝数;测定病毒储存液冻融/非冻融、不同细胞悬液浓度、病毒吸附后洗涤/不洗涤等不同实验条件下的TCID 50。结果2019-nCoV感染Vero-E6细胞后,48 h内培养上清中的病毒TCID 50和病毒核酸拷贝数到达或接近峰值,平均复制周期约为3.29 h;48 h后上清中病毒核酸拷贝数维持在较高水平但病毒感染滴度逐渐下降。病毒储存液的冻融、细胞浓度以及病毒吸附后洗涤等培养条件可轻微影响病毒TCID 50。结论2019-nCoV感染Vero-E6细胞在早期增殖迅速,感染后期病毒感染滴度逐渐下降,但病毒核酸拷贝数在上清中维持在较高水平。

2016-2020年福建省A(H1N1)pdm09流感病毒HA基因特征分析

目的分析2016-2020年福建省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的血凝素(Hemagglutinin,HA)基因特征,了解与其他省份和全球范围内时间和空间上的分布差异。方法选取2016-2020年福建省流感监测网络实验室分离A(H1N1)pdm09流感毒株基因序列测定。基因序列用MEGA、Net NGlyc 1.0 Server分析基因特征。结果2016-2020年福建省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒HA基因进化树分析与其他省份及国外大部分一致,但仍有少部分不同。HA分支由6B转化为6B.1并演化至6B.1A5A。HA基因变异主要在抗原性决定簇Sa、Ca、Sb。对于不同地区疫苗株匹配度也会有差异。结论福建省A(H_(1)N_(1))pdm09病毒流行株具有遗传多样性。

2017—2021年福建省外环境禽流感病毒监测

目的分析2017—2021年福建省外环境禽流感病毒流行特点, 为禽流感防控、预测工作提供参考。方法在福建省6地市监测点的4类禽类相关不同场所进行6类不同类型标本的采样, 采用荧光定量PCR法对环境标本进行A型、H5、H7和H9亚型核酸检测, 并采用流行病学方法对检测结果进行分析。结果 2017—2021年共采集6个监测点标本4 214份, 其中A型禽流感病毒阳性率为41.53%(1 750份), H5、H7和H9亚型阳性率分别为2.33%(98份)、1.16%(49份)和23.16%(976份), H5+H7亚型阳性率为0.05%(2份), H5+H9亚型阳性率为1.83%(77份), H7+H9亚型阳性率为0.83%(35份), H5+H7+H9亚型阳性率为0.09%(4份), A型阳性未分型的阳性率为12.08%(509份)。不同检测场所和不同类型标本A型阳性率的差异具有统计学意义(χ^(2)=517.57,P<0.001;χ^(2)=51.58,P<0.001):城乡活禽市场的禽流感病毒阳性率最高(49.72%);不同类型标本中笼具表面擦拭标本(48.09%)、清洗禽类的污水(47.34%)和宰杀或摆放禽肉案板表面(45.66%)的阳性率较高。不同地区监测点的A型阳性率差异具有统计学意义(χ^(2)=458.34,P<0.001):A型阳性率最高和最低的地市分别是三明市(56.00%)和漳州市(3.34%)。在时间分布方面, 冬春季(11月至次年2月)和夏季(6~8月)的阳性率较高。结论福建省禽流感病毒总体阳性率较高, 以H9亚型为主, 应重点加强冬春季和夏季禽流感病毒的监测, 加强对城乡活禽市场的监管力度。

老年与中青年涂阳肺结核临床对比分析

目的通过比较老年人与青少年涂阳肺结核临床特点,意识到诊治老年肺结核所面临的严峻挑战。方法收集福建省疾控中心门诊部2015年7月至2017年11月收治的老年组(60~85岁)初治肺结核病患者115例;中青年组(17~48岁)78例,从痰片涂阳率、痰片转阴率、病灶吸收情况进行回顾分析。结果中青年组和老年组痰片涂阳率痰分别为43.6%、59.1%;治疗2月末和治疗6月末中青年组和老年组痰片转阴率分别为52.9%、30.9%,和91.2%、69.1%;从X线胸片上中青年组和老年组病灶吸收情况分为痊愈、好转、无变化及恶化3种,6个月末中青年组痊愈、好转、无变化及恶化分别为59.0%、37.0%、3.8%;老年组分别为35.0%、53.0%、7.8%,两组除6月末无变化和恶化外,各组差异(P<0.05)有统计学意义。结论老年肺结核比中青年治疗效果差病程长,年龄的差异对肺结核诊治过程起一定的影响作用。

肺结核与肺结核合并糖尿病的临床疗效对比分析

糖尿病和肺结核是常见疾病。中国糖尿病患者的发病数与日俱增，总人数达到1．096亿人，居世界首位，仅2013年至2015年新增病例1120万。而肺结核病合并糖尿病（PPTDM）的发病率、致死率均呈现上升趋势，据统计糖尿病患者并发肺结核的概率是正常人的3～4倍。为了解高血糖对肺结核治疗效果的影响。通过患者痰菌涂阳率以及x线胸片病灶吸收好转情况观察疗效，本次对126例肺结核和PPTDM患者进行了研究，现将结果报道如下。