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基于SLAF-seq技术的红心火龙果SNP位点开发及遗传分析
被引量:
12
1
作者
俞超
陈煜
+2 位作者
汪财生
陈佳怡
金从标
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2017年第4期591-596,共6页
为分析不同品种红心火龙果的遗传关系,本研究采集国内14种红心火龙果品种,通过生物信息学分析进行实验方案的系统设计,将所提取基因组进行酶切,筛选特异长度的DNA片断,构建SLAF-seq文库后进行高通量测序,将获得的序列进行分析比较后得...
为分析不同品种红心火龙果的遗传关系,本研究采集国内14种红心火龙果品种,通过生物信息学分析进行实验方案的系统设计,将所提取基因组进行酶切,筛选特异长度的DNA片断,构建SLAF-seq文库后进行高通量测序,将获得的序列进行分析比较后得到多态SLAF标签,在此标签基础上进一步开发特异性SNP位点,最后建立14种红心火龙果品种的进化树。本研究共开发159 560个SLAF标签,样品的平均测序深度为5.26×;共得到120 294个群体SNP,其中高一致性的群体SNP 51 859个。12种红心火龙果聚类结果发现,样品1、2、6、8、10同缘关系相近;样品3、5、7、9同缘关系相近;样品4、14同缘关系相对较近。研究表明应用SLAF-seq技术开发分子标记的效率比ISSR、RAPD、AFLP等常规技术更高。12种红心火龙果的聚类结果从基因组水平揭示不同地区品种之间的遗传分化关系,为火龙果种质的保护和遗传改良提供参考。
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关键词
红心火龙果
SLAF-seq
SNP位点
遗传分析
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职称材料
不同断根方式对“鄞红”葡萄生长及品质的影响
被引量:
7
2
作者
俞超
章泽焕
+2 位作者
汪财生
马世迎
金从标
《中国南方果树》
北大核心
2015年第3期117-119,共3页
以"鄞红"葡萄为材料,研究移栽和切根两种断根方式对其长势和品质的影响。结果表明,移栽能提高鄞红葡萄根系长度、鲜重和粗度;切根能抑制鄞红葡萄叶面积和新梢茎的生长;两种断根处理后葡萄中可溶性固形物、总糖和花色苷含量上...
以"鄞红"葡萄为材料,研究移栽和切根两种断根方式对其长势和品质的影响。结果表明,移栽能提高鄞红葡萄根系长度、鲜重和粗度;切根能抑制鄞红葡萄叶面积和新梢茎的生长;两种断根处理后葡萄中可溶性固形物、总糖和花色苷含量上升,尤其切根处理促进效果更显著。本试验结果可为控制该品种葡萄的长势,提高其品质提供理论依据。
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关键词
移栽
切根
“鄞红”葡萄
长势
品质
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职称材料
根域限制对“鄞红”葡萄长势及品质的影响
被引量:
4
3
作者
俞超
马世迎
+2 位作者
汪财生
章泽焕
金从标
《现代园艺》
2015年第14期13-14,共2页
以"鄞红"葡萄为材料,研究根域限制对其长势和品质的影响。结果表明,根域限制能明显抑制新梢茎周长、枝节长度、叶面积,降幅最大的是叶面积为50.64%;能促进根系数量、二级三级侧根数,以二极根数增幅最大,为69.24%;能增加果实...
以"鄞红"葡萄为材料,研究根域限制对其长势和品质的影响。结果表明,根域限制能明显抑制新梢茎周长、枝节长度、叶面积,降幅最大的是叶面积为50.64%;能促进根系数量、二级三级侧根数,以二极根数增幅最大,为69.24%;能增加果实可溶性固形物、总糖和花色苷含量,增幅最大是花色苷含量,为26.09%。综上所述,采用根域限制栽培在控制葡萄枝蔓伸展、节间长度、根系平均数量、提高果实品质上具有很好的效果。本试验结果可为该品种葡萄根域限制栽培模式的推广应用提供理论依据。
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关键词
根域限制
“鄞红”葡萄
长势
品质
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职称材料
不同人工授粉方式对红心火龙果品质和产量的影响
被引量:
1
4
作者
陈煜
郭俏
+2 位作者
俞超
金从标
汪财生
《陕西农业科学》
2016年第9期65-66,共2页
以红心火龙果为材料,比较红肉型自花授粉、红肉型异花授粉、白肉型花粉、红白肉混合型花粉、异种红肉型异花授粉五种人工授粉方式对火龙果座果率、产量和品质的影响。结果发现,异种红肉型授粉后,火龙果中可溶性固形物含量最高、果皮厚...
以红心火龙果为材料,比较红肉型自花授粉、红肉型异花授粉、白肉型花粉、红白肉混合型花粉、异种红肉型异花授粉五种人工授粉方式对火龙果座果率、产量和品质的影响。结果发现,异种红肉型授粉后,火龙果中可溶性固形物含量最高、果皮厚度最小、单果重和总产量最高。
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关键词
人工授粉
红心火龙果
品质
产量
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职称材料
火龙果籽白蛋白提取工艺及抗氧化能力研究
被引量:
13
5
作者
陈煜
夏梓堃
+5 位作者
郭俏
汪财生
钱宵晨
李思
袁天虎
金从标
《药物生物技术》
CAS
2017年第4期315-320,共6页
为探索火龙果籽中白蛋白的柠檬酸-柠檬酸钠缓冲溶液提取工艺及抗氧化效果,采用Box-Behnken试验设计优化白蛋白的柠檬酸-柠檬酸钠缓冲液提取工艺,SDS-PAGE检测确认,并评价DPPH·自由基、·OH自由基、O_2^-自由基的清除能力,还原...
为探索火龙果籽中白蛋白的柠檬酸-柠檬酸钠缓冲溶液提取工艺及抗氧化效果,采用Box-Behnken试验设计优化白蛋白的柠檬酸-柠檬酸钠缓冲液提取工艺,SDS-PAGE检测确认,并评价DPPH·自由基、·OH自由基、O_2^-自由基的清除能力,还原力和抗脂质过氧化力。结果表明:火龙果籽中白蛋白最佳提取工艺为料液比为1∶30,pH为7.08,加热温度74.0℃,时间3.0 h,白蛋白提取得率达76.37 mg/g,相对分子质量约13.2 k。火龙果籽白蛋白有较强的抗氧化活性,DPPH·、·OH及O-2IC_(50)分别为5.75,27.11和20.09μg/mL;还原力强,抗脂质过氧化能力弱于对照品BHT。研究结果为火龙果籽应用于保健食品开发提供数据基础。
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关键词
火龙果籽
白蛋白
响应曲面
抗氧化
原文传递
题名
基于SLAF-seq技术的红心火龙果SNP位点开发及遗传分析
被引量:
12
1
作者
俞超
陈煜
汪财生
陈佳怡
金从标
机构
浙江万里学院
宁波绿苑农业开发有限公司
出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2017年第4期591-596,共6页
基金
宁波市农业创新创业项目(No.2015C10027)
文摘
为分析不同品种红心火龙果的遗传关系,本研究采集国内14种红心火龙果品种,通过生物信息学分析进行实验方案的系统设计,将所提取基因组进行酶切,筛选特异长度的DNA片断,构建SLAF-seq文库后进行高通量测序,将获得的序列进行分析比较后得到多态SLAF标签,在此标签基础上进一步开发特异性SNP位点,最后建立14种红心火龙果品种的进化树。本研究共开发159 560个SLAF标签,样品的平均测序深度为5.26×;共得到120 294个群体SNP,其中高一致性的群体SNP 51 859个。12种红心火龙果聚类结果发现,样品1、2、6、8、10同缘关系相近;样品3、5、7、9同缘关系相近;样品4、14同缘关系相对较近。研究表明应用SLAF-seq技术开发分子标记的效率比ISSR、RAPD、AFLP等常规技术更高。12种红心火龙果的聚类结果从基因组水平揭示不同地区品种之间的遗传分化关系,为火龙果种质的保护和遗传改良提供参考。
关键词
红心火龙果
SLAF-seq
SNP位点
遗传分析
Keywords
red pitaya
SLAF-seq
SNP sites
genetic analysis
分类号
S667.9 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
不同断根方式对“鄞红”葡萄生长及品质的影响
被引量:
7
2
作者
俞超
章泽焕
汪财生
马世迎
金从标
机构
浙江万里学院
浙江省宁波绿苑农业开发有限公司
出处
《中国南方果树》
北大核心
2015年第3期117-119,共3页
基金
浙江省宁波市科技局创新创业项目(2013C920014)
浙江省象山县科技局农业科研攻关项目(201301C1011004)资助
文摘
以"鄞红"葡萄为材料,研究移栽和切根两种断根方式对其长势和品质的影响。结果表明,移栽能提高鄞红葡萄根系长度、鲜重和粗度;切根能抑制鄞红葡萄叶面积和新梢茎的生长;两种断根处理后葡萄中可溶性固形物、总糖和花色苷含量上升,尤其切根处理促进效果更显著。本试验结果可为控制该品种葡萄的长势,提高其品质提供理论依据。
关键词
移栽
切根
“鄞红”葡萄
长势
品质
分类号
S663.1 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
根域限制对“鄞红”葡萄长势及品质的影响
被引量:
4
3
作者
俞超
马世迎
汪财生
章泽焕
金从标
机构
浙江省浙江万里学院
浙江省宁波绿苑农业开发有限公司
出处
《现代园艺》
2015年第14期13-14,共2页
基金
宁波市科技局创新创业项目(2013C920014)
象山县科技局农业科研攻关项目(201301C1011004)
文摘
以"鄞红"葡萄为材料,研究根域限制对其长势和品质的影响。结果表明,根域限制能明显抑制新梢茎周长、枝节长度、叶面积,降幅最大的是叶面积为50.64%;能促进根系数量、二级三级侧根数,以二极根数增幅最大,为69.24%;能增加果实可溶性固形物、总糖和花色苷含量,增幅最大是花色苷含量,为26.09%。综上所述,采用根域限制栽培在控制葡萄枝蔓伸展、节间长度、根系平均数量、提高果实品质上具有很好的效果。本试验结果可为该品种葡萄根域限制栽培模式的推广应用提供理论依据。
关键词
根域限制
“鄞红”葡萄
长势
品质
分类号
S663.1 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
不同人工授粉方式对红心火龙果品质和产量的影响
被引量:
1
4
作者
陈煜
郭俏
俞超
金从标
汪财生
机构
浙江万里学院生物与环境学院
宁波绿苑农业开发有限公司
出处
《陕西农业科学》
2016年第9期65-66,共2页
基金
宁波市农业创新创业项目(2015C10027)资助
文摘
以红心火龙果为材料,比较红肉型自花授粉、红肉型异花授粉、白肉型花粉、红白肉混合型花粉、异种红肉型异花授粉五种人工授粉方式对火龙果座果率、产量和品质的影响。结果发现,异种红肉型授粉后,火龙果中可溶性固形物含量最高、果皮厚度最小、单果重和总产量最高。
关键词
人工授粉
红心火龙果
品质
产量
分类号
S667.9 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
火龙果籽白蛋白提取工艺及抗氧化能力研究
被引量:
13
5
作者
陈煜
夏梓堃
郭俏
汪财生
钱宵晨
李思
袁天虎
金从标
机构
浙江万里学院生物与环境学院
宁波绿苑农业开发有限公司
出处
《药物生物技术》
CAS
2017年第4期315-320,共6页
基金
基金项目:红心火龙果品质改良关键技术研究及产业化应用示范(No.SC2011610800010)
文摘
为探索火龙果籽中白蛋白的柠檬酸-柠檬酸钠缓冲溶液提取工艺及抗氧化效果,采用Box-Behnken试验设计优化白蛋白的柠檬酸-柠檬酸钠缓冲液提取工艺,SDS-PAGE检测确认,并评价DPPH·自由基、·OH自由基、O_2^-自由基的清除能力,还原力和抗脂质过氧化力。结果表明:火龙果籽中白蛋白最佳提取工艺为料液比为1∶30,pH为7.08,加热温度74.0℃,时间3.0 h,白蛋白提取得率达76.37 mg/g,相对分子质量约13.2 k。火龙果籽白蛋白有较强的抗氧化活性,DPPH·、·OH及O-2IC_(50)分别为5.75,27.11和20.09μg/mL;还原力强,抗脂质过氧化能力弱于对照品BHT。研究结果为火龙果籽应用于保健食品开发提供数据基础。
关键词
火龙果籽
白蛋白
响应曲面
抗氧化
Keywords
Pitaya seed
Albumin
Response surface
Antioxidant activity
分类号
Q512.1 [生物学—生物化学]
R284.2 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于SLAF-seq技术的红心火龙果SNP位点开发及遗传分析
俞超
陈煜
汪财生
陈佳怡
金从标
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2017
12
下载PDF
职称材料
2
不同断根方式对“鄞红”葡萄生长及品质的影响
俞超
章泽焕
汪财生
马世迎
金从标
《中国南方果树》
北大核心
2015
7
下载PDF
职称材料
3
根域限制对“鄞红”葡萄长势及品质的影响
俞超
马世迎
汪财生
章泽焕
金从标
《现代园艺》
2015
4
下载PDF
职称材料
4
不同人工授粉方式对红心火龙果品质和产量的影响
陈煜
郭俏
俞超
金从标
汪财生
《陕西农业科学》
2016
1
下载PDF
职称材料
5
火龙果籽白蛋白提取工艺及抗氧化能力研究
陈煜
夏梓堃
郭俏
汪财生
钱宵晨
李思
袁天虎
金从标
《药物生物技术》
CAS
2017
13
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