基于生物信息学分析CCND2在甲状腺乳头状癌中的表达及其对免疫浸润的影响

目的探讨凋亡相关基因细胞周期蛋白D2(CCND2)在甲状腺乳头状癌中的表达及其与临床病理的联系。方法通过公共数据库TCGA、TIMER 2.0和UALCAN获取CCND2的表达情况;采用ROC曲线对甲状腺乳头状癌(PTC)组织和癌旁组织进行鉴别;使用基因本体功能注释(GO)对CCND2相关差异基因(DEGs)进行富集分析;使用TIMER数据库和CIBERSORT数据源分析甲状腺癌中CCND2的肿瘤免疫浸润情况;采用RT-qPCR和Western blot检测人甲状腺正常细胞系Nthy-ori-3-1和人甲状腺乳头状癌细胞系TPC-1、BCPAP中CCND2表达量;采用免疫组织化学SABC法检测PTC及癌旁组织中CCND2表达,并探讨其与临床病理的联系。结果TCGA、TIMER2.0、UALCAN分析显示,与癌旁组织相比,CCND2 mRNA在甲状腺癌中高表达(P<0.001),并且与Stage分期、性别、年龄、病理亚型及区域淋巴结受累情况有关(P<0.05);ROC结果显示,截断值为4.983时,CCND2的灵敏度、特异度和准确度分别为83.6%、94.9%和78.5%;GO分析表明CCND2的差异表达与免疫功能有关;TIMER数据库显示,CCND2表达与B细胞、CD4^(+)T细胞、巨噬细胞呈正相关(partial.cor>0,P<0.001),而与CD8^(+)T细胞呈负相关(partial.cor<0,P<0.01)。CIBERSORT数据库显示,CCND2表达与B细胞记忆渗透水平、CD4^(+)T细胞记忆激活状态、M2巨噬细胞表达水平、肥大细胞静息状态和肥大细胞激活状态显著相关(P<0.05)。RT-qPCR及Western blot结果显示,CCND2在细胞系TPC-1、BCPAP中的表达量高于Nthy-ori-3-1(P<0.01)。免疫组织化学结果显示,CCND2在PTC中的阳性表达高于癌旁组织(P<0.05)且与肿瘤大小、淋巴结转移及TNM分期相关(P<0.05)。结论PTC中CCND2表达上调可能与肿瘤进展及免疫细胞浸润密切相关。

甲状腺乳头状癌侧颈淋巴结转移相关因素及构建列线图模型

目的分析甲状腺乳头状癌(PTC)患者发生侧颈淋巴结转移(LLNM)的相关危险因素。方法回顾性分析123例PTC患者的临床资料,根据术后病理证实侧颈淋巴结是否转移进行分组,并对临床病理特点进行分析,包括性别、年龄、多灶性、肿瘤直径、是否腺外侵犯、单双侧癌灶、中央区淋巴结是否转移、T分期、是否脉管浸润、被膜侵犯、肌肉侵犯。结果年龄、肿瘤直径、中央区淋巴结转移(CLNM)是PTC患者发生LLNM的独立危险因素(P<0.05)。对列线图进行内部验证C指数为0.916,95%置信区间0.838~0.993。校正曲线表明模型具有良好一致性,决策曲线(DCA)及临床影响曲线(CIC)表明,该列线图模型有良好的临床实用性。结论年龄、肿瘤直径、CLNM是PTC发生LLNM的独立危险因素。列线图模型可以预测PTC患者发生LLNM的风险为临床提供指导。

细胞凋亡相关基因CD44在甲状腺癌组织中的表达及其与肿瘤侵袭和免疫细胞浸润关系的生物信息学分析

目的:通过生物信息学方法探讨细胞凋亡相关基因(ARGs)透明质酸受体蛋白CD44在甲状腺癌(THCA)组织中表达及其与患者临床病理特征和肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)的关系,为THCA的诊断和治疗提供新的研究方向。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获得THCA凋亡相关的差异表达基因(DEGs)表达谱,选取表达上调的CD44基因,分析THCA组织和癌旁组织中CD44 mRNA表达水平;采用受试者工作特征(ROC)曲线对THCA组织与癌旁组织进行鉴别;采用基因本体功能注释(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因集富集分析(GSEA)对DEGs进行功能及通路富集分析;采用STRING数据库建立蛋白-蛋白互作(PPI)网络,通过Cytoscape软件进行可视化;采用TIMER数据库分析THCA组织中CD44 mRNA表达和TILs浸润丰度之间的相关性;使用R语言分析CD44蛋白表达与免疫检查点的关系。选取110例THCA患者标本,采用免疫组织化学SABC法检测THCA组织及相对应的癌旁组织中CD44蛋白表达情况。结果:TCGA数据库分析,与癌旁组织比较,THCA组织中CD44 mRNA表达水平明显升高(P<0.05);ROC曲线分析,在临界值为6.855时,CD44的灵敏度、特异度和准确性分别为89.71%、75.13%和72.91%;GO和KEGG分析,DEGs主要富集在凋亡相关通路;GSEA分析,DEGs与中性粒细胞脱颗粒反应有关;TIMER数据库分析,THCA组织中CD44 mRNA表达水平与B细胞、巨噬细胞、CD4+T淋巴细胞、树突状细胞和中性粒细胞浸润丰度呈正相关关系(partial. cor>0,P<0.01),与肿瘤纯度和CD8+T淋巴细胞浸润丰度无关(partial. cor≤0,P<0.01);在THCA组织中CD44蛋白表达水平与9个免疫检查点基因呈正相关关系(P<0.01),与1个免疫检查点基因呈负相关关系(P<0.01);免疫组织化学SABC法检测,THCA组织中CD44蛋白阳性表达率高于癌旁组织(P<0.01);THCA组织中CD44蛋白表达与肿瘤直径和淋巴结转移有关(P<0.05),与患者性别、年龄和腺外侵犯无关(P>0.05)。结论:CD44在THCA组织中高表达可能与肿瘤的进展及肿瘤的多种免疫反应有关。

高中数学解题方法与教学分析

高中数学教学内容繁多,每年高考的数学题型也各不相同,所以导致了高中数学题的解题方法多种多样.于是,学生对解题方法运用的熟练程度与解题时方法选择的合理性就直接关系到了学生的解题效率.只有好的解题教学,才能让学生更加充分地理解到解题方法所用的思想与各种方法的适用题型,让学生在解题过程中活跃地使用解题方法,避免机械地套用公式,使学生对问题的解决更有自信,对数学的学习更加热爱.由此,本文对高中数学解题方法的教学进行了探讨,并综合了几种解题方法进行了案例分析.

“智慧课堂”背景下提升高中学生数学核心素养的教学模式研究

教学是高中教育教学过程中的一门核心科目,对于学生各方面能力的要求也比较高。在“智慧课堂”的背景下,提升高中学生的核心素养变得越来越重要,同时也成为高中教师需要着手解决的问题。本文从“智慧课堂”背景下提升高中学生数学核心素养的角度出发,提出了一些实践应用策略。