极端嗜盐古生菌(Natrinema sp.)R6-5胞外嗜盐蛋白酶的纯化和性质研究

采用bacitracin-Sepharose 4B亲和层析的方法得到凝胶电泳均一的来自极端嗜盐古生菌(Natrinema sp.)R6-5的胞外嗜盐蛋白酶。经SDS-PAGE分析该酶亚基分子量为62kDa。PMSF对它的活性完全抑制,表明它是一种丝氨酸蛋白酶,该酶反应的最适NaCl浓度为3mol/L,最适温度为45℃,最适pH值为8.0。在高盐条件下能维持高活性并十分稳定,具有重要的潜在应用价值。

糖尿病肾病早期生化诊断指标临床分析

目的探究生化检测指标对糖尿病肾病早期诊断的临床价值。方法选取糖尿病肾病患者60例作为观察组,60例体检健康者作为对照组。对两组研究对象进行血肌酐(SCr)、血尿素氮(BUN)、视黄醇结合蛋白(RBP)、血胱抑素C(CysC)、C反应蛋白(CRP)检测。结果观察组各项生化指标明显高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。5项目生化指标联合检测的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值和受试者工作特征曲线下面积均明显高于单项生化指标检测。结论联合检测SCr、BUN、RBP、CysC及CRP对糖尿病肾病的早期诊断有重要的指导和参考价值。

数据不依赖获取的质谱数据的深度学习分析方法

近年来,数据不依赖获取(data-independent acquisition,DIA)质谱技术在蛋白质组学领域内被广泛关注.然而DIA质谱数据具有维度高、背景噪声大、多种信号混合等特点,这使得DIA质谱数据的分析成为一大挑战.本文提出一种基于深度学习的可直接处理DIA质谱数据的算法:Ultra-DIA.该算法使用深度变分自动编码器提取离子信号的特征来区分不同肽段产生的子离子,最终生成虚拟谱图,进而对肽段和蛋白进行定性和定量分析.对于测试数据,该算法找到的肽段数量和蛋白数量比主流算法DIA-Umpire分别多61.4%和64.5%.此外,相较于DIA-Umpire,该算法能够找到更多低浓度的蛋白.