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绿萝叶腐病病原菌16S rDNA序列的克隆与分析
1
作者
邬张颖
徐凡舒
+4 位作者
钟依妮
马佳莹
朱欣
张慧娟
蒋明
《贵州农业科学》
CAS
2020年第1期99-103,共5页
为绿萝叶腐病病原菌菌株LR12的分子鉴定和应用研究提供参考,利用PCR法克隆其16S序列,并借助生物信息学方法进行分析,明确其16S rDNA序列特征。结果表明:以YFUP/YFDN为PCR引物,扩增到大小约为1700 bp的条带;LR12的16S rDNA全长为1551 bp...
为绿萝叶腐病病原菌菌株LR12的分子鉴定和应用研究提供参考,利用PCR法克隆其16S序列,并借助生物信息学方法进行分析,明确其16S rDNA序列特征。结果表明:以YFUP/YFDN为PCR引物,扩增到大小约为1700 bp的条带;LR12的16S rDNA全长为1551 bp,GC为53.9%;LR12与胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种的16S rDNA相似性最高,达100%,与巴西亚种的相似性次之,为99.9%,两者存在2个碱基的差异;15种细菌在发育树上可分为5组,其中LR12与胡萝卜软腐果胶杆菌巴西亚种的关系最近,处于同一分支,支持率达100%,并与其他2种果胶杆菌属细菌聚在同一组。
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关键词
绿萝
叶腐病病原菌
菌株LR12
胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种
16S
rDNA
克隆
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职称材料
题名
绿萝叶腐病病原菌16S rDNA序列的克隆与分析
1
作者
邬张颖
徐凡舒
钟依妮
马佳莹
朱欣
张慧娟
蒋明
机构
台州学院生命科学学院
出处
《贵州农业科学》
CAS
2020年第1期99-103,共5页
基金
2018年度台州市大学生科技创新项目“绿萝叶腐病病原菌的分子鉴定”
文摘
为绿萝叶腐病病原菌菌株LR12的分子鉴定和应用研究提供参考,利用PCR法克隆其16S序列,并借助生物信息学方法进行分析,明确其16S rDNA序列特征。结果表明:以YFUP/YFDN为PCR引物,扩增到大小约为1700 bp的条带;LR12的16S rDNA全长为1551 bp,GC为53.9%;LR12与胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种的16S rDNA相似性最高,达100%,与巴西亚种的相似性次之,为99.9%,两者存在2个碱基的差异;15种细菌在发育树上可分为5组,其中LR12与胡萝卜软腐果胶杆菌巴西亚种的关系最近,处于同一分支,支持率达100%,并与其他2种果胶杆菌属细菌聚在同一组。
关键词
绿萝
叶腐病病原菌
菌株LR12
胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种
16S
rDNA
克隆
Keywords
Epipremnum aureum
pathogen causing leaf rot
strain LR12
P.carotovorum subsp.carotovorum
16S rDNA
cloning
分类号
S154.3 [农业科学—土壤学]
S636.2 [农业科学—蔬菜学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
绿萝叶腐病病原菌16S rDNA序列的克隆与分析
邬张颖
徐凡舒
钟依妮
马佳莹
朱欣
张慧娟
蒋明
《贵州农业科学》
CAS
2020
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