瘢痕疙瘩发病机制中的脂代谢相关基因:基于生物信息学分析和验证

目的基于生物信息学方法探讨瘢痕疙瘩发生发展的脂代谢相关基因。方法从GEO数据库获取瘢痕疙瘩相关数据集,从Genecards数据库下载脂代谢相关基因,进行交集分析筛选出共同基因;对差异基因进行GO、KEGG富集分析;使用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和免疫组化验证显著差异基因。结果瘢痕疙瘩中脂代谢相关差异基因共有2个共同基因ACSS3和PRKD1,其中ACSS3差异最显著。差异基因的生物过程主要富集在甘油酯生物合成过程和脂肪酸衍生物代谢过程等。KEGG主要富集在甘油酯代谢过程和花生四烯酸代谢过程等。qRT-PCR和免疫组化显示ACSS3在瘢痕疙瘩组织中高表达。结论ACSS3可能通过影响脂代谢在瘢痕疙瘩发生发展中发挥重要作用。

5-氨基酮戊酸光动力疗法治疗尖锐湿疣的免疫机制研究进展

尖锐湿疣(CA)是一种由人乳头瘤病毒(HPV)感染引起的常见的性传播疾病。5-氨基酮戊酸光动力疗法(5-ALA-PDT)是近年来治疗CA的一种安全有效的疗法。目前认为PDT能够诱导机体免疫应答,但是其具体机制不明。该文就5-ALA-PDT治疗CA的免疫机制相关研究进展作一综述,以期为日后研究相关机制及其临床应用提供参考。

烟酰胺-N-甲基转移酶在胃癌中高表达并与预后负相关:基于生物信息物信息学方法

目的探讨烟酰胺-N-甲基转移酶(NNMT)在胃癌中的表达、生物学功能和临床病理学意义。方法运用公共数据库GEO、Oncomine及TCGA分析筛选与胃癌分型和临床预后相关的基因;利用STRING、GSEA、DAVID、Cytoscape等软件分析预测与候选基因相关的分子通路,构建蛋白质相互作用关系网络;通过q RT-PCR分析候选基因在28例胃癌和配对癌旁组织中m RNA的差异表达;CCK8增殖实验、平板克隆形成实验、划痕愈合实验、Transwell小室细胞运动实验等分析NNMT表达对胃癌细胞增殖、侵袭和迁移能力的影响。结果NNMT在多个数据库分析中呈高表达且与胃癌预后负相关;通路分析显示,NNMT高表达与细胞外基质受体和细胞黏附分子等细胞粘附相关通路以及细胞因子受体等分子通路相关;而NNMT低表达可能与碱基错配修复和核黄素代谢等生物过程相关。蛋白相互作用分析显示,NNMT可能与AURKA等16个差异表达的蛋白存在相互作用关系,且与TAGLN、PTRF、AKAP12、IGF2BP2蛋白存在较高的共表达趋势。在临床组织标本中,q RT-PCR结果显示,胃癌组织中NNMTm RNA的表达明显高于癌旁组织(P<0.05)。在胃癌细胞系中,NNMT的过表达可显著促进细胞增殖、侵袭和迁移,而NNMT敲除可对细胞增殖、侵袭和迁移产生明显的抑制作用。结论NNMT在胃癌中异常高表达并促进胃癌细胞的增殖、侵袭和转移;NNMT高水平表达与胃癌患者预后呈负相关,提示NNMT可能为胃癌预后相关分子。