基于多数据库分析CPT2在肾透明细胞癌中的表达及临床意义

目的:研究肉碱棕榈酰基转移酶Ⅱ基因(CPT2)在肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)中的表达情况,探讨其表达差异与临床病理特征及预后生存的关系。方法:计算机检索Oncomine数据库、GEPIA平台、Human Protein Atlas和TCGA数据库中关于CPT2在肾ccRCC中表达的相关文献,检索时限为建库至2023年9月20日。分析CPT2在ccRCC中的表达,并研究表达量与患者临床病理参数及预后的关系。结果:CPT2在肝脏正常组织中的表达量最高,在肾脏中居第3位,在肾癌中的表达量位于各种肿瘤组织的第3位。Oncomine数据库中,CPT2表达差异结果有意义的研究共有232项。CPT2在ccRCC中的表达量低,其表达量与ccRCC患者的性别、肿瘤分期、肿瘤分化程度、T分期、远处转移相关(P<0.05)。CPT2表达量与肾透明细胞癌患者总生存率有关(Logrank P=1.9×10^(-13))。结论:CPT2在不同癌症中的表达情况不一,在ccRCC中呈低表达,其低表达与ccRCC部分恶性表型相关,且与患者总体生存率低有关。

基于数据挖掘分析FAM134B在肝癌中的表达及其与预后的关系

目的研究FAM134B在肝癌组织中的表达情况,探讨其表达差异与临床病理特征以及预后生存的关系。方法挖掘Oncomine、Human Protein Atlas、TCGA和Kaplan Meier-Plotter数据库,分析FAM134B在肝癌组织中的表达,并对表达量与临床病理特征以及预后生存的关系进行探讨。计数资料组间比较采用χ^2检验。FAM134B表达与肝癌预后的关系采用Kaplan-Meier模型分析。结果正常组织中,FAM134B在肾脏中表达量最高,肝脏居第9位,肿瘤组织中,其在肾癌组织表达最高,肝癌第11位。共147项有关FAM134B表达差异的研究结果差异具有统计学意义,各种癌症中其表达差异不一致。其在肝癌组织中表达量较正常肝组织中低。FAM134B蛋白定位于内质网,其表达量与肝癌患者发病年龄、肝硬化、AFP、人种、分化程度有相关性(P值均<0.05)。FAM134B表达量与肝癌患者总生存率有关[风险比(HR)=0.67,95%可信区间(95%CI):0.47~0.95,P=0.026],且对亚洲人种预后有显著影响(HR=0.40,95%CI:0.22~0.74,P=0.003),但对白色人种影响不显著(HR=0.65,95%CI:0.40~1.05,P=0.076)。结论FAM134B在不同癌症中表达不一致,在肝癌中低表达,蛋白定位于内质网,其低表达与肝癌部分恶性表型相关,且与患者总体生存率低有关。

FAM96A在结肠癌组织中的表达差异及其对结肠癌细胞增殖和凋亡的影响

目的观察FAM96A在60例结肠癌组织中的表达,分析其表达差异与结肠癌生物学特征的关系,并探讨FAM96A对结肠癌细胞系HCT116细胞增殖及凋亡的影响。方法采用实时荧光定量聚合酶链反应(Real-time PCR)和Western blot法检测FAM96A蛋白在60例结肠癌组织及配对癌旁组织中的表达,并统计分析FAM96A蛋白表达差异与结肠癌临床病理特征之间的相关性。采用脂质体转染法将含人FAM96A全长序列的pc DNA3.1-myc-FAM96A重组质粒转染至HCT116细胞中,分别采用MTT法及流式细胞技术检测FAM96A过表达对HCT116增殖和凋亡的影响。结果Western blot结果显示FAM96A蛋白在癌旁组织中的表达水平显著高于结肠癌组织(t=16.328,P<0.05)。FAM96A蛋白表达差异与本研究中60例结肠癌患者的淋巴结转移、浸润深度、TNM分期及是否发生远处转移之间差异有统计学意义(P<0.05),与患者性别、年龄、肿瘤大小及分化程度之间差异无统计学意义(P>0.05)。MTT法及流式细胞技术检测结果显示:FAM96A组吸光度(A)值显著低于对照组(P<0.05)。FAM96A组的细胞凋亡率高于对照组(t=30.015,P<0.05)。结论 FAM96A在人结肠癌组织中表达显著下降,其表达水平与结肠癌的发生发展、侵袭转移密切相关。过表达FAM96A可抑制结肠癌细胞增殖且诱导其凋亡。

基于多数据库分析FAM83C在胃癌中的表达及临床意义

目的胃癌的发生发展机制尚不明确。文中探讨FAM83C在胃癌组织中的表达情况,分析其表达差异与临床病理特征及预后的关系,并进一步探讨FAM83C在胃癌中的突变位点及甲基化情况。方法从TCGA数据库、Oncomine数据库中对FAM83C进行数据挖掘,分析FAM83C在胃癌及其他多类癌种中的表达情况;运用LinkedOmics数据库分析FAM83C表达量与胃癌临床病例特征的关系;运用Kaplan-Meier Plotter数据库分析FAM83C表达量与胃癌患者预后关系;运用cBioportal数据库、MethHC数据库分析FAM83C在胃癌中的突变位点及甲基化情况;运用String数据库分析与FAM83C相互作用的蛋白网络。结果Oncomine数据库中56项有关FAM83C表达差异的研究具有统计学意义(P<0.05),其中46项研究提示FAM83C在多种癌组织中高表达,且FAM83C在胃癌中的高表达具有统计学意义(P=0.000733)。同时,分析TCGA数据库中637个胃癌样本,结果显示FAM83C在各种组织类型的胃癌中均呈现高表达(P<0.05)。FAM83C表达量与患者年龄(P=0.0344)、T分期(P=0.034)的差异具有统计学意义(P<0.05)。FAM83C高表达组生存时间更短,预后更差,差异具有统计学意义(P=0.0071)。FAM83C在胃癌中的突变包括错义突变、框移突变、剪接突变3种类型。胃癌中FAM83C基因启动子区甲基化水平较正常胃组织显著升高(P<0.005)。与FAM83C相互作用的蛋白包括SLCO5A1、AKR7A3、MMP24、EIF6、ARL11等,并可能共同参与细胞功能过程。结论FAM83C在胃癌中呈现高表达;且FAM83C表达水平与胃癌恶性程度及不良预后具有一定相关性,在一定程度上表现为癌基因的特性,有望成为胃癌临床诊疗的新靶点。

FAM134B在肝癌组织中的表达及其与临床病理特征的关系

目的检测42例肝癌组织中134序列相似的家庭成员B(FAM134B)的表达水平,结合临床病例资料分析FAM134B表达量与肝癌患者临床病理特征的关系。方法收集接受手术治疗的42例肝癌患者的组织标本及临床病例资料。标本包括切除的肝癌组织和配对的癌旁肝组织,均经本院病理科病理组织学确诊。分别采用免疫组化(IHC)、荧光定量聚合酶链反应(Real-time PCR)及免疫印迹(Western blot)检测FAM134B在肝癌组织和细胞中的表达量,并分析FAM134B表达量与肝癌患者临床病理特征的关系。结果免疫组化检测结果显示FAM134B在肝癌组织及癌旁组织阳性表达率分别为83%(35/42)和33%(14/42),差异有统计学意义(χ^2=12.343,P<0.05)。Real-time PCR检测结果显示FAM134B在肝癌组织中的mRNA表达高于癌旁组织(P<0.05)。并且FAM134B在HepG2细胞中的mRNA表达高于L02细胞(P<0.05)。Western blot检测结果显示:与癌旁组织比较,FAM134B在肝癌组织中高表达,与L02细胞相比,FAM134B在HepG2细胞中高表达。且FAM134B蛋白表达量与肿瘤大小、血清甲胎蛋白(AFP)、门静脉癌栓、肝外转移、邻近器官侵犯和分化程度显著相关性(P<0.05),即FAM134B表达量增高时,肿瘤更大、AFP更高、邻近器官侵犯更多、分化程度更低。然而与性别、年龄、乙肝、肝硬化、淋巴结侵犯无明显相关(P>0.05)。结论 FAM134B在肝癌中高表达,可能在肝癌的发生发展、侵袭转移中发挥作用。

基于数据挖掘分析FAM96B在肝癌中的表达及预后情况

目的研究96序列相似的家庭成员B(family with sequence similarity 96,member B,FAM96B)在肝癌组织中的表达情况,探讨其表达差异与生存预后之间的关系。方法挖掘Oncomine、HPA和Kaplan Meier-Plotter数据库,分析FAM96B在肝癌组织中的表达,并对表达量与生存预后的关系进行探讨。结果FAM96B核酸表达量有统计学差异的研究共164项,其在多种肿瘤中均有表达,表达情况不一致,在结肠癌组织中表达量最高。于20种癌组织中检测FAM96B蛋白,类癌中检出强度最高,肝癌处第十一位。荟萃分析1039个样本发现FAM96B在肝癌组织中表达量较正常组织低。免疫组织化学提示,FAM96B蛋白定位于胞质及核液,且在肝癌中较正常肝组织表达量低。对384例患者生存分析提示,FAM96B的表达量与患者总体生存率无显著相关性。FAM96B表达量对白色人种肝癌患者预后不存在显著影响,但对亚洲人种预后的影响显著。结论FAM96B基因在各种癌症中的表达情况各异,表现出不同的生物学特性,其在肝癌组织中总体呈现低表达。虽然其表达量的高低对肝癌患者整体的预后无影响,但在亚洲人种患者中,FAM96B表达量低的肝癌患者,总体生存时间更短。

达芬奇机器人与腹腔镜下袖状胃切除术治疗肥胖症的疗效比较

目的对比分析达芬奇机器人与腹腔镜下袖状胃切除术治疗肥胖症的临床疗效。方法回顾性分析2016-01/2018-06月作者医院普通外科接受袖状胃切除术治疗肥胖症患者的临床资料。其中达芬奇手术机器人系统进行袖状胃切除术20例(达芬奇组),腹腔镜袖状胃切除术22例(腹腔镜组),患者手术均由同一手术团队完成。统计患者术前一般资料、术后恢复情况以及减重效果等资料。采用门诊、住院、网络通讯、电话联系等方式进行随访,随访时间为术后3个月、6个月、1年,1年后每年随访1次直至终身。结果所有患者手术均顺利完成,无病例中转开腹。与腹腔镜组相比,达芬奇组患者手术时间长[(2.14±0.25)h vs.(2.70±0.29)h,t=4.905,P=0.000]、术中出血量少[(76.00±25.47)ml vs.(54.17±14.43)ml,t=-2.407,P=0.031]、术后肛门排气早[(2.40±0.84)d vs.(1.33±0.65)d,t=-3.349,P=0.003]、术后住院时间短[(8.40±1.08)d vs.(7.33±0.99)d,t=-2.427,P=0.025]、住院总花费高[(6.79±0.37)万元vs.(10.50±0.51)万元,t=19.089,P=0.000],差异均有统计学意义。两组患者术后均无胃瘫、消化道狭窄、胃腔内出血、胃漏等严重并发症和围手术期死亡。术后顺利随访所有患者,两组患者体质量、体质量指数(body mass index,BMI)、腰围、臀围、腰臀比指标随时间推移均显著下降,多余体质量减少率(percentage of excess weight loss,EWL)随时间推移显著增加,减重效果显著。组间对比体质量(F=0.694,P=0.415)、EWL(F=0.713,P=0.409)、BMI(F=0.027,P=0.870)、腰围(F=0.063,P=0.804)、臀围(F=2.253,P=0.149)、腰臀比(F=1.249,P=0.277)均无统计学差异。各指标组别与时间交互作用均无统计学差异(P均>0.05)。结论达芬奇机器人系统进行袖状胃切除手术安全可行,具有术中出血量少、胃肠道功能恢复快、术后住院时间短等优点,同时可取得与腹腔镜袖状胃切除术相同的减重效果。

溶质载体家族41成员A3在胃癌组织的表达及其对胃癌细胞侵袭转移的影响

目的探究溶质载体家族41成员A3(SLC41A3)在胃癌(GC)组织的表达、临床预后价值以及其对肿瘤细胞侵袭和迁移能力的影响。方法利用在线生物信息学数据库Oncomine、UALCAN和Kaplan-Meier Plotter探究SLC41A3 mRNA在GC组织中的表达及其与患者预后的关系;然后, 分别利用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)和免疫组织化学(IHC)检测96例临床GC组织中SLC41A3 mRNA和蛋白的表达水平, 并进一步分析SLC41A3蛋白表达水平与患者临床病理学特征和预后的相关性;最后, 检测SLC41A3 mRNA在GC细胞中的表达水平及其对肿瘤细胞侵袭和迁移能力的影响。计量资料采用t检验, 计数资料采用χ^(2)检验, 生存分析采用Log-rank检验和Cox单因素和多因素回归分析。结果 Oncomine数据库分析显示SLC41A3 mRNA在GC组织中的表达量显著高于正常胃组织(DErrico:t=4.147, P<0.01;Cho:t=2.420, P<0.05;Chen:t=1.687, P<0.05)。UALCAN分析结果分析, SLC41A3 mRNA在GC中的表达与肿瘤分级、N分期和TNM分期相关(均P<0.05)。Kaplan-Meier Plotter数据库显示, SLC41A3 mRNA高表达组的GC患者的总生存期(OS)明显短于低表达组[219175t:风险比(HR)=1.86(1.53~2.27), Log-rankP<0.01;224931t:HR=1.67(1.33~2.10), Log-rankP<0.01]。RT-qPCR和IHC结果证实, GC临床样本中SLC41A3 mRNA和蛋白的表达水平明显高于对应的癌旁组[RT-qPCR:3.768±0.196比1.397±0.089, t=11.000, P<0.01;IHC:(7.150±0.137)分比(3.910±0.083)分, t=20.210, P<0.01], 且SLC41A3蛋白在GC中的表达与组织学分级(χ^(2)=7.055, P<0.01)、T分期(χ^(2)=4.018, P<0.05)、N分期(χ^(2)=5.888, P<0.05)、TNM分期(χ^(2)=8.114, P<0.01)、脉管侵犯(χ^(2)=4.444, P<0.05)、神经侵犯(χ^(2)=6.160, P<0.05)明显相关。进一步, Kaplan-Meier分析结果表明, 与SLC41A3蛋白低表达比较, 高表达组GC患者5年生存率明显低于低表达组(31.7%比61.1%, Log-rankP<0.01)。Cox多因素回归分析结果表明, SLC41A3蛋白高表达是影响GC患者OS的独立危险因素[HR=1.984, 95%可信区间(CI):1.102~3.436, P<0.05]。体外细胞实验结果表明, SLC41A3在GC细胞中的表达明显高于正常胃上皮细胞, 过表达SLC41A3显著增强胃癌细胞的侵袭和迁移能力。结论 SLC41A3高表达与GC的恶性进展和患者的不良预后密切相关。