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中华鹅膏菌菌株WPAS01的基因组特性及气味物质分析
被引量:
1
1
作者
钟馨林
钟欣仪
+2 位作者
林
隆基
李岳峰
邓优锦
《中国食用菌》
2022年第8期43-49,共7页
中华鹅膏菌是一种具有独特气味且味道鲜美的野生食用菌。从福建武平县采集了一株中华鹅膏菌菌株WPAS01,通过ITS序列进行分子水平的种属鉴定,利用Illumina测序分析基因组特征,结合气相色谱质谱联用(GC-MS)和基因组序列解析其挥发性成分...
中华鹅膏菌是一种具有独特气味且味道鲜美的野生食用菌。从福建武平县采集了一株中华鹅膏菌菌株WPAS01,通过ITS序列进行分子水平的种属鉴定,利用Illumina测序分析基因组特征,结合气相色谱质谱联用(GC-MS)和基因组序列解析其挥发性成分的主要成分及合成途径。结果表明,WPAS01菌株属于中华鹅膏菌的D分支,与源自福建漳平的HKAS100492菌株亲缘关系最近,单倍体基因组为47.54 Mb,杂合率为2.02%;从成熟子实体中检测出135种挥发性成分,其中15种在7种常见食用菌中也存在;其基因组中预测到所有莽草酸途径和艾氏通路合成苯乙醛的关键基因。
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关键词
中华鹅膏菌
挥发性成分
生物合成途径
种属鉴定
基因组测序
下载PDF
职称材料
银耳栽培菌株的线粒体内含子多态性分析
2
作者
林
隆基
黄海辰
+5 位作者
钟馨林
李岳峰
钟长科
谢宝贵
明瑞光
邓优锦
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2022年第1期1-11,共11页
为从线粒体角度了解银耳(Tremella fuciformis)主要栽培菌株的遗传多样性,从37个银耳栽培菌株中选取33、34和37号3个典型菌株进行高通量基因组测序,并进行线粒体基因组组装和分析,结果表明:3个菌株的线粒体基因组序列一致,但就线粒体基...
为从线粒体角度了解银耳(Tremella fuciformis)主要栽培菌株的遗传多样性,从37个银耳栽培菌株中选取33、34和37号3个典型菌株进行高通量基因组测序,并进行线粒体基因组组装和分析,结果表明:3个菌株的线粒体基因组序列一致,但就线粒体基因组拷贝数而言,33号显著高于34号、37号。选取37号菌株线粒体基因组与已公布的7个野生菌株进行内含子多态性分析,发现它们内含子数量和插入位点各不相同,存在丰富的多态性。针对37号菌株特异内含子及周边序列设计8对引物,通过PCR扩增分析栽培菌株的多样性,结果表明:这8对引物在36个栽培菌株中均扩增出一条长度一致的条带,其长度与37号菌株的预测长度相同,说明36个菌株均含有与37号菌株相同的内含子。
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关键词
银耳
线粒体基因组
内含子
多态性分析
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职称材料
题名
中华鹅膏菌菌株WPAS01的基因组特性及气味物质分析
被引量:
1
1
作者
钟馨林
钟欣仪
林
隆基
李岳峰
邓优锦
机构
福建农林大学林学院
福建农林大学生命科学学院
出处
《中国食用菌》
2022年第8期43-49,共7页
基金
国家自然科学基金(31670021)
福建省中央引导地方科技发展资金项目(2021L3006)。
文摘
中华鹅膏菌是一种具有独特气味且味道鲜美的野生食用菌。从福建武平县采集了一株中华鹅膏菌菌株WPAS01,通过ITS序列进行分子水平的种属鉴定,利用Illumina测序分析基因组特征,结合气相色谱质谱联用(GC-MS)和基因组序列解析其挥发性成分的主要成分及合成途径。结果表明,WPAS01菌株属于中华鹅膏菌的D分支,与源自福建漳平的HKAS100492菌株亲缘关系最近,单倍体基因组为47.54 Mb,杂合率为2.02%;从成熟子实体中检测出135种挥发性成分,其中15种在7种常见食用菌中也存在;其基因组中预测到所有莽草酸途径和艾氏通路合成苯乙醛的关键基因。
关键词
中华鹅膏菌
挥发性成分
生物合成途径
种属鉴定
基因组测序
Keywords
Amanita sinensis
volatile components
biosynthesis pathway
species identification
genome sequencing
分类号
S646.1 [农业科学—蔬菜学]
下载PDF
职称材料
题名
银耳栽培菌株的线粒体内含子多态性分析
2
作者
林
隆基
黄海辰
钟馨林
李岳峰
钟长科
谢宝贵
明瑞光
邓优锦
机构
福建农林大学生命科学学院
福建农林大学林学院
古田县农业局
福建农林大学基因组与生物技术研究中心
出处
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2022年第1期1-11,共11页
基金
福建省中央引导地方科技发展资金(2021L3006)
国家自然科学基金(31670021)。
文摘
为从线粒体角度了解银耳(Tremella fuciformis)主要栽培菌株的遗传多样性,从37个银耳栽培菌株中选取33、34和37号3个典型菌株进行高通量基因组测序,并进行线粒体基因组组装和分析,结果表明:3个菌株的线粒体基因组序列一致,但就线粒体基因组拷贝数而言,33号显著高于34号、37号。选取37号菌株线粒体基因组与已公布的7个野生菌株进行内含子多态性分析,发现它们内含子数量和插入位点各不相同,存在丰富的多态性。针对37号菌株特异内含子及周边序列设计8对引物,通过PCR扩增分析栽培菌株的多样性,结果表明:这8对引物在36个栽培菌株中均扩增出一条长度一致的条带,其长度与37号菌株的预测长度相同,说明36个菌株均含有与37号菌株相同的内含子。
关键词
银耳
线粒体基因组
内含子
多态性分析
Keywords
Tremella fuciformis
mitochondrial genome
intron
polymorphism analysis
分类号
S567.34 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中华鹅膏菌菌株WPAS01的基因组特性及气味物质分析
钟馨林
钟欣仪
林
隆基
李岳峰
邓优锦
《中国食用菌》
2022
1
下载PDF
职称材料
2
银耳栽培菌株的线粒体内含子多态性分析
林
隆基
黄海辰
钟馨林
李岳峰
钟长科
谢宝贵
明瑞光
邓优锦
《食用菌学报》
CSCD
北大核心
2022
0
下载PDF
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