耳聋相关基因COCH的非同义单核苷酸多态性致聋表型预测

群体凝血因子C同源物基因(Coagulation factor C homology,COCH)是人类发现的第一个伴前庭功能障碍的耳聋基因,位于人类染色体14q12-q13上。迄今,在COCH基因上发现16个位点突变导致常染色体显性遗传非综合征型耳聋DFNA9的发生,其中包括13个非同义单核苷酸多态性(Non-synonymous single nucleotide polymorphisms,ns SNPs)位点。由于该基因其他ns SNPs的基因型与表型关系尚不清楚,因此文章采用生物信息学方法,从COCH基因全部的SNPs中分级筛选,结合已知的致病ns SNPs信息及蛋白三维结构验证,首次预测出由COCH基因编码的cochlin蛋白的v WFA(Von Willebrand factor type A domain)区的8个高风险致病性ns SNPs(I176T、R180Q、G265E、V269L、I368N、I372T、R416C和Y424D)。同时,对位于LCCL(Limulus factor C,cochlin,and late gestation lung protein Lgl1)区域的6个已知致病突变的ns SNPs(P51S、G87W、I109N、I109T、W117R和F121S)进行了三维结构模拟,发现突变体均发生了环状结构或链状结构的改变。本研究对COCH基因的基因型与表型的相关性研究为遗传性耳聋筛查提供了相应的理论依据,也对该基因所编码的cochlin蛋白的功能研究具有一定的指导意义。

SLC26A4基因频发致聋突变的种族差异及其分子结构分析

目的 ：SLC26A4基因是导致遗传性耳聋的第二个常见致病基因,在已知耳聋患者中SLC26A4基因突变至少有170种。然而不同地区的耳聋人群突变热点各异,更无SLC26A4致聋性频发突变频率的相关报道,因此本研究对致聋基因SLC26A4频发突变的种族差异及其分子结构进行了深入探讨。方法：依据公共数据库,系统收集1997-2014年全球SLC26A4与耳聋相关的文献报道662篇,基于NEWCASTLE OTTAWA（NOS）标准筛选出31篇文献纳入研究,采用STATA11.2和Rev Man 5.1软件进行了Meta分析,并结合Swiss Model软件对SLC26A4频发致聋突变而导致的蛋白分子结构变异进行比较分析。结果：1发现SLC26A4突变增加耳聋发病风险（OR=39.73,95%CI：21.36-73.90,P〈0.001）;2 SLC26A4突变在亚洲人群中有显著异质性,而欧美地区则无异质性;3鉴定出SLC26A4基因6种高频致聋突变（p.V138F、p.G209V、c.IVS7-2A〉G、c.IVS8＋1G〉A、p.T416P和p.H723R）,并通过蛋白质分子结构模拟发现突变后有意义的结构改变。结论 ：本研究为SCL26A4致聋突变在不同地区耳聋人群中的遗传学效应研究奠定了基础。

利用潜在生物物证显现系统检出DNA 2例

1案例资料1.1案情简况【案例1】王某将汽车停在某停车场,晚上去开车的时候发现车内钱包里的2 000元人民币被盗,钱包被翻动。【案例2】姜某因鱼塘租赁与人发生纠纷,后姜某经鉴定为脾脏破裂,送检疑似为凶器的铁锨一把。1.2检验试剂及仪器检验试剂:DNA SMART System法医DNA提取试剂盒(上海位点生物科技有限公司);Identifiler Plus扩增试剂盒(美国AppliedBiosystems公司);ZN-1000快速显现DNA试剂(北京中能信达科技有限公司)。