细粒棘球绦虫胞外囊复合物2蛋白的生物信息学分析

目的:利用生物信息学方法预测细粒棘球绦虫胞外囊复合物2(EXOC2)蛋白的生化特性、抗原表位及分子功能。方法:利用蛋白质在线分析网站以及在线数据库预测EXOC2蛋白的理化性质、三级结构、亲疏水性、B细胞优势抗原表位、T细胞优势表位、蛋白的互作网络关系、差异基因GO功能、KEGG通路富集分析、磷酸化位点和蛋白修饰位点。结果:优势B细胞表位位于100-115、539-540、851-866、896-911、988-992、704-749区段,HLA-DRB1*0401限制性Th表位位于821-823、920-930区段,HLA-DRB1*0701限制性Th表位位于270-275、920-922区段。结论:利用在线数据库及生物信息学方法预测EXOC2蛋白的生物功能、B细胞优势抗原表位及T细胞优势,可为棘球蚴病分子肽疫苗的研制提供一定的理论基础。

细粒棘球绦虫蛋白Actin-binding LIM protein 1的生物信息学分析

目的对细粒棘球绦虫肌动蛋白结合LIM蛋白1(Actin-binding LIM protein 1,AbLIM1)进行生物信息学预测,以期为包虫病的诊断治疗积累研究资料。方法通过NCBI数据库获取EgAbLIM1的氨基酸序列;使用在线软件分析蛋白质的理化性质、二级结构、三级结构,并对其亚细胞定位、蛋白质结构以及抗原表位进行预测;使用GEPIA2.0数据库预测编码EgAbLIM1基因的相关基因,使用DAVID数据库以及R语言进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果EgAbLIM1由753个氨基酸组成,理论等电点为9.51;EgAbLIM1的二级结构中α螺旋占22.05%,延伸链占12.62%,β-转角占5.44%,无规卷曲占59.89%。优势B细胞表位肽有6条,优势HLA-DRB1*0401限制性Th表位位置为572-584位氨基酸;优势HLA-DRB1*0701限制性Th表位位置为247-261、504-511位氨基酸。分子生物学功能相关程度最高的是钙黏连结合(cadherin binding)、参与细胞-细胞粘附的钙黏连结合(cadherin binding involved in cell-cell adhesion)、细胞-细胞粘附介质的活性(cell-cell adhesion mediator activity)等。结论生物信息学方法预测细粒棘球绦虫AbLIM1含有多个抗原表位并对其关联基因进行了富集分析,为包虫病的诊断和药物治疗靶点筛选提供理论依据。

建立儿童肺炎支原体感染诊断评分的临床应用价值

目的构建儿童肺炎支原体感染的诊断评分,为临床确诊肺炎支原体感染提供诊疗思路及参考价值.方法选取2014年1月~2019年1月我院确诊为肺炎支原体感染的儿童553例,在CAF(咳嗽、年龄、发热)方案基础上建立儿童肺炎支原体感染诊断评分,以临床结果为标准,初步验证诊断评分的可行性.结果白细胞计数、淋巴细胞计数、中性粒细胞绝对值、单核细胞绝对值、嗜酸性粒细胞绝对值、嗜碱性细胞绝对值在不同组间差异均具有统计学意义(P<0.05),喘息患儿具有性别差异统计学意义(P<0.05),不同年龄段均在城市、农村差异具有统计学意义(P<0.05).建立诊断评分,根据评分我院553例儿童灵敏度为90%,特异度为9.4%.结论通过对我院住院儿童临床资料回顾性分析并初步应用诊断评分,灵敏度较高,特异度较低,该评分具有临床可行性和应用价值.