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G蛋白偶联受体119活性位点预测及与吡唑并嘧啶类激动剂对接研究
被引量:
1
1
作者
赵倩男
程雅迪
+2 位作者
钱艳椿
荣学滨
曹洪玉
《湖南师范大学自然科学学报》
CAS
北大核心
2018年第1期41-47,共7页
利用同源模建的方法构建GPR119蛋白三维结构,经多种方法优化并用Profiles-3D和拉氏图评估后,得到最优蛋白模型,计算分析得到5个可能的活性位点,分析其活性位点氨基酸组成情况,发现了潜在保守序列.构建并优化了吡唑并嘧啶类药物小分子,...
利用同源模建的方法构建GPR119蛋白三维结构,经多种方法优化并用Profiles-3D和拉氏图评估后,得到最优蛋白模型,计算分析得到5个可能的活性位点,分析其活性位点氨基酸组成情况,发现了潜在保守序列.构建并优化了吡唑并嘧啶类药物小分子,其最低能量结构采用最陡下降法和共轭梯度法进行优化.将药物小分子逐一对接至蛋白的各个活性位点,得到二者相互作用模型.根据作用模型分析了此类药物小分子与活性位点之间的氢键、静电作用力等.
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关键词
G蛋白偶联受体GPR119
同源模建
活性位点
分子对接
下载PDF
职称材料
题名
G蛋白偶联受体119活性位点预测及与吡唑并嘧啶类激动剂对接研究
被引量:
1
1
作者
赵倩男
程雅迪
钱艳椿
荣学滨
曹洪玉
机构
大连大学生命科学与技术学院
出处
《湖南师范大学自然科学学报》
CAS
北大核心
2018年第1期41-47,共7页
基金
国家自然科学基金青年项目(21601025)
国家大学生创新计划项目(201711258000012)
+1 种基金
辽宁省大学生创新计划项目(201711258000012)
大连大学大学生创新计划项目(2016065)
文摘
利用同源模建的方法构建GPR119蛋白三维结构,经多种方法优化并用Profiles-3D和拉氏图评估后,得到最优蛋白模型,计算分析得到5个可能的活性位点,分析其活性位点氨基酸组成情况,发现了潜在保守序列.构建并优化了吡唑并嘧啶类药物小分子,其最低能量结构采用最陡下降法和共轭梯度法进行优化.将药物小分子逐一对接至蛋白的各个活性位点,得到二者相互作用模型.根据作用模型分析了此类药物小分子与活性位点之间的氢键、静电作用力等.
关键词
G蛋白偶联受体GPR119
同源模建
活性位点
分子对接
Keywords
G protein-coupled receptor 119
homology modeling
active site
molecular docking
分类号
R91 [医药卫生—药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
G蛋白偶联受体119活性位点预测及与吡唑并嘧啶类激动剂对接研究
赵倩男
程雅迪
钱艳椿
荣学滨
曹洪玉
《湖南师范大学自然科学学报》
CAS
北大核心
2018
1
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