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中国部分地区献血者中乙型肝炎病毒的基因序列变异特征
1
作者
刘鱼
王憬惺
+9 位作者
何苗
杨通汉
贠中桥
周仲民
黄梅
铁木尔.美黑丽
刘桂
柯玲
徐敏
Hua Shan
《中国输血杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第11期1055-1061,共7页
目的了解我国献血者HBV基因MHR区、PreS区、逆转录酶区及PreC/BCP区序列变异特征;分析HBV序列变异与HBV基因型、亚型、献血者人口地理特征及献血者HBV血清学特征的关系。方法从昆明、洛阳、柳州、绵阳、乌鲁木齐5家血液中心(或中心血站)...
目的了解我国献血者HBV基因MHR区、PreS区、逆转录酶区及PreC/BCP区序列变异特征;分析HBV序列变异与HBV基因型、亚型、献血者人口地理特征及献血者HBV血清学特征的关系。方法从昆明、洛阳、柳州、绵阳、乌鲁木齐5家血液中心(或中心血站)2008~2010年HBsAg确证阳性献血者标本中,随机抽取245份:用巢式PCR法扩增PreS/S区、S区、PreC/BCP区并双向测序,用ClustalⅩ将测序结果与标准株序列比对分析是否存在重要位点突变;将测序结果翻译成氨基酸后与标准株的氨基酸序列比对分析是否存在S区和逆转录酶编码区突变。用SPSS 11.0统计软件比较序列变异的地理分布、人口特征分布、基因型和亚型分布以及其与献血者HBV病毒学特征和血清学特征的关系。结果献血者HBV基因MHR区突变率为17.1%(39/228),B基因型中MHR区的突变率高于C基因型(23.1%vs 4.0%)。PreS区突变率为14.0%(28/200),包括PreS区缺失以及T31C和T53C突变;PreS区发生缺失者占2.5%(5/200),且所有D基因型标本中均未发现D基因型特有的PreS区33个核苷酸的缺失;C型PreS区突变率高于B型(26.0%vs和5.2%),C2亚型高于B2亚型(42.5%vs 3.8%)。PreC/BCP区突变率为29.8%(68/228),C型中A1762T/G1764A联合突变率高于B型(34.0%vs 4.48%),B型中G1896A突变发生率高于C型(26.9%vs 8.0%),PreC/BCP区变异标本的HBeAg阳性率明显低于无该区突变标本(11.8%vs 26.7%,P<0.05)。逆转录酶区突变率为7.0%(14/200),其突变位点突变位点主要与阿德福韦酯和拉米夫定耐药有关,未发现最典型的YMDD拉米夫定突变。结论我国献血者HBV基因MHR区突变尽管低于其他国家的比例,但在HBV基因各重要区域中的序列变异率仍为最高;献血者HBV基因与肝细胞癌相关的突变主要位于PreC/BCP区,在PreS区的较少;C基因型中PreS区突变率和A1762T/G1764A联合突变率高于B型,B基因型中G1896A突变率高于C型;献血者感染的HBV存在逆转录酶区耐药突变。
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关键词
献血者
乙型肝炎病毒
基因型
序列变异
基因亚型
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职称材料
题名
中国部分地区献血者中乙型肝炎病毒的基因序列变异特征
1
作者
刘鱼
王憬惺
何苗
杨通汉
贠中桥
周仲民
黄梅
铁木尔.美黑丽
刘桂
柯玲
徐敏
Hua Shan
机构
中国医学科学院北京协和医学院输血研究所
昆明血液中心
洛阳市中心血站
广西血液中心
绵阳市中心血站
乌鲁木齐血液中心
Division of Transfusion Medicine
出处
《中国输血杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第11期1055-1061,共7页
基金
美国国立卫生研究院(NIH)项目(HHSN268200417175C)
文摘
目的了解我国献血者HBV基因MHR区、PreS区、逆转录酶区及PreC/BCP区序列变异特征;分析HBV序列变异与HBV基因型、亚型、献血者人口地理特征及献血者HBV血清学特征的关系。方法从昆明、洛阳、柳州、绵阳、乌鲁木齐5家血液中心(或中心血站)2008~2010年HBsAg确证阳性献血者标本中,随机抽取245份:用巢式PCR法扩增PreS/S区、S区、PreC/BCP区并双向测序,用ClustalⅩ将测序结果与标准株序列比对分析是否存在重要位点突变;将测序结果翻译成氨基酸后与标准株的氨基酸序列比对分析是否存在S区和逆转录酶编码区突变。用SPSS 11.0统计软件比较序列变异的地理分布、人口特征分布、基因型和亚型分布以及其与献血者HBV病毒学特征和血清学特征的关系。结果献血者HBV基因MHR区突变率为17.1%(39/228),B基因型中MHR区的突变率高于C基因型(23.1%vs 4.0%)。PreS区突变率为14.0%(28/200),包括PreS区缺失以及T31C和T53C突变;PreS区发生缺失者占2.5%(5/200),且所有D基因型标本中均未发现D基因型特有的PreS区33个核苷酸的缺失;C型PreS区突变率高于B型(26.0%vs和5.2%),C2亚型高于B2亚型(42.5%vs 3.8%)。PreC/BCP区突变率为29.8%(68/228),C型中A1762T/G1764A联合突变率高于B型(34.0%vs 4.48%),B型中G1896A突变发生率高于C型(26.9%vs 8.0%),PreC/BCP区变异标本的HBeAg阳性率明显低于无该区突变标本(11.8%vs 26.7%,P<0.05)。逆转录酶区突变率为7.0%(14/200),其突变位点突变位点主要与阿德福韦酯和拉米夫定耐药有关,未发现最典型的YMDD拉米夫定突变。结论我国献血者HBV基因MHR区突变尽管低于其他国家的比例,但在HBV基因各重要区域中的序列变异率仍为最高;献血者HBV基因与肝细胞癌相关的突变主要位于PreC/BCP区,在PreS区的较少;C基因型中PreS区突变率和A1762T/G1764A联合突变率高于B型,B基因型中G1896A突变率高于C型;献血者感染的HBV存在逆转录酶区耐药突变。
关键词
献血者
乙型肝炎病毒
基因型
序列变异
基因亚型
Keywords
blood donor
HBV
genotype
mutation
subgenotype
分类号
R446 [医药卫生—诊断学]
R512.62 [医药卫生—内科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国部分地区献血者中乙型肝炎病毒的基因序列变异特征
刘鱼
王憬惺
何苗
杨通汉
贠中桥
周仲民
黄梅
铁木尔.美黑丽
刘桂
柯玲
徐敏
Hua Shan
《中国输血杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013
0
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