油莎草(Cyperus esculentus)MADS-box转录因子家族鉴定及表达分析

MADS-box基因家族与植物生长和发育调控密切相关。为揭示油莎草MADS-box家族成员组织表达模式,本研究根据油莎草茎块RNA-Seq结果,利用HMM搜索鉴定了26个家族成员,系统发育分析及保守结构域分析表明油莎草MADS-box成员主要属于MIKC型,具有典型的MEF2类MADS结构域,在不同茎块发育时期具有7种表达模式,其中CeMADSXAL1基因在茎块发育初期高表达,推测CeMADSXAL1基因对油莎草茎块发育过程具有重要调控作用。此外,研究对CeMADSXAL1基因进行克隆,获得长度为747 bp的开放阅读框,编码249个氨基酸;亚细胞定位分析结果显示,Ce MADSXAL1蛋白主要在细胞核内表达,结果为进一步阐明油莎草MADS-box基因功能提供了理论基础。

薰衣草JAZ和MYC2-like基因家族生物信息学及表达模式分析

JAZ蛋白和MYC2-like转录因子是茉莉酸(jasmonate,JA)类物质信号转导途径的关键调节因子,在植物的生长发育和次级代谢中发挥重要作用。以拟南芥13个JAZ蛋白和11个MYC2-like蛋白的氨基酸序列为参考序列,检索薰衣草基因组中的LaJAZ和LaMYC2-like基因家族成员,并对其进行生物信息学分析。结果表明,在薰衣草基因组中共鉴定到26个LaJAZ和26个LaMYC2-like基因,这些基因不均匀的分布在22条染色体上。LaJAZ和LaMYC2-like基因启动子的顺式作用元件涉及植物对光、茉莉酸、脱落酸、防御和胁迫反应的响应。qRT-PCR显示,选择的6个LaJAZ基因在深紫色萼片中表达较高,而LaMYC2-like基因在浅紫色萼片中表达较高。此外,有15个LaJAZ和LaMYC2-like基因受茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)诱导。以上研究结果为薰衣草LaJAZ和LaMYC2-like基因的功能分析及其对JA信号的响应机理研究奠定了基础。