长江上游长鳍吻鮈群体线粒体控制区遗传多样性分析

分析长鳍吻鮈群体遗传结构和遗传多样性,为研究过度捕捞、水电开发等人类活动对长鳍吻鮈的长期生态学效应及其物种适应机制提供基础数据,同时也为该物种保护策略的制定和调整提供科学数据支持。2014和2015年,于长江上游干流江津、宜宾、皎平渡和格里坪采集长鳍吻鮈,利用线粒体控制区序列的特异性引物,通过PCR扩增以及序列测定,获得125份长鳍吻鮈线粒体控制区序列。结果表明：125尾长鳍吻鮈样品共检测到多态位点25个,单倍型30种,平均单倍型多样性指数（Hd）和核苷酸多样性指数（Pi）分别为0.785和0.00140;中性检验（Tajima＇s D为-1.97524,P〈0.05;Fu＇s Fs为-31.374,P=0.000）和序列错配分布结果表明,长江上游长鳍吻鮈历史上经历过＂遗传瓶颈＂和种群扩张;分子方差分析（AMOVA）结果表明,群体间的遗传变异绝大部分来源于群体内部（99.07%）,群体间无显著遗传分化（Fst=0.00933,P〉0.05）;单倍型网络、Kinura 2-Parameter遗传距离和平均基因流均显示,4个长鳍吻鮈群体间存在广泛的基因交流,群体间无遗传分化。各群体间没有显著遗传分化,基因交流频繁,可将长江上游长鳍吻鮈作为单一的进化显著单元（ESU）进行管理。

向家坝水电站阻隔背景下圆口铜鱼种群遗传结构分析

通过对向家坝坝上坝下不同地点和不同年龄的圆口铜鱼（Coreius guichenoti）样本的遗传结构进行计算和分析,从时空两个维度上评估向家坝水电站对圆口铜鱼种群所造成的影响。从10个采样点共获得254尾铜鱼,年龄分别在1-7龄,依据各年龄组样本数,将其分为5个世代群体。用于分析的线粒体DNA控制区的片段序列为944 bp,在254个序列中,共检测出变异位点40个,单倍型62种,共享单倍型比例较高,为37.1%（23/62）。254个个体的平均单倍型多样性（Hd）和平均核苷酸多样性（π）分别为0.947 09和0.004 89,遗传多样性相对较丰富。10个地理群体间的分化指数（Fst值）、分子方差分析（AMOVA）和平均K 2-P遗传距离均表明10个圆口铜鱼地理群体间存在广泛的基因交流,未发生显著的群体遗传分化。5个世代群体的分子方差分析（AMOVA）结果显示,各世代群体间不存在显著的遗传差异。单倍型的NJ分子系统树和NETWORK网络图显示单倍型的聚类与地理分群没有相关性。结果表明,不同采样点的群体和不同世代群体间均未出现遗传分化,向家坝对圆口铜鱼种群所造成的影响在遗传结构上暂未显现出来。

微卫星位点AciG-35在中华鲟野生个体中不同等位基因的序列变异研究

本研究利用PCR扩增和序列测定得到了1个特殊4碱基重复微卫星位点AciG-35在中华鲟野生个体中的34个等位基因序列。根据序列测定的结果,初步研究了该位点的核心重复区序列以及两端侧翼序列的变异情况。该位点不同等位基因的核心序列和侧翼序列都表现出一定程度的变异,其中核心重复序列主要表现为点突变,侧翼序列主要表现为各种碱基的替换、插入和缺失以及片段的插入缺失。此外,还发现了AciG-35引物在中华鲟中的多位点扩增现象。研究结果对于准确解释微卫星分子标记用于群体遗传分析时的数据结果具有重要意义,对在微卫星标记的应用过程中可能存在的一些问题一并进行了探讨。