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玉米CMS-S型不育系花药的转录组分析
1
作者
闫嘉颖
王久红
+3 位作者
赵永锋
贾晓艳
郭晋杰
祝丽英
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期1-9,共9页
为探索玉米CMS-S型雄性不育的分子机制,以不育系郑58cms-Q1261和保持系郑58单核晚期的花药为材料进行转录组分析,发现14565个差异表达基因(DEGs),其中7551个上调表达,7014个下调表达。GO富集分析显示这些DEGs主要富集在代谢过程、细胞...
为探索玉米CMS-S型雄性不育的分子机制,以不育系郑58cms-Q1261和保持系郑58单核晚期的花药为材料进行转录组分析,发现14565个差异表达基因(DEGs),其中7551个上调表达,7014个下调表达。GO富集分析显示这些DEGs主要富集在代谢过程、细胞和催化活性等方面。KEGG显著富集的主要代谢通路为碳代谢、淀粉和蔗糖代谢、氧化磷酸化、糖酵解/糖异生、氨基糖和核苷酸糖代谢等。选取12个DEGs进行qRT-PCR分析,结果与RNA-Seq数据一致,证明转录组数据的准确性。进一步对DEGs分析,发现2个果胶裂解酶超家族蛋白、5个果胶裂解酶类,3个热休克蛋白和2个bHLH转录因子与雄性不育有关。
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关键词
玉米
S型雄性不育
转录组测序
差异表达基因
富集分析
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职称材料
题名
玉米CMS-S型不育系花药的转录组分析
1
作者
闫嘉颖
王久红
赵永锋
贾晓艳
郭晋杰
祝丽英
机构
河北农业大学农学院/国家玉米改良中心河北分中心/河北省作物种质资源实验室
出处
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期1-9,共9页
基金
河北省重点研发计划项目(21326325D)。
文摘
为探索玉米CMS-S型雄性不育的分子机制,以不育系郑58cms-Q1261和保持系郑58单核晚期的花药为材料进行转录组分析,发现14565个差异表达基因(DEGs),其中7551个上调表达,7014个下调表达。GO富集分析显示这些DEGs主要富集在代谢过程、细胞和催化活性等方面。KEGG显著富集的主要代谢通路为碳代谢、淀粉和蔗糖代谢、氧化磷酸化、糖酵解/糖异生、氨基糖和核苷酸糖代谢等。选取12个DEGs进行qRT-PCR分析,结果与RNA-Seq数据一致,证明转录组数据的准确性。进一步对DEGs分析,发现2个果胶裂解酶超家族蛋白、5个果胶裂解酶类,3个热休克蛋白和2个bHLH转录因子与雄性不育有关。
关键词
玉米
S型雄性不育
转录组测序
差异表达基因
富集分析
Keywords
maize
S-type male sterility
transcriptome sequencing
DEGs
enrichment analysis
分类号
S513 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
玉米CMS-S型不育系花药的转录组分析
闫嘉颖
王久红
赵永锋
贾晓艳
郭晋杰
祝丽英
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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