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基于多信息融合的亚叶绿体定位预测研究 被引量:1
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作者 王瑞雪 李前忠 +1 位作者 闫振河 薛济先 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2017年第1期80-90,共11页
叶绿体是植物进行光合作用的主要场所,预测亚叶绿体定位对于研究其功能以及与其他大分子相互作用有重要的意义,因此更准确地预测蛋白质亚叶绿体定位成为一项必要的工作.文章建立了新的蛋白质亚叶绿体数据集,计算了氨基酸单肽分段组分信... 叶绿体是植物进行光合作用的主要场所,预测亚叶绿体定位对于研究其功能以及与其他大分子相互作用有重要的意义,因此更准确地预测蛋白质亚叶绿体定位成为一项必要的工作.文章建立了新的蛋白质亚叶绿体数据集,计算了氨基酸单肽分段组分信息,氨基酸二肽组分信息,预测的蛋白质二级结构信息,氨基酸指数信息,基于生物过程和分子功能的GO注释信息,以及基于PSSM矩阵的进化信息和保守信息,结合支持向量机算法(SVM)预测了亚叶绿体蛋白质定位.Jackknife检验的总体预测成功率为93.16%,同时交叉验证和独立测试也获得了较好的结果,分别为93.72%和90.65%. 展开更多
关键词 亚叶绿体定位 GENE ONTOLOGY 二级结构 氨基酸指数 SVM独立检验
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抗凋亡与促凋亡蛋白质的结构分析 被引量:1
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作者 赵晋桃 陈颖丽 闫振河 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2016年第1期65-72,共8页
针对SwissProt数据库所建立的239条抗凋亡蛋白质与222条促凋亡蛋白质数据集进行结构域、模体信息的搜索与分析,发现抗凋亡蛋白质与促凋亡蛋白质所特有的结构域和模体结构,也发现有部分结构域、模体信息是抗凋亡蛋白质与促凋亡蛋白质所... 针对SwissProt数据库所建立的239条抗凋亡蛋白质与222条促凋亡蛋白质数据集进行结构域、模体信息的搜索与分析,发现抗凋亡蛋白质与促凋亡蛋白质所特有的结构域和模体结构,也发现有部分结构域、模体信息是抗凋亡蛋白质与促凋亡蛋白质所共有的.在PDB数据库中找到上述结构域的二级和三级结构,再利用MEME搜索序列模体,从而提取出具有凋亡作用的保守的高级结构特征与信息,这些特征信息可以为抗凋亡与促凋亡作用机制的研究提供帮助. 展开更多
关键词 抗凋亡蛋白质 促凋亡蛋白质 结构域 模体
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使用蛋白质和mRNA序列信息预测蛋白质亚线粒体定位
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作者 刘娟娟 李前忠 +1 位作者 闫振河 薛济先 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2017年第1期69-79,共11页
线粒体是很重要的半自主性细胞器,主要为细胞提供能量,还承担了许多其他生理功能,而线粒体的某些功能只有在特定亚线粒体位置中才能实现.对亚线粒体定位的研究有助于进一步了解蛋白质的功能.文章计算了蛋白质的进化信息、同源序列的go... 线粒体是很重要的半自主性细胞器,主要为细胞提供能量,还承担了许多其他生理功能,而线粒体的某些功能只有在特定亚线粒体位置中才能实现.对亚线粒体定位的研究有助于进一步了解蛋白质的功能.文章计算了蛋白质的进化信息、同源序列的go信息、氨基酸指数信息、氨基酸粘性、氨基酸组分、平均化学位移,并结合mRNA序列的三联体频数,利用支持向量机算法和离散增量算法对蛋白质亚线粒体定位进行预测,在jackknife检验下准确率达到97.64%,同时用独立检验也取得较好的结果. 展开更多
关键词 亚线粒体定位 同源序列go信息 mRNA三联体频数 支持向量机 离散增量
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A802A塑胶磨床的改造 被引量:1
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作者 钱建军 赵树文 +1 位作者 田京生 闫振河 《纺织器材》 2002年第5期44-45,共2页
介绍了A80 2A塑胶磨床改造后磨砺出表面不处理胶辊的优越性能 ,通过与改造前磨砺胶辊进行比较 ,提出了A80 2A磨床改造费用低廉及其应进一步改进的问题。
关键词 A802A塑胶磨床 改造 胶辊磨床 粗糙度 磨砺
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