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基于网络药理学的金银花治疗过敏性鼻炎作用机制研究
1
作者
曲添星
王结鑫
+4 位作者
杨文倩
闫昊前
吴芮
穆永兰
张立明
《中医学》
2021年第3期402-413,共12页
目的:基于网络药理学探究金银花治疗过敏性鼻炎的作用机制。方法:通过TCMSP数据库,根据ADME筛选出金银花的活性成分及其靶点,使用Uniprot数据库规范靶点对应的人类基因名;通过Genecards、TTD、OMIM数据库获取过敏性鼻炎主要靶点,利用R...
目的:基于网络药理学探究金银花治疗过敏性鼻炎的作用机制。方法:通过TCMSP数据库,根据ADME筛选出金银花的活性成分及其靶点,使用Uniprot数据库规范靶点对应的人类基因名;通过Genecards、TTD、OMIM数据库获取过敏性鼻炎主要靶点,利用R语言绘制Venn图得到金银花活性成分作用靶点与过敏性鼻炎的交集靶点;Perl软件整理数据,采用Cytoscape3.7.2软件构建“金银花活性成分–过敏性鼻炎靶点”网络;利用String平台进行蛋白质相互作用分析,构建PPI网络并挖掘网络中潜在的蛋白质功能模块;采用Metascape平台进行GO富集与KEGG富集分析;最后通过Ledock进行分子对接验证。结果:通过TCMSP检索到236个金银花主要化学成分,筛选出23个活性成分,根据Uniprot数据库,排除无对应基因名部分,排除靶点重复部分,共获得活性成分17个,靶点193个;以“allergic rhinitis”为关键词,检索OMIM数据库、GeneCards数据库、TTD数据库的疾病潜在作用靶点,排除重复部分,得到过敏性鼻炎潜在作用靶点2089个,利用R语言绘制Venn图,得到疾病–活性成分共同靶点98个;利用CytoNCA得出Degree前3的活性成分是槲皮素、木犀草素和山柰酚;物种设置为人源性,以0.40为置信区间,构建了节点数98、边数1762、平均节点度36、平均局部聚类系数0.684的PPI网络;GO富集和KEGG富集显示,金银花主要参与的生物学过程包括生物对脂多糖的应答过程(response to lipopolysaccharide)、凋亡细胞通路(apoptotic signaling pathway)、调节细胞黏附(regulation of cell adhesion)、对受伤的应答(response to wounding)、对毒性物质的应答(response to toxic substance)等,参与的通路主要有癌症信号通路(Pathways in cancer)、流体剪切应力与动脉粥样硬化(Fluid shear stress and atherosclerosis)、IL-17信号通路(IL-17signaling pathway)以及癌症蛋白聚糖(Proteoglycans in cancer)等,相关靶点治疗过敏性鼻炎的功能主要富集于转录因子结合(transcription factor binding)、蛋白均二聚活性(protein homodimerization activity)、细胞因子受体结合(cytokine receptor binding)、激酶结合(kinase binding)、蛋白激酶活性(protein kinase activity)等;金银花关键活性成分槲皮素、木犀草素、山柰酚与疾病关键靶点AKT1 (PDB ID: 4EJN)对接亲和力分别为−6.07、−6.91、−5.81 kcal/mol,均 【−5 kcal/mol,结合稳定,验证了网络药理学。结论:金银花治疗过敏性鼻炎的机制具有多靶点、多通路特点,为后续的基础研究提供了思路。
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关键词
网络药理学
金银花
过敏性鼻炎
分子对接
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职称材料
基于HPLC检测枸杞西洋参软胶囊中人参皂苷Rb_(1)含量的方法学研究
2
作者
赵雨
褚海清
+2 位作者
王结鑫
闫昊前
张立明
《亚太传统医药》
2022年第4期62-65,共4页
目的:建立测定枸杞西洋参软胶囊中人参皂苷 Rb_(1)含量的高效液相法,为枸杞西洋参软胶囊的质量控制提供方法学依据。方法:以饱和正丁醇提取样品,以乙腈-0.1%磷酸为流动相进行梯度洗脱,柱温为35℃,流速为1.0mL/min,进样量为10μL,应用 H...
目的:建立测定枸杞西洋参软胶囊中人参皂苷 Rb_(1)含量的高效液相法,为枸杞西洋参软胶囊的质量控制提供方法学依据。方法:以饱和正丁醇提取样品,以乙腈-0.1%磷酸为流动相进行梯度洗脱,柱温为35℃,流速为1.0mL/min,进样量为10μL,应用 HPLC法对枸杞西洋参软胶囊中人参皂苷 Rb_(1)的含量进行检测,分别进行专属性、精密度、稳定性、重复性、加样回收率实验考察并验证方法的科学性。结果:人参皂苷 Rb_(1)线性关系良好;专属性试验表明枸杞西洋参软胶囊中人参皂苷 Rb_(1)具有专属性;精密度测定RSD=1.52%;稳定性测定峰面积RSD=1.81%;重复性试验表明 HPLC重复性良好;人参皂苷 Rb_(1)加样回收率显示良好。结论:表明高效液相色谱法检测枸杞西洋参软胶囊中人参皂苷 Rb_(1)含量,操作方便快捷,使用良好,可用于枸杞西洋参软胶囊中人参皂苷 Rb_(1)的含量测定。
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关键词
高效液相色谱法
枸杞西洋参软胶囊
人参皂苷Rb_(1)
方法学研究
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职称材料
题名
基于网络药理学的金银花治疗过敏性鼻炎作用机制研究
1
作者
曲添星
王结鑫
杨文倩
闫昊前
吴芮
穆永兰
张立明
机构
宁夏医科大学药学院
中国海洋大学医药学院
宁夏医科大学药学院
宁夏特色中医药现代化工程技术研究中心
宁夏医科大学回医药现代化教育部重点实验室
出处
《中医学》
2021年第3期402-413,共12页
文摘
目的:基于网络药理学探究金银花治疗过敏性鼻炎的作用机制。方法:通过TCMSP数据库,根据ADME筛选出金银花的活性成分及其靶点,使用Uniprot数据库规范靶点对应的人类基因名;通过Genecards、TTD、OMIM数据库获取过敏性鼻炎主要靶点,利用R语言绘制Venn图得到金银花活性成分作用靶点与过敏性鼻炎的交集靶点;Perl软件整理数据,采用Cytoscape3.7.2软件构建“金银花活性成分–过敏性鼻炎靶点”网络;利用String平台进行蛋白质相互作用分析,构建PPI网络并挖掘网络中潜在的蛋白质功能模块;采用Metascape平台进行GO富集与KEGG富集分析;最后通过Ledock进行分子对接验证。结果:通过TCMSP检索到236个金银花主要化学成分,筛选出23个活性成分,根据Uniprot数据库,排除无对应基因名部分,排除靶点重复部分,共获得活性成分17个,靶点193个;以“allergic rhinitis”为关键词,检索OMIM数据库、GeneCards数据库、TTD数据库的疾病潜在作用靶点,排除重复部分,得到过敏性鼻炎潜在作用靶点2089个,利用R语言绘制Venn图,得到疾病–活性成分共同靶点98个;利用CytoNCA得出Degree前3的活性成分是槲皮素、木犀草素和山柰酚;物种设置为人源性,以0.40为置信区间,构建了节点数98、边数1762、平均节点度36、平均局部聚类系数0.684的PPI网络;GO富集和KEGG富集显示,金银花主要参与的生物学过程包括生物对脂多糖的应答过程(response to lipopolysaccharide)、凋亡细胞通路(apoptotic signaling pathway)、调节细胞黏附(regulation of cell adhesion)、对受伤的应答(response to wounding)、对毒性物质的应答(response to toxic substance)等,参与的通路主要有癌症信号通路(Pathways in cancer)、流体剪切应力与动脉粥样硬化(Fluid shear stress and atherosclerosis)、IL-17信号通路(IL-17signaling pathway)以及癌症蛋白聚糖(Proteoglycans in cancer)等,相关靶点治疗过敏性鼻炎的功能主要富集于转录因子结合(transcription factor binding)、蛋白均二聚活性(protein homodimerization activity)、细胞因子受体结合(cytokine receptor binding)、激酶结合(kinase binding)、蛋白激酶活性(protein kinase activity)等;金银花关键活性成分槲皮素、木犀草素、山柰酚与疾病关键靶点AKT1 (PDB ID: 4EJN)对接亲和力分别为−6.07、−6.91、−5.81 kcal/mol,均 【−5 kcal/mol,结合稳定,验证了网络药理学。结论:金银花治疗过敏性鼻炎的机制具有多靶点、多通路特点,为后续的基础研究提供了思路。
关键词
网络药理学
金银花
过敏性鼻炎
分子对接
分类号
R28 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
基于HPLC检测枸杞西洋参软胶囊中人参皂苷Rb_(1)含量的方法学研究
2
作者
赵雨
褚海清
王结鑫
闫昊前
张立明
机构
宁夏医科大学药学院
宁夏特色中医药现代化工程技术研究中心
宁夏医科大学回医药现代化教育部重点实验室
出处
《亚太传统医药》
2022年第4期62-65,共4页
基金
宁夏自治区重点研发项目(2018BEG03014)。
文摘
目的:建立测定枸杞西洋参软胶囊中人参皂苷 Rb_(1)含量的高效液相法,为枸杞西洋参软胶囊的质量控制提供方法学依据。方法:以饱和正丁醇提取样品,以乙腈-0.1%磷酸为流动相进行梯度洗脱,柱温为35℃,流速为1.0mL/min,进样量为10μL,应用 HPLC法对枸杞西洋参软胶囊中人参皂苷 Rb_(1)的含量进行检测,分别进行专属性、精密度、稳定性、重复性、加样回收率实验考察并验证方法的科学性。结果:人参皂苷 Rb_(1)线性关系良好;专属性试验表明枸杞西洋参软胶囊中人参皂苷 Rb_(1)具有专属性;精密度测定RSD=1.52%;稳定性测定峰面积RSD=1.81%;重复性试验表明 HPLC重复性良好;人参皂苷 Rb_(1)加样回收率显示良好。结论:表明高效液相色谱法检测枸杞西洋参软胶囊中人参皂苷 Rb_(1)含量,操作方便快捷,使用良好,可用于枸杞西洋参软胶囊中人参皂苷 Rb_(1)的含量测定。
关键词
高效液相色谱法
枸杞西洋参软胶囊
人参皂苷Rb_(1)
方法学研究
Keywords
High Performance Liquid Chromatography(HPLC)
Gouqi Xiyangshen Capsules
Ginsenoside Rb1
Methodological Research
分类号
R284.2 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学的金银花治疗过敏性鼻炎作用机制研究
曲添星
王结鑫
杨文倩
闫昊前
吴芮
穆永兰
张立明
《中医学》
2021
0
下载PDF
职称材料
2
基于HPLC检测枸杞西洋参软胶囊中人参皂苷Rb_(1)含量的方法学研究
赵雨
褚海清
王结鑫
闫昊前
张立明
《亚太传统医药》
2022
0
下载PDF
职称材料
已选择
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