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黄连属植物DNA条形码研究
被引量:
4
1
作者
李波
刘俊
+6 位作者
闵道长
何小慧
李波超
朱昌兰
张志勇
袁庆军
吴丁
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期1089-1095,共7页
本研究基于黄连属(Coptis Salisb.)的大尺度取样,全面评估了叶绿体DNA序列psb A-trn H和ycf1,及核DNA序列ITS和ETS在黄连属物种鉴定中的有效性。综合分析了不同候选序列的特征,计算种内种间遗传距离,评估序列的条形码间距,及构建邻接树...
本研究基于黄连属(Coptis Salisb.)的大尺度取样,全面评估了叶绿体DNA序列psb A-trn H和ycf1,及核DNA序列ITS和ETS在黄连属物种鉴定中的有效性。综合分析了不同候选序列的特征,计算种内种间遗传距离,评估序列的条形码间距,及构建邻接树,发现各片段种内变异率都远小于种间变异率,4个片段都不存在明显的条形码间距,单一片段鉴定效率仅在47%~63%,而片段组合中,双片段组合ITS+ycf1具有最高的分辨率(达到79%),与3片段组合ITS+ETS+ycf1及4片段组合(ITS+ETS+ycf1+psb A-trn H)鉴定率相同,且能成功鉴定中药黄连的原植物,即三角叶黄连(C.deltoidea)、云南黄连(C.teeta)和黄连(C.chinensis)。因此,笔者建议将ITS+ycf1序列组合作为中药黄连鉴定的标准条形码。
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关键词
DNA条形码
分子鉴定
中药
黄连属
下载PDF
职称材料
题名
黄连属植物DNA条形码研究
被引量:
4
1
作者
李波
刘俊
闵道长
何小慧
李波超
朱昌兰
张志勇
袁庆军
吴丁
机构
江西农业大学农学院
中国中医科学院中药资源中心
景德镇学院
出处
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期1089-1095,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31360046)
国家级大学生创新创业训练计划项目(201510410006)~~
文摘
本研究基于黄连属(Coptis Salisb.)的大尺度取样,全面评估了叶绿体DNA序列psb A-trn H和ycf1,及核DNA序列ITS和ETS在黄连属物种鉴定中的有效性。综合分析了不同候选序列的特征,计算种内种间遗传距离,评估序列的条形码间距,及构建邻接树,发现各片段种内变异率都远小于种间变异率,4个片段都不存在明显的条形码间距,单一片段鉴定效率仅在47%~63%,而片段组合中,双片段组合ITS+ycf1具有最高的分辨率(达到79%),与3片段组合ITS+ETS+ycf1及4片段组合(ITS+ETS+ycf1+psb A-trn H)鉴定率相同,且能成功鉴定中药黄连的原植物,即三角叶黄连(C.deltoidea)、云南黄连(C.teeta)和黄连(C.chinensis)。因此,笔者建议将ITS+ycf1序列组合作为中药黄连鉴定的标准条形码。
关键词
DNA条形码
分子鉴定
中药
黄连属
Keywords
DNA barcoding
molecular identification
traditional Chinese herbs
Coptis
分类号
Q943 [生物学—植物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
黄连属植物DNA条形码研究
李波
刘俊
闵道长
何小慧
李波超
朱昌兰
张志勇
袁庆军
吴丁
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
4
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职称材料
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