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中国特有森林树种华山松的群体进化历史研究
被引量:
7
1
作者
王若楠
白吉庆
+4 位作者
王玛丽
阎晓昊
董鹏斌
王宁
李忠虎
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期42-51,共10页
利用现代分子群体遗传学的分析手段,对华山松27个自然群体129个个体的样本进行双亲遗传核基因AGP6片段的测序分析,检测该物种在第四纪冰期时的避难所和群体进化历史。结果表明:(1)华山松群体在AGP6基因座位上具有较高水平的核苷酸多态性...
利用现代分子群体遗传学的分析手段,对华山松27个自然群体129个个体的样本进行双亲遗传核基因AGP6片段的测序分析,检测该物种在第四纪冰期时的避难所和群体进化历史。结果表明:(1)华山松群体在AGP6基因座位上具有较高水平的核苷酸多态性,其沉默位点多样性值(πt=0.013 8,πsil=0.030 6)显著高于其他松属植物。(2)基于Bayesian聚类分析结果表明,华山松具有明显的群体遗传结构,地理分布区上能够分为中国中部和中国西南部两大区域族群,Network网络分析和系统发育分析均得到了相似的结果。(3)分子变异(AMO-VA)分析结果表明,遗传变异主要存在于群体内(65.65%)和族群间(30.18%),群体间存在较小的变异量(4.17%);物种水平和族群水平上的群体错配分析分布均呈多峰模式,说明华山松群体未经历过近期的扩张事件。(4)秦岭山脉和横断山区的群体存在较高水平的单倍型多样性和较多的特有稀有单倍型,进一步结合单倍型间的多样性关系,推测这些区域可能是华山松在第四纪冰期时期的避难所。研究认为,不同避难所地区间长期的地理隔离以及高大山脉、河流等异质性生境的形成可能促使了华山松在中国中部和西南部两大区域族群的异质性分化以及物种较高水平的核苷酸多态性。
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关键词
华山松
核苷酸多态性
遗传结构
核基因AGP6
进化历史
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职称材料
基因流存在条件下的物种形成研究述评:生殖隔离机制进化
被引量:
25
2
作者
李忠虎
刘占林
+7 位作者
王玛丽
钱增强
赵鹏
祝娟
杨一欣
阎晓昊
李银军
赵桂仿
《生物多样性》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期88-96,共9页
物种形成过程是生物多样性形成的基础,长期以来一直是进化生物学的中心议题之一。传统的异域物种形成理论认为,地理隔离是物种分化的主要决定因子,物种形成只有在种群之间存在地理隔离的情况下才能发生。近年来,随着种群基因组学的发展...
物种形成过程是生物多样性形成的基础,长期以来一直是进化生物学的中心议题之一。传统的异域物种形成理论认为,地理隔离是物种分化的主要决定因子,物种形成只有在种群之间存在地理隔离的情况下才能发生。近年来,随着种群基因组学的发展和溯祖理论分析方法的完善,种群间存在基因流情况下的物种形成成为进化生物学领域新的研究焦点。物种形成过程中是否有基因流的发生?基因流如何影响物种的形成与分化?基因流存在条件下物种形成的生殖隔离机制是什么?根据已发表的相关文献资料,作者综述了当前物种形成研究中基因流的时间和空间分布模式、基因流对物种分化的影响以及生殖隔离机制形成等问题,指出基因流存在条件下的物种形成可能是自然界普遍发生的一种模式。
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关键词
基因流
物种形成
生殖隔离
自然选择
分化选择
原文传递
题名
中国特有森林树种华山松的群体进化历史研究
被引量:
7
1
作者
王若楠
白吉庆
王玛丽
阎晓昊
董鹏斌
王宁
李忠虎
机构
西北大学生命科学学院西部资源生物与现代生物技术教育部重点实验室
陕西中医药大学药学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期42-51,共10页
基金
国家自然科学基金(41101058)
中医药公共卫生专项(财社[2011]76号
+7 种基金
201207002
财社[2012]13号
财社[2013]135号)
公益性行业科研专项(201407002)
中医药部门公共卫生服务补助资金(财社[2014]76号
财社[2015]78号
财社[2016]44号
财社[2017]66号)
文摘
利用现代分子群体遗传学的分析手段,对华山松27个自然群体129个个体的样本进行双亲遗传核基因AGP6片段的测序分析,检测该物种在第四纪冰期时的避难所和群体进化历史。结果表明:(1)华山松群体在AGP6基因座位上具有较高水平的核苷酸多态性,其沉默位点多样性值(πt=0.013 8,πsil=0.030 6)显著高于其他松属植物。(2)基于Bayesian聚类分析结果表明,华山松具有明显的群体遗传结构,地理分布区上能够分为中国中部和中国西南部两大区域族群,Network网络分析和系统发育分析均得到了相似的结果。(3)分子变异(AMO-VA)分析结果表明,遗传变异主要存在于群体内(65.65%)和族群间(30.18%),群体间存在较小的变异量(4.17%);物种水平和族群水平上的群体错配分析分布均呈多峰模式,说明华山松群体未经历过近期的扩张事件。(4)秦岭山脉和横断山区的群体存在较高水平的单倍型多样性和较多的特有稀有单倍型,进一步结合单倍型间的多样性关系,推测这些区域可能是华山松在第四纪冰期时期的避难所。研究认为,不同避难所地区间长期的地理隔离以及高大山脉、河流等异质性生境的形成可能促使了华山松在中国中部和西南部两大区域族群的异质性分化以及物种较高水平的核苷酸多态性。
关键词
华山松
核苷酸多态性
遗传结构
核基因AGP6
进化历史
Keywords
Pinus armandii
nucleotide polymorphism
genetic structure
nuclear gene AGP6
evolutionary history
分类号
Q346.3 [生物学—遗传学]
Q789 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
基因流存在条件下的物种形成研究述评:生殖隔离机制进化
被引量:
25
2
作者
李忠虎
刘占林
王玛丽
钱增强
赵鹏
祝娟
杨一欣
阎晓昊
李银军
赵桂仿
机构
新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室
西北大学生命科学学院西部资源生物与现代生物技术教育部重点实验室
陕西师范大学生命科学学院
出处
《生物多样性》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期88-96,共9页
基金
新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室开放课题(BRYB1304)
国家自然科学基金项目(41101058)
+4 种基金
陕西省教育厅科研计划项目(2013JK0713)
高等学校博士学科点专项科研基金项目(20126101120021)
西部资源生物与现代生物技术教育部重点实验室基金项目(13JS094)
西北大学优秀青年学术骨干项目(PR12146)
西北大学自然科学基金项目(12NW18)
文摘
物种形成过程是生物多样性形成的基础,长期以来一直是进化生物学的中心议题之一。传统的异域物种形成理论认为,地理隔离是物种分化的主要决定因子,物种形成只有在种群之间存在地理隔离的情况下才能发生。近年来,随着种群基因组学的发展和溯祖理论分析方法的完善,种群间存在基因流情况下的物种形成成为进化生物学领域新的研究焦点。物种形成过程中是否有基因流的发生?基因流如何影响物种的形成与分化?基因流存在条件下物种形成的生殖隔离机制是什么?根据已发表的相关文献资料,作者综述了当前物种形成研究中基因流的时间和空间分布模式、基因流对物种分化的影响以及生殖隔离机制形成等问题,指出基因流存在条件下的物种形成可能是自然界普遍发生的一种模式。
关键词
基因流
物种形成
生殖隔离
自然选择
分化选择
Keywords
gene flow, speciation, reproductive isolation, natural selection, divergent selection
分类号
Q111 [生物学—普通生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国特有森林树种华山松的群体进化历史研究
王若楠
白吉庆
王玛丽
阎晓昊
董鹏斌
王宁
李忠虎
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
7
下载PDF
职称材料
2
基因流存在条件下的物种形成研究述评:生殖隔离机制进化
李忠虎
刘占林
王玛丽
钱增强
赵鹏
祝娟
杨一欣
阎晓昊
李银军
赵桂仿
《生物多样性》
CAS
CSCD
北大核心
2014
25
原文传递
已选择
0
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