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毛竹GRF基因家族全基因组鉴定与表达分析 被引量:2
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作者 阮诗雨 张智俊 +3 位作者 陈家璐 马瑞芳 朱丰晓 刘笑雨 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期792-801,共10页
【目的】探究毛竹Phyllostachys edulis GRF基因家族的性质、结构特点以及在不同组织中的表达水平,为进一步研究GRF在毛竹生长发育中的分子作用机制奠定基础。【方法】采用生物信息学方法,对毛竹全基因组和转录组信息进行分析,筛选出13... 【目的】探究毛竹Phyllostachys edulis GRF基因家族的性质、结构特点以及在不同组织中的表达水平,为进一步研究GRF在毛竹生长发育中的分子作用机制奠定基础。【方法】采用生物信息学方法,对毛竹全基因组和转录组信息进行分析,筛选出13个毛竹GRF基因家族成员,并对GRF基因家族的理化性质、进化、基因结构、保守结构域、启动子、基因家族表达模式及三级结构进行分析。【结果】毛竹GRF基因家族成员按照其在scaffold上分布的位置,分别被命名为PeGRF01~PeGRF13;将含有3个内含子的PeGRF04和PeGRF12归为非ε组,其余为ε组。毛竹各GRF基因家族成员理化性质存在一定的差异,但是其结构域相对保守,均含有14/3/3结构域。毛竹GRF家族启动子区含有大量与光响应、低温响应、激素调控等相关的顺式作用元件。毛竹GRF存在基因复制扩增的现象,与水稻Oryza sativa的共线性关系明显高于拟南芥Arabidopsis thaliana。毛竹GRF在不同组织器官中均有表达,各家族成员的表达量存在差异;在毛竹花和根组织中的表达量略高于叶和鞭,同时家族成员间的表达量也存在一定差异。GRF蛋白质由2个单体构成,每个单体由9个α-螺旋构成,整体结构呈"W"型。【结论】毛竹GRF基因家族具有典型的14/3/3结构域,可能参与根、鞭、叶、花序及笋芽的生长发育过程。图6表1参39。 展开更多
关键词 毛竹 GRF基因家族 系统进化 共线性 基因表达水平
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俄罗斯应对金融制裁的金融政策逻辑分析 被引量:1
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作者 边卫红 阮诗雨 《清华金融评论》 2023年第2期57-60,共4页
本文梳理了俄罗斯应对金融制裁的金融政策逻辑,分析应对金融制裁措施的市场表现和后续效应,比较俄罗斯在2014年和2022年金融制裁下的应对异同,分析大国博奔背景下新兴经济体从全局出发,统筹规划,防范金融制裁及应对外部冲击的方案,探索... 本文梳理了俄罗斯应对金融制裁的金融政策逻辑,分析应对金融制裁措施的市场表现和后续效应,比较俄罗斯在2014年和2022年金融制裁下的应对异同,分析大国博奔背景下新兴经济体从全局出发,统筹规划,防范金融制裁及应对外部冲击的方案,探索具有本国特色、维护金融安全的路径。 展开更多
关键词 外部冲击 金融制裁 新兴经济体 金融安全 后续效应 统筹规划 俄罗斯 逻辑分析
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毛竹GMD基因家族全基因组鉴定与表达分析
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作者 阮诗雨 张智俊 +3 位作者 陈家璐 马瑞芳 朱丰晓 刘笑雨 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2021年第2期459-468,共10页
GDP-甘露糖4,6-脱水酶(GDP-mannose 4,6-dehydratase, GMD)是生物体内参与多糖合成代谢的一个重要基因。本研究利用毛竹全基因组和转录组数据信息,对GMD基因家族进行细致分析,共鉴定出39个家族成员。毛竹GMD各家族基因的理化性质有一定... GDP-甘露糖4,6-脱水酶(GDP-mannose 4,6-dehydratase, GMD)是生物体内参与多糖合成代谢的一个重要基因。本研究利用毛竹全基因组和转录组数据信息,对GMD基因家族进行细致分析,共鉴定出39个家族成员。毛竹GMD各家族基因的理化性质有一定差异,但所含甘露糖4,6脱水酶结构域进化相对保守。进化树分析将毛竹GMD基因家族分为3大类。该家族基因上游启动子序列存在多种光响应、环境胁迫、激素应答等有关顺式作用元件。同源模建显示毛竹GMD为同源二聚体蛋白质,两个亚基均有相同或催化功能。转录组数据分析发现,部分成员GMD基因在竹笋生长阶段基因高表达特征明显,表明其可能参与笋的生长发育。另外,GMD的表达受到不同激素的影响。本研究通过对GMD基因的生物信息学分析,有利于进一步明确毛竹GMD基因的功能及其在岩藻糖生物合成途径中的作用。 展开更多
关键词 毛竹(Phyllostachys edulis) GMD基因家族 系统进化 共线性 基因表达
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