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基于OpenMP的Winograd并行矩阵乘算法应用研究
被引量:
2
1
作者
阳光亮
李鸿健
+1 位作者
豆育升
唐红
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2012年第7期2435-2437,2441,共4页
为了提高半经典分子动力学模拟中矩阵乘法效率,通过一种稀疏矩阵分解方法化简矩阵乘法,基于OpenMP实现矩阵相乘的Winograd并行算法。该算法将Winograd算法中各部分依次采用OpenMP并行计算,降低了数据通信。在16核服务器上测试表明,该方...
为了提高半经典分子动力学模拟中矩阵乘法效率,通过一种稀疏矩阵分解方法化简矩阵乘法,基于OpenMP实现矩阵相乘的Winograd并行算法。该算法将Winograd算法中各部分依次采用OpenMP并行计算,降低了数据通信。在16核服务器上测试表明,该方法能够显著提高半经典分子动力学模拟中矩阵乘法效率,并行加速比能够达到9.47,并具有良好的可扩展性,为大分子体系的模拟提供了可能。
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关键词
分子动力学
矩阵乘
Winograd
并行计算
加速比
OPENMP
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职称材料
题名
基于OpenMP的Winograd并行矩阵乘算法应用研究
被引量:
2
1
作者
阳光亮
李鸿健
豆育升
唐红
机构
重庆邮电大学高性能计算与应用研究所
出处
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2012年第7期2435-2437,2441,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(21073242)
文摘
为了提高半经典分子动力学模拟中矩阵乘法效率,通过一种稀疏矩阵分解方法化简矩阵乘法,基于OpenMP实现矩阵相乘的Winograd并行算法。该算法将Winograd算法中各部分依次采用OpenMP并行计算,降低了数据通信。在16核服务器上测试表明,该方法能够显著提高半经典分子动力学模拟中矩阵乘法效率,并行加速比能够达到9.47,并具有良好的可扩展性,为大分子体系的模拟提供了可能。
关键词
分子动力学
矩阵乘
Winograd
并行计算
加速比
OPENMP
Keywords
molecular dynamics(MD)
matrix multiplication
Winograd
parallel computing
speedup ratio
OpenMP
分类号
TP391.9 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于OpenMP的Winograd并行矩阵乘算法应用研究
阳光亮
李鸿健
豆育升
唐红
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2012
2
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