本研究旨在鉴定河流型水牛中转化生长因子-β(transforming growth factor-β,TGF-β)基因家族成员,分析该家族成员在胚胎发育早期的表达情况,并讨论其可能的作用。根据人类中已鉴定的TGF-β基因家族信息,通过BLASTP在河流型水牛全基因...本研究旨在鉴定河流型水牛中转化生长因子-β(transforming growth factor-β,TGF-β)基因家族成员,分析该家族成员在胚胎发育早期的表达情况,并讨论其可能的作用。根据人类中已鉴定的TGF-β基因家族信息,通过BLASTP在河流型水牛全基因组层面鉴定TGF-β家族成员,同时对牛、山羊和小鼠的TGF-β家族信息进行鉴定,结合5个物种中的TGF-β基因家族信息构建系统进化树。根据河流型水牛胚胎发育早期4个阶段(2-细胞、8-细胞、桑椹胚和囊胚期)的RNA-seq数据分析,通过FPKM(Fragment of Per Kilobase of exon model per Million mapped reads)值计算TGF-β家族成员的表达情况。结果显示,根据人类中的33个TGF-β基因,分别在河流型水牛、牛、山羊和小鼠的基因组中鉴定出32、23、32和26个TGF-β基因,几个物种中TGF-β基因家族成员数量相近且在系统进化树中分布均匀,说明该家族在各个物种中具有分布和功能的保守性。在河流型水牛的32个TGF-β基因中,21个TGF-β基因家族成员在胚胎发育早期不表达或极低剂量表达,6个分化抑制因子低剂量表达,5个高表达的TGF-β基因均有报道过与繁殖过程相关,说明在河流型水牛的胚胎发育早期只有部分成员(5/32)参与其中行使功能,绝大多数的TGF-β基因(27/32)并没有参与其中。本研究结果为河流型水牛中TGF-β基因家族研究提供了数据基础,并为TGF-β基因家族在胚胎发育早期的功能研究提供了理论依据。展开更多
为了阐明水牛信号转导子和转录激活子4(signal transducer and activator of transcription 4,STAT4)基因在水牛卵泡、胚胎发生及泌乳调节过程中的作用及分子机制,本试验采用了3′-RACE克隆获得STAT4基因,并对其核苷酸序列和蛋白质序列...为了阐明水牛信号转导子和转录激活子4(signal transducer and activator of transcription 4,STAT4)基因在水牛卵泡、胚胎发生及泌乳调节过程中的作用及分子机制,本试验采用了3′-RACE克隆获得STAT4基因,并对其核苷酸序列和蛋白质序列进行了信息学分析,通过构建其真核表达载体并转染HEK293T细胞验证所构建载体的准确性。结果表明,水牛STAT4基因编码区长2 247bp,3′-UTR区长268bp,编码748个氨基酸。BLAST分析显示,水牛STAT4核苷酸序列与牛、山羊、绵羊、猪、马、犬和人相应序列的同源性分别为99%、99%、99%、95%、93%、93%和92%,系统进化树分析结果表明,STAT4基因在不同物种及进化的过程中具有高度保守性。蛋白质分析结果表明,STAT4蛋白呈弱酸性,无信号肽,定位于细胞质,存在STAT_int、STAT_alpha、STAT_bind和SH2_STAT4等结构域。microRNA靶标预测显示bta-miR-200a、bta-miR-2429和bta-miR-2410等为STAT4 3′-UTR潜在microRNAs。试验成功构建了水牛STAT4基因真核表达载体pEGFPN1-STAT4,转染HEK293T后产生较强的绿色荧光信号,表明能够形成STAT4-EGFP融合蛋白。展开更多
为探讨不同融合参数对猪手工克隆(HMC)重构胚发育效果的影响。本试验比较了胞质与胞质之间不同黏合方式以及不同的电融合参数对融合效率的影响,以及融合参数对HMC重构胚胎发育的影响。结果表明,卵-供体-卵的黏合方式有利于提高胞质的融...为探讨不同融合参数对猪手工克隆(HMC)重构胚发育效果的影响。本试验比较了胞质与胞质之间不同黏合方式以及不同的电融合参数对融合效率的影响,以及融合参数对HMC重构胚胎发育的影响。结果表明,卵-供体-卵的黏合方式有利于提高胞质的融合率;融合参数3(2 k V/cm,80μs,1次)和参数4(2.2 k V/cm,80μs,1次)的对胞质的融合率显著高于其他参数,两个参数对HMC重构胚卵裂率的影响差异不显著,而参数3的囊胚率以及囊胚细胞总数显著高于参数4。参数3更适合用于HMC重构胚的融合,并能提高重构胚的囊胚发育率以及囊胚的细胞个数。展开更多
文摘本研究旨在鉴定河流型水牛中转化生长因子-β(transforming growth factor-β,TGF-β)基因家族成员,分析该家族成员在胚胎发育早期的表达情况,并讨论其可能的作用。根据人类中已鉴定的TGF-β基因家族信息,通过BLASTP在河流型水牛全基因组层面鉴定TGF-β家族成员,同时对牛、山羊和小鼠的TGF-β家族信息进行鉴定,结合5个物种中的TGF-β基因家族信息构建系统进化树。根据河流型水牛胚胎发育早期4个阶段(2-细胞、8-细胞、桑椹胚和囊胚期)的RNA-seq数据分析,通过FPKM(Fragment of Per Kilobase of exon model per Million mapped reads)值计算TGF-β家族成员的表达情况。结果显示,根据人类中的33个TGF-β基因,分别在河流型水牛、牛、山羊和小鼠的基因组中鉴定出32、23、32和26个TGF-β基因,几个物种中TGF-β基因家族成员数量相近且在系统进化树中分布均匀,说明该家族在各个物种中具有分布和功能的保守性。在河流型水牛的32个TGF-β基因中,21个TGF-β基因家族成员在胚胎发育早期不表达或极低剂量表达,6个分化抑制因子低剂量表达,5个高表达的TGF-β基因均有报道过与繁殖过程相关,说明在河流型水牛的胚胎发育早期只有部分成员(5/32)参与其中行使功能,绝大多数的TGF-β基因(27/32)并没有参与其中。本研究结果为河流型水牛中TGF-β基因家族研究提供了数据基础,并为TGF-β基因家族在胚胎发育早期的功能研究提供了理论依据。
文摘为了阐明水牛信号转导子和转录激活子4(signal transducer and activator of transcription 4,STAT4)基因在水牛卵泡、胚胎发生及泌乳调节过程中的作用及分子机制,本试验采用了3′-RACE克隆获得STAT4基因,并对其核苷酸序列和蛋白质序列进行了信息学分析,通过构建其真核表达载体并转染HEK293T细胞验证所构建载体的准确性。结果表明,水牛STAT4基因编码区长2 247bp,3′-UTR区长268bp,编码748个氨基酸。BLAST分析显示,水牛STAT4核苷酸序列与牛、山羊、绵羊、猪、马、犬和人相应序列的同源性分别为99%、99%、99%、95%、93%、93%和92%,系统进化树分析结果表明,STAT4基因在不同物种及进化的过程中具有高度保守性。蛋白质分析结果表明,STAT4蛋白呈弱酸性,无信号肽,定位于细胞质,存在STAT_int、STAT_alpha、STAT_bind和SH2_STAT4等结构域。microRNA靶标预测显示bta-miR-200a、bta-miR-2429和bta-miR-2410等为STAT4 3′-UTR潜在microRNAs。试验成功构建了水牛STAT4基因真核表达载体pEGFPN1-STAT4,转染HEK293T后产生较强的绿色荧光信号,表明能够形成STAT4-EGFP融合蛋白。
文摘为探讨不同融合参数对猪手工克隆(HMC)重构胚发育效果的影响。本试验比较了胞质与胞质之间不同黏合方式以及不同的电融合参数对融合效率的影响,以及融合参数对HMC重构胚胎发育的影响。结果表明,卵-供体-卵的黏合方式有利于提高胞质的融合率;融合参数3(2 k V/cm,80μs,1次)和参数4(2.2 k V/cm,80μs,1次)的对胞质的融合率显著高于其他参数,两个参数对HMC重构胚卵裂率的影响差异不显著,而参数3的囊胚率以及囊胚细胞总数显著高于参数4。参数3更适合用于HMC重构胚的融合,并能提高重构胚的囊胚发育率以及囊胚的细胞个数。
