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在不同物理化学条件下天花粉蛋白的圆二色性研究 被引量:4
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作者 陈世芝 许文清 董北 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 1989年第2期107-113,共7页
用圆二色谱研究了天花粉蛋白在酸性和碱性溶液中的构象,并观察了在十二烷基磺酸钠(SDS)溶液中天花粉蛋白分子构象的变化,用Chen,Yang与Martinez等人的方法计算了各种条件下天花粉蛋白二级结构含量.结果表明:在很宽广的pH范围内(从pH2到p... 用圆二色谱研究了天花粉蛋白在酸性和碱性溶液中的构象,并观察了在十二烷基磺酸钠(SDS)溶液中天花粉蛋白分子构象的变化,用Chen,Yang与Martinez等人的方法计算了各种条件下天花粉蛋白二级结构含量.结果表明:在很宽广的pH范围内(从pH2到pH12)分子构象基本上是稳定的.但是,在强碱性条件下即pH>12(室温)或pH11.5(40℃)螺旋含量显著减少.在碱性条件下,于250nm附近出现一新的CD带,它的强度与离解的酪氨酸残基个数呈线性关系,说明这一新带主要是由离解的酪氨酸残基产生的. 展开更多
关键词 天花粉蛋白 分子构象 圆二色性
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微重力下天花粉蛋白晶体生长初探 被引量:2
2
作者 陈世芝 桂璐璐 +2 位作者 牛秀田 谢殿霖 毕汝昌 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 1990年第1期91-95,共5页
报导了国内首次在微重力下进行蛋白质晶体生长的试验.与地面对照实验所生长的晶体相比较,在空间生长的多数天花粉蛋白晶体具有较完整的外形,初步展示了微重力条件对蛋白质晶体生长所具有的优越性.
关键词 微重力 花粉 蛋白晶体
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蛋白质晶体中的分子堆砌与晶体生长 被引量:1
3
作者 陈世芝 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1990年第6期416-421,共6页
根据蛋白质晶体结构研究的结果,阐述了蛋白质晶体中分子堆砌模式和分子间的相互作用;并讨论了某些因素对分子堆砌及结晶的影响。
关键词 蛋白质晶体 分子堆砌 晶体生长
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α-苦瓜子蛋白和β-苦瓜子蛋白紫外光谱的研究
4
作者 陈世芝 徐薇 +1 位作者 王耀萍 董贻诚 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 1995年第1期16-20,共5页
对α-mmc及β-mmc进行了溶剂微扰差光谱的研究及在不同温度条件下的光谱滴定,结合最新得到的α-mmc的晶体结构进行了分析和讨论,并与天花粉蛋白的紫外光谱进行了比较。
关键词 α苦瓜子蛋白 β苦瓜子蛋白 紫外光谱
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某市公共场所女性从业人员安全套使用调查 被引量:4
5
作者 童明德 贾虹 +2 位作者 邓建国 陈世芝 江晓英 《预防医学情报杂志》 CAS 2002年第5期434-436,共3页
关键词 公共场所 妓女 避孕套
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α-苦瓜子蛋白晶体结构中的次级相互作用的研究──Ⅰ结构中氢键相互作用的分析 被引量:1
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作者 王耀萍 陈世芝 +1 位作者 董贻诚 任景山 《生物物理学报》 CSCD 北大核心 1994年第1期19-28,共10页
α-苦瓜子蛋白是一种单链核糖体失活蛋白,具有N-糖苷酶活性,2.0A分辨率的三维结构已经测定。α-苦瓜子蛋白中总共有353个氢键,其中主链原子间氢键165个,主链原子与侧链原子间氢键54个,侧链原子间氢键21个,蛋白... α-苦瓜子蛋白是一种单链核糖体失活蛋白,具有N-糖苷酶活性,2.0A分辨率的三维结构已经测定。α-苦瓜子蛋白中总共有353个氢键,其中主链原子间氢键165个,主链原子与侧链原子间氢键54个,侧链原子间氢键21个,蛋白分子中原子与溶水剂的氢键113个,主链C=O,主链NH及侧链分子结构中有95%的残基能生成氢键,Asp.Glu、Asn、Gln具有较强的生成多个氢键的能力,并对13个没有任何氢键的残基作了分析。An、Leu、Ile、GlU、Gln在α螺旋中出现税率较大,Val、Leu、Tyr、Ile、Thr在β结构中占了一半以上,Arg容易形成远程的氢键,而Ser、Thr则容易形成近程氢键。某些氢键,特别是保守残基间的氢键,对形成蛋白分子局部特征构象和活性部位的特征构象有影响,α-苦瓜子蛋白的特定折叠方式对其与溶剂水分子成氢键有影响。 展开更多
关键词 α-苦瓜子蛋白 氢键
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α-苦瓜子蛋白晶体结构中的次级相互作用的研究Ⅱ疏水相互作用的分析
7
作者 董贻诚 陈世芝 +1 位作者 朱曰荣 王耀萍 《生物物理学报》 CSCD 北大核心 1996年第1期21-26,共6页
α-苦瓜子蛋白结构模型中共有疏水残基141个,占践基总数的57%。其中128个疏水残基有相互作用,占疏水残基的91%。疏水残基之间的相互作用与其是否在α-螺旋或β片层内没有多大关系。本文着重分析了α-螺旋间和α螺旋与... α-苦瓜子蛋白结构模型中共有疏水残基141个,占践基总数的57%。其中128个疏水残基有相互作用,占疏水残基的91%。疏水残基之间的相互作用与其是否在α-螺旋或β片层内没有多大关系。本文着重分析了α-螺旋间和α螺旋与β结构之间的疏水相互作用;讨论了α5和大β片层中疏水残基与亲本残基的分布特点,这一特点对该蛋白分子最后折叠成特定的空间结构有重要影响。类似的情况在同源蛋白天花粉蛋白中也是存在的。 展开更多
关键词 α-苦瓜子蛋白 疏水相互作用 晶体结构
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牛凝乳酶的结晶及其二硫键的化学修饰 被引量:2
8
作者 黄葵 陈世芝 杨开宇 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 1991年第1期77-83,共7页
为了配合凝乳酶的蛋白质工程,围绕酶的纯化,结晶和二硫键的化学修饰进行了研究。实验结果表明采用FPLC Mono Q柱代替DEAE-纤维素柱层析可以提高同工酶A,B及其降解组分C的分离效果并缩短纯化时间。以10mg/ml的纯凝乳酶B为出发材料,在4℃... 为了配合凝乳酶的蛋白质工程,围绕酶的纯化,结晶和二硫键的化学修饰进行了研究。实验结果表明采用FPLC Mono Q柱代替DEAE-纤维素柱层析可以提高同工酶A,B及其降解组分C的分离效果并缩短纯化时间。以10mg/ml的纯凝乳酶B为出发材料,在4℃1.4—2.0mol/L氯化钠条件下进行培养可以获得外形近似为正立方体晶体。化学修饰的结果证明,凝乳酶的三对二硫键处于酶分子不同的空间部位。0.72mmol/L DTT在pH6.3条件下能还原处于分子表面的一对二硫键,经溴化氰降解分肽测定为Cys^(250)-Cys^(283),还原后引起活力下降25%。在二硫键之间引入汞原子其活力与还原酶,羧甲基化酶的活力大体相同,说明Cys^(250)-Cys^(283)在维持凝乳酶具有活力的空间构象中起着一定的作用。 展开更多
关键词 牛凝乳酶 二硫键 化学修饰
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因地制宜创建和巩固爱婴医院
9
作者 童明德 张永志 陈世芝 《中国妇幼保健》 CAS 2000年第2期87-87,共1页
关键词 爱婴行动 医院 创建 因地制宜
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空间里的蛋白质晶体生长
10
作者 桂璐璐 师珂 +7 位作者 王耀萍 陈世芝 韩青 胡永林 牛秀田 沈福苓 徐薇 毕汝昌 《中国航天》 北大核心 1992年第12期4-6,共3页
生物大分子晶体生长具有重要的理论和实际意义。空间微重力环境是研究复杂的蛋白质结晶过程和生长其高质量晶体的理想地方。1992年8月,应用国内研制的装置在返回式卫星FSW—2上完成了空间蛋白质晶体生长实验。有六种蛋白质在空间长出了... 生物大分子晶体生长具有重要的理论和实际意义。空间微重力环境是研究复杂的蛋白质结晶过程和生长其高质量晶体的理想地方。1992年8月,应用国内研制的装置在返回式卫星FSW—2上完成了空间蛋白质晶体生长实验。有六种蛋白质在空间长出了晶体,其中酸性磷脂酶A_2和溶菌酶的晶体明显优于地面对照实验长出的晶体。对结果的分析还在进行中。 展开更多
关键词 晶体生长 蛋白质 微重力
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优化运力结构是发展内河航运的根本途径——浅析柳州地区水上运力的现状、趋势及发展对策
11
作者 卓春应 陈世芝 《珠江水运》 1998年第9期26-27,共2页
在今年广西区发生的几起翻船死人事故中,大多数是“三无”船舶。为了通过这些事故吸取教训,柳州地区交通局、航管处,在积极推广泡沫塑料救生包的同时,集中力量加大对“三无”客圩渡、横水渡的整治力度。他们同港监处通力合作,深入检查... 在今年广西区发生的几起翻船死人事故中,大多数是“三无”船舶。为了通过这些事故吸取教训,柳州地区交通局、航管处,在积极推广泡沫塑料救生包的同时,集中力量加大对“三无”客圩渡、横水渡的整治力度。他们同港监处通力合作,深入检查和调查“三元” 展开更多
关键词 内河航运 水上运力 运力结构
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微重力下的蛋白质晶体生长 被引量:8
12
作者 毕汝昌 桂璐璐 +13 位作者 师珂 王耀萍 陈世芝 韩青 胡永林 沈福苓 牛秀田 华子千 卢光莹 张健 李松林 龚为民 牛立文 黄其辰 《中国科学(B辑)》 CSCD 北大核心 1993年第11期1153-1157,共5页
空间微重力环境是研究复杂的蛋白质结晶过程和生长高质量蛋白质晶体的理想地方。于1992年8月应用国内研制的装置,在返回式卫星FSW-2上完成了空间蛋白质晶体生长实验。有6种蛋白质在空间长出了晶体,其中蛇毒酸性磷脂酶A_2和鸡蛋清溶菌酶... 空间微重力环境是研究复杂的蛋白质结晶过程和生长高质量蛋白质晶体的理想地方。于1992年8月应用国内研制的装置,在返回式卫星FSW-2上完成了空间蛋白质晶体生长实验。有6种蛋白质在空间长出了晶体,其中蛇毒酸性磷脂酶A_2和鸡蛋清溶菌酶的晶体明显优于地面对照实验长出的晶体,表明空间的微重力利于改进蛋白质晶体的大小、完整性、形态及内部有序性。 展开更多
关键词 晶体生长 蛋白 微重力
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Q156A天花粉蛋白的晶体结构研究 被引量:1
13
作者 董贻诚 朱日荣 +2 位作者 陈世芝 李建辉 邵鹏柱 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 1997年第13期1388-1391,共4页
核糖体失活蛋白(RIPs)是一类具有RNA N-糖苷酶活性的毒蛋白,它水解真核细胞28SrRNA第4324位腺苷酸的N-糖苷键,释放出一个腺嘌吟碱基,使核糖体失活。天花粉蛋白(TCS)是单链核糖体失活蛋白的重要代表。我们早已报道了天花粉蛋白0.173n... 核糖体失活蛋白(RIPs)是一类具有RNA N-糖苷酶活性的毒蛋白,它水解真核细胞28SrRNA第4324位腺苷酸的N-糖苷键,释放出一个腺嘌吟碱基,使核糖体失活。天花粉蛋白(TCS)是单链核糖体失活蛋白的重要代表。我们早已报道了天花粉蛋白0.173nm分辨率的晶体结构。关于天花粉蛋白结构与功能关系的深入研究,已经发表了天花粉蛋白与底物类似物的复合物晶体结构。我们还对一些保守残基的突变体进行了研究,其中R22LTCS和Y14F TCS的晶体结构已经测定,Arg22和Tyr14是位于活性口袋外,但与活性口袋又有密切联系的保守残基,其侧链形成的氢键也十分保守。在TCS晶体结构中还有一类保守残基形成的氢(盐)键也是十分保守的,它们是处于活性口袋之内的残基形成的,如Q156的NH_2与E189的OE2,Y111的OH与E160的OE2,R122的NH_2与E189的OE1等。为了探讨活性口袋内这些保守氢键对活性部位构象和活性的影响,我们用基因定位突变方法。 展开更多
关键词 突变体 晶体结构 天花粉蛋白 核糖体失活蛋白
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天花粉蛋白1.73分辨率结构测定及其精化 被引量:5
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作者 高奔 马星奇 +3 位作者 王耀萍 吴伸 陈世芝 董贻诚 《中国科学(B辑)》 CSCD 北大核心 1993年第3期272-282,共11页
本文报道了用面探测器收集一套1.73分辨率天花粉蛋白(TCS)正交晶体的X射线衍射数据,利用已知的α苦瓜子蛋白模型,取10—4范围的TCS强度数据,应用分子置换法测定了晶体结构,并且采用限制参数最小二乘法在10—1.73分辨率范围内修正模型... 本文报道了用面探测器收集一套1.73分辨率天花粉蛋白(TCS)正交晶体的X射线衍射数据,利用已知的α苦瓜子蛋白模型,取10—4范围的TCS强度数据,应用分子置换法测定了晶体结构,并且采用限制参数最小二乘法在10—1.73分辨率范围内修正模型结构。修正结果,晶体学R因子为0.186,键长标准偏差为0.013,键角标准偏差为2.48°,一个不对称单位中找到133个水分子。本文详细描述了天花粉蛋白分子的结构、温度因子、氢键、结合水、保守残基的分布以及分子间相互作用。保守残基14Tyr的羟基与157位的羰基氧形成的氢键,对维持活性部位构象有重要作用;保守残基160Glu和它在活性部位的构象对酶的催化活性起着关键性作用。 展开更多
关键词 晶体结构 分辨率 天花粉蛋白
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1.73分辨率天花粉蛋白晶体中的水结构
15
作者 高奔 马星奇 +3 位作者 王耀萍 吴伸 陈世芝 董贻诚 《中国科学(B辑)》 CSCD 北大核心 1994年第1期48-56,共9页
本文报道的天花粉蛋白晶体中水的结构模型,包括了133个水分子,其中118个同蛋白的原子成氢键。天花粉蛋白内部有4个分立的水分子,其中2个水分子W251和W252分剔与A5螺旋变形部位的残基156Gln和157Ser的侧链成氢键,对维持活性部位的构象有... 本文报道的天花粉蛋白晶体中水的结构模型,包括了133个水分子,其中118个同蛋白的原子成氢键。天花粉蛋白内部有4个分立的水分子,其中2个水分子W251和W252分剔与A5螺旋变形部位的残基156Gln和157Ser的侧链成氢键,对维持活性部位的构象有贡献。晶体中水结构的比较结果表明,核糖体接近蛋白时,会诱导蛋白活性部位残基的构象发生变化,使各催化基团按催化效果最佳的构象排布,并激活一个水分子(W257)直接参与核糖体失活作用。 展开更多
关键词 天花粉 结构 核糖 蛋白 晶体
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Protein Crystal Growth in Microgravity 被引量:1
16
作者 毕汝昌 桂璐璐 +13 位作者 师珂 王耀萍 陈世芝 韩青 胡永林 沈福苓 牛秀田 华子谦 卢光莹 张健 李松林 龚为民 牛立文 黄其辰 《Science China Chemistry》 SCIE EI CAS 1994年第10期1185-1191,共7页
Protein crystal growth is quite important for the determination of protein structureswhich are essential to the understanding of life at molecular level as well as to the development of molecu-lar biotechnology.The mi... Protein crystal growth is quite important for the determination of protein structureswhich are essential to the understanding of life at molecular level as well as to the development of molecu-lar biotechnology.The microgravity environment of space is an ideal place to study the complicated pro-tein crystallization and to grow good-quality protein crystals.A number of crystal-growth experiments of10 different proteins were carried out in August,1992 on the Chinese re-entry satellite FSW-2 in spaceusing a tube crystallization equipment made in China.A total of 25 samples from 6 proteins producedcrystals,and the effects of microgravity on protein crystal growth were observed,especially for an acidicphospholipase A2 and henegg-white lysozyme which gave better crystals in space than earth-grown crys-tals in ground control experiments.The results have shown that the microgravity in space favors the im-provement of the size,perfection,morphology and internal order of the grown protein crytals. 展开更多
关键词 PROTEINS CRYSTAL GROWTH MICROGRAVITY EFFECT
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PRELIMINARY CRYSTALLOGRAPHIC REFINEMENT OF THE C2 CRYSTAL FORM OF TRICHOSANTHIN
17
作者 吴伸 张学军 +2 位作者 王家槐 董贻诚 陈世芝 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 1988年第20期1743-1744,共2页
Trichosanthin is an efficacious Chinese medicine for terminating pregnancy and inhibiting trophoblastic tumours. It is extracted from the root tuber of trichosanthes kirilowii, cucurbitaceae. Sequence homology studies... Trichosanthin is an efficacious Chinese medicine for terminating pregnancy and inhibiting trophoblastic tumours. It is extracted from the root tuber of trichosanthes kirilowii, cucurbitaceae. Sequence homology studies and rabbit retiulocyte cell-free system experiments have shown that trichosanthin belongs to type Ⅰ ribosome-inactivating protein (RIP). Its crystal structure at atomic resolution has been reported in the previous paper. Here we report our preliminary crystal- 展开更多
关键词 trophoblastic RIBOSOME rabbit PRELIMINARY TUBER belongs inhibiting HOMOLOGY FORM REFINEMENT
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Refined Structure of Trichosanthin at 1. 73 A Resolution
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作者 高奔 马星奇 +3 位作者 王耀萍 陈世芝 吴伸 董贻诚 《Science China Chemistry》 SCIE EI CAS 1994年第1期59-73,共15页
An X-ray reflection data set of the orthorhombic crystal of Trichosanthin(TCS) at 1. 73 A resolution had been collected using the area detector. We determined TCS crystal structure by the molecular replacement method ... An X-ray reflection data set of the orthorhombic crystal of Trichosanthin(TCS) at 1. 73 A resolution had been collected using the area detector. We determined TCS crystal structure by the molecular replacement method using the data of the known α-momorcharin model and TCS intensities , and then TGS structure refinement at 1. 73 A resolution was performed with the restrained least-squares refinement. A final R-factor of 0.186 was obtained with a model obeying standard geometry within 0. 013A in bond lengths and 2. 48° in bond angles. The final model contains 133 solvent molecules in the asymmetric unit. This paper gives a detailed description of TCS molecular structure, temperature factors, hydrogen bonds, bound water, the distribution of conserved residues and the interactions between the TCS molecules. The hydrogen bond between the hydroxyl group of conserved residue 14Tyr and O157 plays an important role in maintaining the active site conformation. Conserved residue 160Glu and its conformation at 展开更多
关键词 TRICHOSANTHIN MOLECULAR REPLACEMENT method LEAST-SQUARES refinement.
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Water Structure in Trichosanthin Crystal at 1.73Resolution
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作者 高奔 马星奇 +3 位作者 王耀萍 陈世芝 吴伸 董贻诚 《Science China Chemistry》 SCIE EI CAS 1994年第10期1222-1233,共12页
The water-structure model in Trichosanthin crystal is presented,and 133 water moleculesare included and 118 water molecules are hydrogen-bonded to protein.In the interior of Trichosanthin,thereare four discrete intern... The water-structure model in Trichosanthin crystal is presented,and 133 water moleculesare included and 118 water molecules are hydrogen-bonded to protein.In the interior of Trichosanthin,thereare four discrete internal water molecules,among which two water molecules W251 and W252 are separated-ly hydrogen-bonded to the side-chain groupsof 156Gln and 157Ser in the distorted segment of A5 helix andplay a role in maintaining the conformation of the active site.The comparative result of water structures incrystals indicates that when approaching the protein,the ribosome induces a conformational change in theresidues of the active site,which leads to an appropriate alignment of catalytic groups as well as the optimalconformation for the catalysis,and activates a water molecule (W257) to participate in the ribosome inactiva-tion. 展开更多
关键词 TRICHOSANTHIN WATER structure RIBOSOME INACTIVATION
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