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基于蒙特卡罗模拟散射效应和异质性对高剂量率192Ir近距离治疗剂量分布的影响
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作者 李磊 陈斌 +1 位作者 陈仁金 杨波 《现代肿瘤医学》 CAS 2024年第3期508-513,共6页
目的:探究散射效应和异质性对高剂量率192Ir近距离治疗剂量分布的影响。方法:用MCNP5蒙特卡罗方法模拟Flexisource HDR192Ir放射源的TG-43剂量学参数:剂量率常数Λ、径向剂量函数g(r)、各向异性函数F(r,θ)。基于临床分别构建身体围度... 目的:探究散射效应和异质性对高剂量率192Ir近距离治疗剂量分布的影响。方法:用MCNP5蒙特卡罗方法模拟Flexisource HDR192Ir放射源的TG-43剂量学参数:剂量率常数Λ、径向剂量函数g(r)、各向异性函数F(r,θ)。基于临床分别构建身体围度差异、偏心、浅表三种非完全散射和组织成分差异、肺插植、腔道插植三种异质性的简化模型,分别计算放射源的径向剂量分布,并通过比较各简化模型和标准模型的同点径向剂量的偏差来评价散射效应和异质性对剂量分布的影响。结果:Λ、g(r)和F(r,θ)模拟值和TPS数据的偏差均小于1%;非完全散射:TPS高估2 cm、5 cm、10 cm处的真实剂量可达约4%、14.8%、16.4%;皮质骨:TPS高估2 cm、5cm、10 cm处的真实剂量约0.7%、1.14%、10%;肿瘤介质:TPS高估真实剂量平均约1.1%;肺介质:TPS高估0.5 cm~6 cm内的真实剂量平均约1.80%,低估6 cm~15 cm内的真实剂量平均约7.77%;肺插植:半径1 cm肿瘤,TPS高估0.5 cm~8 cm内的真实剂量平均约4%,低估8 cm~15 cm内的真实剂量平均约7.8%;腔道插植:半径为1 mm、4 mm、8 mm腔道,TPS低估真实剂量平均约0.75%、1.30%、2.48%。结论:忽略散射效应和异质性会引入显著的剂量误差。临床治疗时,校正患者真实的剂量分布是必要的。 展开更多
关键词 192IR 近距离治疗 蒙特卡罗 剂量学
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中国荷斯坦牛IL8基因遗传多态性与泌乳性状以及体细胞评分的关联 被引量:9
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作者 陈仁金 杨章平 +6 位作者 毛永江 陈莹 常玲玲 冀德君 吴海涛 李云龙 李锐 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期1256-1262,共7页
以上海某奶牛场30个公牛家系的610头中国荷斯坦牛为试验材料,采用聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)技术对Interleukin-8(IL8)基因的遗传多态性进行了分析,采用混合动物模型分析了IL8基因突变位点与测定日产奶量、测定日乳脂率... 以上海某奶牛场30个公牛家系的610头中国荷斯坦牛为试验材料,采用聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)技术对Interleukin-8(IL8)基因的遗传多态性进行了分析,采用混合动物模型分析了IL8基因突变位点与测定日产奶量、测定日乳脂率、测定日乳蛋白率、305d校正产奶量、305d乳脂量、305d乳蛋白量及测定日体细胞评分7个性状的相关性,寻找可用于生产实际的分子标记。共检测到KK、KA和AA3种基因型,频率分别为0.187、0.451和0.362,等位基因K和A的频率分别为0.412和0.588。该位点突变对测定日产奶量、305d乳蛋白量、305d校正产奶量和305d乳脂量以及体细胞评分影响达到极显著水平(P<0.01),对测定日乳蛋白率的影响达到显著水平(P<0.05),对测定日乳脂率影响不显著(P>0.05)。多重比较表明:KK基因型对测定日产奶量、305d校正产奶量、305d乳蛋白量和305d乳脂量极显著高于AA和KA基因型(P<0.01)。KK基因型的体细胞评分(SCS)最小二乘均值极显著低于KA、AA基因型(P<0.01)。对于测定日的乳蛋白率AA基因型显著低于KA、KK型(P<0.05)。IL8基因遗传突变对中国荷斯坦牛泌乳性状和乳房炎抗性有较大的遗传效应,可用于中国荷斯坦牛的分子标记辅助选择。 展开更多
关键词 中国荷斯坦牛 IL8基因 泌乳性状 遗传多态性 PCR-SSCP SCS
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中国荷斯坦牛CXCR1基因遗传多态性与体细胞评分的关联分析 被引量:6
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作者 陈仁金 杨章平 +8 位作者 毛永江 陈莹 常玲玲 吴海涛 施雪奎 周里根 王建勇 尹召华 梁祥焕 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第18期3848-3856,共9页
【目的】研究中国荷斯坦奶牛CXCR1基因的多态性及其与体细胞评分(Somaticcellscore,SCS)的关系,寻找与中国荷斯坦牛SCS相关的分子遗传标记,加快抗病育种进程。【方法】采用PCR-SSCP技术对来自30个公牛家系的610头中国荷斯坦牛CXCR1基因... 【目的】研究中国荷斯坦奶牛CXCR1基因的多态性及其与体细胞评分(Somaticcellscore,SCS)的关系,寻找与中国荷斯坦牛SCS相关的分子遗传标记,加快抗病育种进程。【方法】采用PCR-SSCP技术对来自30个公牛家系的610头中国荷斯坦牛CXCR1基因进行多态性检测,利用最小二乘均数法对CRCR1基因的多态位点与SCS进行相关分析,利用PHASE软件对4个多态位点进行单倍型分析。【结果】检测到4个SNPs,在5侧翼区发现了3个SNPs(-1830(A/G)、-1768(T/A)、-344(T/C)),在编码区783(C/A)位点为新发现的SNP。-1830(A/G)位点AA基因型个体SCS极显著低于AG基因型个体(P<0.01),-1768(T/A)位点TT基因型个体SCS极显著低于TA基因型个体(P<0.01),-344(T/C)位点TT基因型个体SCS极显著低于TC、CC个体(P<0.01)。783(C/A)位点基因型个体的SCS差异不显著。单倍型Haplo2(ATTA)纯合基因型的SCS极显著低于Haplo1(ATCA)、Haplo3(GACA)和Haplo4(GATA)单倍型纯合基因型(P<0.01)。【结论】-1830(A/G)位点AA基因型、-1768(T/A)位点TT基因型和-344(T/C)位点TT基因型以及单倍型Haplo2(ATTA)纯合体对中国荷斯坦牛的SCS具有较大的遗传效应,可作为分子标记应用于奶牛乳房炎抗性的筛选。 展开更多
关键词 中国荷斯坦牛 CXCR1基因 PCR-SSCP 多态性 单倍型 体细胞评分
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中国荷斯坦牛Toll样受体4基因的遗传多态性与体细胞评分的关联分析 被引量:8
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作者 陈仁金 王珍珍 +3 位作者 杨章平 朱孝荣 冀德君 毛永江 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第11期134-138,共5页
试验旨在研究中国荷斯坦牛Toll样受体4(toll-like receptor 4,TLR4)基因的遗传多态性及其与体细胞评分(somatic cell score,SCS)的关联性,寻找与乳房炎相关的分子标记,加快中国荷斯坦牛的抗病育种。利用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术对30个公... 试验旨在研究中国荷斯坦牛Toll样受体4(toll-like receptor 4,TLR4)基因的遗传多态性及其与体细胞评分(somatic cell score,SCS)的关联性,寻找与乳房炎相关的分子标记,加快中国荷斯坦牛的抗病育种。利用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术对30个公牛家系的610头中国荷斯坦牛TLR4基因进行多态性检测,用最小二乘均数法对TLR4基因的多态位点与SCS进行相关分析。结果发现,试验共检测到2个单核苷酸多态(single nucleotide polymorphisms,SNPs),TLR4基因5′侧翼区存在SNP-226G>C突变,经PCR-RFLP检测发现3种基因型:GG、GC和CC,基因型频率分别为0.208、0.482和0.310;外显子3存在SNP 1760C>T突变,经PCR-SSCP检测发现3种基因型:CC、TC和TT,基因型频率分别为0.738、0.225和0.007,以上2位点均偏离Hardy-Weinberg平衡。对于SNP-226G>C位点,基因型个体的SCS差异不显著;对于SNP 1760C>T位点,CC基因型个体的SCS最小二乘均值极显著低于TT和TC基因型个体(P<0.01)。SNP 1760C>T的CC基因型对于中国荷斯坦牛的SCS有较大的遗传效应,可作为分子标记应用于奶牛乳房炎抗性筛选。 展开更多
关键词 中国荷斯坦牛 Toll样受体4基因 PCR—RFLP PCR—SSCP 多态性 体细胞评分
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牛亚科6个群体LYZ基因序列分析及系统进化研究 被引量:5
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作者 陈仁金 杨章平 +5 位作者 毛永江 冀德君 常洪 陈莹 施雪奎 吴海涛 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期30-33,共4页
对牛亚科6个群体溶菌酶(LYZ)基因的编码区核苷酸序列进行PCR扩增和测序,结合GenBank上海福特牛该基因编码区核苷酸序列进行比对分析,并采用邻接法构建分子系统进化树。结果表明:在检测的样本中(水牛除外),有5个核苷酸多态位点,定义了9... 对牛亚科6个群体溶菌酶(LYZ)基因的编码区核苷酸序列进行PCR扩增和测序,结合GenBank上海福特牛该基因编码区核苷酸序列进行比对分析,并采用邻接法构建分子系统进化树。结果表明:在检测的样本中(水牛除外),有5个核苷酸多态位点,定义了9种单倍型;群内核苷酸多样性(Pi)在0.000 00~0.001 96之间,说明群体内遗传多样性程度较低。构建的分子系统发育树表明,瘤牛、蒙古牛、鲁西黄牛间关系密切,瘤牛和普通牛与牦牛关系相对较近,而与大额牛关系相对较远。 展开更多
关键词 牛亚科 LYZ基因 序列分析 系统进化
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中国荷斯坦牛LYZ基因多态性及其与乳房炎的关联分析 被引量:3
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作者 陈仁金 杨章平 +6 位作者 毛永江 陈莹 常玲玲 吴海涛 冀德君 李云龙 张亚琴 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第23期4936-4941,共6页
【目的】通过研究中国荷斯坦牛溶菌酶基因(lysozyme,LYZ)编码区多态性与乳房炎的关联性,寻找与乳房炎相关的分子标记,加快中国荷斯坦牛的抗病育种进程。【方法】利用PCR-SSCP技术对30个公牛家系的610头中国荷斯坦牛LYZ基因进行多态性检... 【目的】通过研究中国荷斯坦牛溶菌酶基因(lysozyme,LYZ)编码区多态性与乳房炎的关联性,寻找与乳房炎相关的分子标记,加快中国荷斯坦牛的抗病育种进程。【方法】利用PCR-SSCP技术对30个公牛家系的610头中国荷斯坦牛LYZ基因进行多态性检测,利用最小二乘均数法对LYZ基因的多态位点与SCS和305d产奶量进行相关分析【结果】LYZ基因的外显子1上存在115(T>G)突变位点,突变使精氨酸变为亮氨酸;突变位点经PCR-SSCP法检测发现了3种基因型TT、TG和GG,频率分别为0.270、0.508和0.222,χ2检验表明中国荷斯坦牛在该位点偏离Hardy-Weinberg平衡;GG基因型个体的SCS最小二乘均值极显著低于TT基因型个体(P<0.01),显著低于TG基因型个体(P<0.05);GG基因型个体的305d产奶量最小二乘均值极显著高于TT基因个体(P<0.01),显著高于TG基因型个体(P<0.05)。【结论】115(T>G)位点GG基因型,对中国荷斯坦牛的SCS和305d产奶量有较大的遗传效应,可作为分子标记应用于奶牛乳房炎抗性的筛选。 展开更多
关键词 中国荷斯坦牛 LYZ基因 PCR-SSCP 多态性 体细胞评分 305D产奶量 乳房炎抗性
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利用微卫星标记分析滩羊群体的遗传多样性及遗传分化 被引量:2
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作者 陈仁金 杨章平 +4 位作者 汤晓良 李云龙 张亚琴 毛永江 吴海涛 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期66-72,共7页
利用10对微卫星标记对小尾寒羊、宁夏牧区园区白滩羊、保种场滩羊和黑滩羊的遗传多样性和遗传分化进行分析,根据DC和DA遗传距离构建系统树。结果表明:10个微卫星座位中共检测到167个等位基因,每个座位在每个群体均检测到5个以上的等位... 利用10对微卫星标记对小尾寒羊、宁夏牧区园区白滩羊、保种场滩羊和黑滩羊的遗传多样性和遗传分化进行分析,根据DC和DA遗传距离构建系统树。结果表明:10个微卫星座位中共检测到167个等位基因,每个座位在每个群体均检测到5个以上的等位基因。座位和群体期望杂合度均在0.8左右;座位平均多态信息含量为0.722 3~0.838 5;园区白滩羊平均多态信息含量为0.794 6,保种场白滩羊平均多态信息含量为0.778 4,黑滩羊平均多态信息含量为0.772 3,群体平均多态信息含量为0.772 3~0.794 6。群体间表型分化系数为0.089 3,总群体近交系数为0.674 0,群体内近交系数为0.642 0。运用DC和DA遗传距离,分别采用UPGMA和NJ法构建的系统聚类图基本一致。综合遗传分化系数、遗传距离及聚类图,结果提示,滩羊与小尾寒羊群体间遗传分化程度最大,黑滩羊与白滩羊群体间存在一定的遗传分化,2个白滩羊群体间遗传分化程度相对最小。 展开更多
关键词 滩羊 小尾寒羊 微卫星DNA 遗传多样性 遗传分化
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基于TMS320F2812的工程车辆自动变速器控制系统设计 被引量:1
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作者 陈仁金 任德均 +1 位作者 代成刚 宋海亮 《机电工程技术》 2012年第9期27-29,共3页
在研究工程车辆自动变速技术的基础上,以TMS320F2812作为自动变速器控制系统的CPU,设计了基于TMS320F2812的工程车辆自动变速器控制系统。根据工程车辆自动变速器的特点和TMS320F2812的特性,完成了整个控制系统的硬件电路和软件设计。... 在研究工程车辆自动变速技术的基础上,以TMS320F2812作为自动变速器控制系统的CPU,设计了基于TMS320F2812的工程车辆自动变速器控制系统。根据工程车辆自动变速器的特点和TMS320F2812的特性,完成了整个控制系统的硬件电路和软件设计。经试验和装车测试,各项功能满足设计要求。本控制系统可通过设置软件参数更改控制策略,并可通过配置不同换档程序应用于不同的工程车辆。 展开更多
关键词 TMS320F2812 工程车辆 自动变速 控制系统
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中国荷斯坦牛IL8基因SNP-233(G>A)不同基因型的表达差异研究
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作者 陈仁金 王珍珍 +3 位作者 杨章平 毛永江 冀德君 朱孝荣 《中国牛业科学》 2013年第6期16-18,共3页
[目的]本研究旨在研究中国荷斯坦牛IL8基因-233(G>A)位点不同基因的表达差异水平,为探讨该位点在抗奶牛乳房炎作用提供理论依据。[方法]本试验运用SYBR Green实时荧光定量PCR技术进行定量测定。[结果]GG基因型个体mRNA的表达量显示高... [目的]本研究旨在研究中国荷斯坦牛IL8基因-233(G>A)位点不同基因的表达差异水平,为探讨该位点在抗奶牛乳房炎作用提供理论依据。[方法]本试验运用SYBR Green实时荧光定量PCR技术进行定量测定。[结果]GG基因型个体mRNA的表达量显示高于GA和AA基因型个体的表达量。[结论]IL8基因-233(G>A)位点对中国荷斯坦牛乳房炎抗性有一定影响,可用于中国荷斯坦牛的抗乳房炎的分子标记辅助选择。 展开更多
关键词 中国荷斯坦牛 IL8基因 基因型 实时PCR
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基于TMS320F28335的温度远程监控系统设计 被引量:1
10
作者 陈仁金 蒋涛 《仪器仪表与分析监测》 2013年第2期22-24,共3页
工业控制现场常需要将设备的信息实时记录并保存,并将这些信息传到上位机或HMI(人机界面),以便对运行设备的状态进行显示和监控。研发的温度远程监控系统通过组网的方式,将温控箱的温度信息通过协议转换器实时传递给工控机,并在工控机... 工业控制现场常需要将设备的信息实时记录并保存,并将这些信息传到上位机或HMI(人机界面),以便对运行设备的状态进行显示和监控。研发的温度远程监控系统通过组网的方式,将温控箱的温度信息通过协议转换器实时传递给工控机,并在工控机上实时显示当前设备的温度等信息。每台工控机可对多台设备的温度进行监控,从而实现温控箱温度的远程集中控制。 展开更多
关键词 PLC 协议转换器 温度信号 工控机
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南方集约化饲养条件下荷斯坦奶牛乳脂率和乳蛋白率变化规律的初步研究 被引量:60
11
作者 常玲玲 杨章平 +4 位作者 陈仁金 毛永江 周里根 王建勇 尹兆华 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2010年第1期43-47,共5页
乳脂率和乳蛋白率是决定牛奶品质的重要成分,受许多因素的影响。试验旨在研究南方高度集约化饲养条件下自然月份、产犊季节、泌乳期和胎次对乳中乳脂率和乳蛋白率的影响。采样测定478头南方荷斯坦奶牛一个自然年度(2007年4—2008年3月)... 乳脂率和乳蛋白率是决定牛奶品质的重要成分,受许多因素的影响。试验旨在研究南方高度集约化饲养条件下自然月份、产犊季节、泌乳期和胎次对乳中乳脂率和乳蛋白率的影响。采样测定478头南方荷斯坦奶牛一个自然年度(2007年4—2008年3月)的主要乳成分和体细胞数(SCC),采用最小二乘法,分析自然月份、产犊季节、泌乳期和胎次对乳脂率和乳蛋白率的影响。结果表明:自然月份、泌乳期和胎次对乳脂率的影响极显著(P<0.01),产犊季节对乳脂率的影响显著(P<0.05);自然月份、产犊季节、泌乳期和胎次对乳蛋白率的影响极显著(P<0.01);乳脂率与体细胞数呈极显著负相关(P<0.01),而乳蛋白率与体细胞数呈极显著正相关(P<0.01);乳脂率和乳蛋白率与日产奶量呈极显著负相关(P<0.01)。结果提示在实际生产中,可以通过对影响乳成分因素的调控提高牛奶质量。 展开更多
关键词 乳脂率 乳蛋白率 体细胞数 中国荷斯坦牛
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乳房炎对中国荷斯坦牛测定日泌乳性能及体细胞数变化的影响 被引量:13
12
作者 毛永江 陈莹 +5 位作者 陈仁金 常玲玲 施雪奎 杨章平 梁祥焕 尹召华 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第12期1787-1794,共8页
旨在研究乳房炎及病原菌组成对中国荷斯坦牛测定日泌乳性能及体细胞数变化的影响。本研究于2009年9月对江苏某奶牛场140头成年中国荷斯坦泌乳牛进行乳房炎检测和DHI测定,同时对隐性乳房炎阳性乳区进行病原菌分离鉴定,并分析了不同乳房... 旨在研究乳房炎及病原菌组成对中国荷斯坦牛测定日泌乳性能及体细胞数变化的影响。本研究于2009年9月对江苏某奶牛场140头成年中国荷斯坦泌乳牛进行乳房炎检测和DHI测定,同时对隐性乳房炎阳性乳区进行病原菌分离鉴定,并分析了不同乳房炎类型和隐性乳房炎病原菌组成对测定日泌乳性能和乳中SCC变化的影响。结果表明,该牛场临床乳房炎、隐性乳房炎和正常奶牛比例分别为10.00%、51.10%和37.90%,其中隐性乳房炎以大肠杆菌和链球菌混合感染最多(19头,占26.00%),其次为链球菌单独感染(17头,占23.30%)。由1种细菌单独感染的比例为26头(占36.11%),2种或2种以上细菌混合感染为44头(占61.11%)。乳房炎类型对测定日产奶量、乳糖含量、体细胞数和体细胞评分4个指标影响达到极显著水平(P<0.01),临床乳房炎和隐性乳房炎奶牛日产奶量和乳糖含量极显著低于正常奶,同时体细胞数和体细胞评分极显著高于正常奶,而临床乳房炎奶和隐性乳房炎奶在所有检测指标上均无显著差异,但临床乳房炎奶比隐性乳房炎奶体细胞数高出约100万.mL-1。不同病原菌组成类型对乳中体细胞数和体细胞评分有极显著影响(P<0.01),而对其它性状无显著影响(P>0.05)。混合感染奶牛测定日产奶量极显著低于单独感染奶牛(P<0.01),同时乳中体细胞数显著高于单独感染奶牛(P<0.01)。乳房炎类型对乳中SCC的变化趋势有显著影响(P<0.01),正常奶牛维持较低SCC的能力较强,隐性乳房炎奶牛在下一泌乳月体细胞增加的可能性较大。不同隐性乳房炎病原菌组成类型对乳中SCC的变化无显著影响。奶牛生产中隐性乳房炎发病率高,危害性也最大,不同病原菌混合感染引起的隐性乳房炎对测定日产奶量和乳中体细胞数影响最大。该结果为奶牛场采取合理措施,降低隐性乳房炎发生率提供了参考。 展开更多
关键词 中国荷斯坦牛 乳房炎 泌乳性能 体细胞数
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4个绵羊品种Leptin基因部分片段的SNPs多态性与生长发育性状的相关性分析 被引量:14
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作者 黄丹丽 陈仁金 +5 位作者 杨章平 毛永江 李云龙 田黛君 陈亮 赵晓勇 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第12期1640-1646,共7页
利用PCR-SSCP技术对萨福克、陶赛特、得克塞尔及滩羊4个绵羊品种358个个体Leptin基因等2、3外显子进行多态性分析,共检测到7个SNPs,其中新发现5个SNPs。测序结果表明,在外显子2上无突变。内含子2上存在A99G、G115A、C150T、C171T位点。... 利用PCR-SSCP技术对萨福克、陶赛特、得克塞尔及滩羊4个绵羊品种358个个体Leptin基因等2、3外显子进行多态性分析,共检测到7个SNPs,其中新发现5个SNPs。测序结果表明,在外显子2上无突变。内含子2上存在A99G、G115A、C150T、C171T位点。外显子3上,存在G271A;C316A;G387T位点。外显子3上的SNPs使编码的氨基酸发生变化。统计分析表明A99G、C150T和A99G+C150T位点与生长发育性状存在相关性。在A99G位点,Aa基因型初生质量、日增质量、体高、胸围和尻宽指标上均高于AA基因型,初生质量、日增质量和体高指标差异显著(P<0.05),胸围和尻宽指标差异极显著(P<0.01)。C150T和A99G+C150T位点结果一致,突变基因型日增重、体高、体长、胸围和尻宽指标均高于野生基因型,差异显著(P<0.05)。 展开更多
关键词 绵羊 LEPTIN基因 SNPS 生长发育性状
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宁夏牧区主要绵羊品种遗传多样性分析及群体间杂种优势预测 被引量:13
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作者 瞿冬艳 陈仁金 +6 位作者 毛永江 孙辰晨 耿岩 田黛君 陈亮 赵晓勇 杨章平 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期1-6,共6页
利用7个微卫星标记对宁夏牧区陶赛特、得克赛尔、萨福克、滩羊、小尾寒羊、滩寒杂种羊6个绵羊群体进行遗传多样性检测,并根据遗传距离对群体间杂种优势进行预测,结果显示:6个绵羊群体共检测到108个等位基因,每个座位在每个群体都检测到... 利用7个微卫星标记对宁夏牧区陶赛特、得克赛尔、萨福克、滩羊、小尾寒羊、滩寒杂种羊6个绵羊群体进行遗传多样性检测,并根据遗传距离对群体间杂种优势进行预测,结果显示:6个绵羊群体共检测到108个等位基因,每个座位在每个群体都检测到5个以上等位基因,7个微卫星座位在6个群体中呈高度多态性,期望杂合度远大于观测杂合度,群体间表型分化系数(Fst)较低,为5.8%,与Gst结果基本一致,总群体近交系数(Fit)为56.90%,群体内近交系数(Fis)为54.36%。根据DC遗传距离和DA遗传距离,预测群体间杂种优势,杂交母本品种以滩寒杂种羊效果最好,滩羊次之,小尾寒羊最差;杂交父本的选择顺序为得克赛尔、萨福克、陶赛特。 展开更多
关键词 绵羊 微卫星DNA 遗传多样性 杂种优势
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南方地区中国荷斯坦牛DGAT1基因多态性与泌乳性状的关联分析 被引量:12
15
作者 毛永江 陈仁金 +5 位作者 陈莹 常玲玲 施雪奎 杨章平 施健 黄回华 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第14期2990-2995,共6页
【目的】探索南方地区中国荷斯坦牛DGAT1基因多态性与泌乳性状的相关性。【方法】以上海光明乳业集团金山奶牛场30个公牛家系的605头中国荷斯坦牛为试验材料,采用PCR-SSCP法分析DGAT1基因K232A位点遗传多态性,采用混合动物模型分析DGAT... 【目的】探索南方地区中国荷斯坦牛DGAT1基因多态性与泌乳性状的相关性。【方法】以上海光明乳业集团金山奶牛场30个公牛家系的605头中国荷斯坦牛为试验材料,采用PCR-SSCP法分析DGAT1基因K232A位点遗传多态性,采用混合动物模型分析DGAT1基因K232A位点突变对测定日产奶量、乳脂率、乳蛋白率、305d校正产奶量、乳脂量、乳蛋白量及体细胞评分7个泌乳性状的影响。【结果】共检测到KK、KA和AA三种基因型,频率分别为0.7918、0.1917和0.0165,等位基因K和A的频率分别为0.8876和0.1124。该位点突变对测定日产奶量、乳脂率、乳蛋白率、305d校正产奶量、乳蛋白量的影响达到极显著水平(P<0.01),对乳脂量的影响达到显著水平(P<0.05),对乳中体细胞评分影响不显著(P>0.05)。多重比较表明,KK和KA型测定日产奶量、305d校正产奶量和乳蛋白量极显著高于AA型(P<0.01),AA型乳脂率和乳蛋白率极显著高于KK和KA型(P<0.01)。【结论】DGAT1基因K232A位点突变对中国荷斯坦牛泌乳性状有较大的遗传效应,可用于其泌乳性状的分子标记辅助选择。 展开更多
关键词 中国荷斯坦牛 DGAT1 泌乳性状 PCR-SSCP
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中国荷斯坦牛SCD1基因多态性与泌乳性状的关联分析 被引量:7
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作者 王小龙 陈仁金 +6 位作者 杨章平 毛永江 冀德君 陈莹 常玲玲 李云龙 李锐 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期1022-1026,共5页
本研究旨在探索中国荷斯坦牛SCD1基因多态性与产奶性状的相关性。以上海某奶牛场610头中国荷斯坦牛为试验材料,采用PCR-SSCP法对SCD1基因A293V位点遗传多态性进行分析,利用一般线性模型分析SCD1基因A293V位点突变对测定日产奶量、乳脂... 本研究旨在探索中国荷斯坦牛SCD1基因多态性与产奶性状的相关性。以上海某奶牛场610头中国荷斯坦牛为试验材料,采用PCR-SSCP法对SCD1基因A293V位点遗传多态性进行分析,利用一般线性模型分析SCD1基因A293V位点突变对测定日产奶量、乳脂率、乳蛋白率、305天校正产奶量、乳脂量、乳蛋白量及体细胞评分7个泌乳性状的影响。共检测到AA、AV和VV 3种基因型,频率分别为0.634、0.323和0.043,等位基因A和V的频率分别为0.796和0.204。该位点突变对乳脂率、乳蛋白率的影响达到显著水平(P<0.05),对测定日产奶量、305天校正产奶量、305天乳蛋白量和305天乳脂量以及体细胞评分影响不显著(P>0.05)。多重比较表明,VV基因型个体的乳蛋白率、乳脂率极显著高于AA、AV型个体(P<0.01)。SCD1基因A293V位点突变对中国荷斯坦牛泌乳性状的遗传效应有一定程度的影响,但影响机理需要进一步的研究。 展开更多
关键词 中国荷斯坦牛 SCD1基因 产奶性状 PCR-SSCP
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中国荷斯坦牛SCD1外显子5基因多态性及其对乳中脂肪酸组成的影响 被引量:5
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作者 王小龙 常玲玲 +5 位作者 陈莹 陈仁金 李云龙 毛永江 冀德君 杨章平 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期1858-1864,共7页
【目的】探讨中国南方地区荷斯坦牛SCD1基因外显子5遗传多态性及其对乳中不饱和脂肪酸含量及其不饱和指数的影响。【方法】以扬州大学实验农牧场323头中国荷斯坦牛为试验材料,采用PCR-SSCP法对SCD1基因外显子5的3个位点遗传多态性进行分... 【目的】探讨中国南方地区荷斯坦牛SCD1基因外显子5遗传多态性及其对乳中不饱和脂肪酸含量及其不饱和指数的影响。【方法】以扬州大学实验农牧场323头中国荷斯坦牛为试验材料,采用PCR-SSCP法对SCD1基因外显子5的3个位点遗传多态性进行分析,同时挑选140头体况相近(BCS=3.0±0.5)、无临床乳房炎、胎次在2—3胎、处于泌乳中后期(产奶100—300 d)的中国荷斯坦牛,取全天混合奶样(早﹕中﹕晚=4﹕3﹕3)100 mL用于测定脂肪酸含量,进而分析多态性对乳中脂肪酸成分的影响。【结果】SCD1-702位点无多态,SCD1-762和SCD1-878分别发现T/C和C/T两个突变。SCD1-762位点A为优势等位基因,基因频率为0.7897。SCD1-878位点C为优势基因,频率为0.7835。χ2检验表明该群体的中国荷斯坦奶牛在SCD1基因的这两个位点都处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。SCD1-762与SCD1-878处于极显著连锁不平衡,连锁不平衡系数r2为0.879,达到极显著水平(P<0.01)。SCD1-762和SCD1-878两位点共组成4种单倍型:AC、BC、AT、BT。SCD1-762、SCD1-878及其单倍型对MUFA比例及总不饱和指数的影响均达到显著水平(P<0.05),即SCD1 878位点TT型乳中MUFA比例及总不饱和脂肪酸指数显著低于CC和CT型,而SFA比例显著高于CC和CT型(P<0.05);SCD1 762位点BB型乳中MUFA比例及总不饱和脂肪酸指数显著低于AA和AB型(P<0.05)。单位型AC型MUFA比例及总不饱和指数显高于BT型,而SFA比例显著低于BT型(P<0.05)。【结论】SCD1 878和762位点突变对乳中乳脂肪酸组成及饱和指数有显著的遗传效应,可作为影响中国荷斯坦奶牛乳脂肪酸组成的重要候选基因。 展开更多
关键词 中国荷斯坦牛 SCD1 多态性 脂肪酸含量
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利用多因子降维法研究CXCR1和IL-8基因交互作用与中国荷斯坦牛乳房炎的关系 被引量:4
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作者 毛永江 陈仁金 +4 位作者 陈莹 常玲玲 施雪奎 张亚琴 杨章平 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期1908-1915,共8页
【目的】运用多因子降维法(MDR)分析中国荷斯坦牛CXCR1和IL-8两个基因多态性与乳房炎易感性的交互作用,并评价MDR模型的具体应用。【方法】以上海光明乳业集团金山种奶牛场634头(其中有228头患乳房炎)中国荷斯坦牛为试验材料,采用PCR-S... 【目的】运用多因子降维法(MDR)分析中国荷斯坦牛CXCR1和IL-8两个基因多态性与乳房炎易感性的交互作用,并评价MDR模型的具体应用。【方法】以上海光明乳业集团金山种奶牛场634头(其中有228头患乳房炎)中国荷斯坦牛为试验材料,采用PCR-SSCP和直接测序法分析CXCR1基因-5′端和编码区及IL-8基因编码区共7个SNP位点的遗传多态性,并用MDR法和Logistic回归分析CXCR1和IL-8基因各位点突变及其基因型组合对奶牛乳房炎易感性的影响。【结果】CXCR1基因5′端-1 830、-1 768、-344和编码区783共4处发生突变,IL-8基因的2 789(A/G)位点与2 862(T/C)位点发生连锁突变,并导致两位点分别发生Ser→Gly和Cys→Arg的突变。单因素Logistic回归分析结果表明,CXCR1基因和IL-8基因5个SNP位点变异对该牛场奶牛乳房炎易感性均没有达到显著水平,但MDR分析发现CXCR1-(-1 768)-IL-8两位点、CXCR1-(-1 768)-(783)-IL-8三位点及CXCR1-(-1 768)-(–344)-(783)-IL-8四位点交互作用均达到显著水平,且交叉验证一致性均为最大(10/10)。CXCR1-(-1 768)-(783)-IL-8三位点互作模型和CXCR1-(-1 768)-IL-8两位点互作模型检验样本准确度较高(分别为0.5457和0.5485),但4个位点联合效应分级图表明CXCR1-(-1 768)-IL-8两易感基因型为强正交互作用,同时将CXCR1-(-1 768)-(783)-IL-8三位点互作效应和CXCR1-(-1 768)-IL-8两位点互作效应引入Logistic回归分析表明,CXCR1-(-1 768)-IL-8两位点互作效应对该牛场奶牛乳房炎易感性达到显著水平。【结论】CXCR1-(-1 768)-IL-8两位点交互模型作为奶牛乳房炎易感性相关的基因联合选择模型最佳,MDR和Logistic回归均可用于奶牛乳房炎易感性多基因分析模型,MDR发现交互作用的能力比Logistic回归强,但两者有着各自的适用条件和优点。遇到有交互作用分析要求时,二者的联合应用效果更佳。 展开更多
关键词 多因子降维法 LOGISTIC回归 CXCR1 IL-8 乳房炎易感性
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牛亚科5个群体β-Lg基因PCR-RFLP分析 被引量:5
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作者 武秀香 杨章平 +6 位作者 毛永江 王小龙 瞿冬艳 陈仁金 周里根 王建勇 尹召华 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期6-9,共4页
应用PCR-PFLP技术,分析荷斯坦奶牛、鲁西黄牛、闽南黄牛、渤海黑牛和青海牦牛5个群体741头个体β-乳球蛋白(β-Lg)基因第4外显子和β-Lg 5′侧翼区2个基因座的多态性。结果表明:前4个群体β-Lg A、B基因频率分别为0.4125/0.5875、0.1419... 应用PCR-PFLP技术,分析荷斯坦奶牛、鲁西黄牛、闽南黄牛、渤海黑牛和青海牦牛5个群体741头个体β-乳球蛋白(β-Lg)基因第4外显子和β-Lg 5′侧翼区2个基因座的多态性。结果表明:前4个群体β-Lg A、B基因频率分别为0.4125/0.5875、0.1419/0.8581、0.0333/0.9667和0.1857/0.8143,β-Lg 5′侧翼区A、B基因频率分别为0.412 5/0.5875、0.7286/0.2714、0.7328/0.2672和0.8637/0.1364;牦牛β-Lg B和E基因频率为0.0732/0.9269,未发现其他等位基因。适合性检验表明:β-Lg第4外显子在荷斯坦奶牛、鲁西黄牛和渤海黑牛3个群体中已达Hardy-Weinberg平衡状态,而闽南黄牛未达到平衡状态;β-Lg 5′侧翼区位点荷斯坦奶牛群体接近平衡,其余群体均已达平衡。群体遗传学分析表明:除闽南黄牛β-Lg 5′侧翼区为低度多态外,2个位点在其余群体内均为中度多态,荷斯坦奶牛这2个位点的杂合度和期望杂合度最高,闽南黄牛最低。提示这一研究成果为开展地方遗传资源保护奠定了基础。 展开更多
关键词 β-Lg基因 PCR-PFLP 遗传多态性
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中国荷斯坦奶牛IL-8基因SNP-180A/G显著影响体细胞评分 被引量:3
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作者 冀德君 陈仁金 +4 位作者 杨章平 朱国强 毛永江 陈莹 李锐 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期1387-1391,共5页
【目的】通过研究IL-8基因5′侧翼区多态性与体细胞评分(somatic cell score,SCS)的相关性,获得与低体细胞计数(somatic cell counts,SCC)性状相关的遗传标记,为低SCC性状的选育提供借鉴。【方法】采用PCR-SSCP技术检测来自30个公牛家系... 【目的】通过研究IL-8基因5′侧翼区多态性与体细胞评分(somatic cell score,SCS)的相关性,获得与低体细胞计数(somatic cell counts,SCC)性状相关的遗传标记,为低SCC性状的选育提供借鉴。【方法】采用PCR-SSCP技术检测来自30个公牛家系的610头中国荷斯坦奶牛的IL-8基因5′侧翼区的多态性,并采用混合动物模型分析多态位点与主要泌乳性状及SCS的相关性。【结果】IL-8基因5′侧翼区存在1个SNP位点,即-180 A/G;定义了3种基因型,即GG、GA和AA,频率分别为0.41、0.43和0.16。该SNP位点对SCS具有显著效应,对SCS指标来说,GG极显著低于GA或AA(P<0.01),而该SNP位点对测定日产奶量、测定日乳脂率、测定日乳蛋白率和305 d校正产奶量的影响不显著(P>0.05)。【结论】IL-8基因5′侧翼区SNP-180 A/G显著影响体细胞评分。 展开更多
关键词 中国荷斯坦奶牛 IL-8基因 SCS SNP 泌乳性状
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