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基于转录组测序分析美洲大蠊提取物促进小鼠创面愈合的分子机制
被引量:
15
1
作者
陈佳松
陈峰
+2 位作者
彭锐
耿福能
邹方东
《四川动物》
北大核心
2017年第4期398-403,共6页
美洲大蠊Periplaneta americana是传统的中药材,其提取物已在临床上广泛用于创面治疗,但对其中的分子机制知之甚少。本文通过构建小鼠皮肤创伤模型,并基于转录组测序(RNA-seq)深入分析美洲大蠊提取物促进小鼠创面愈合的分子机制。首先构...
美洲大蠊Periplaneta americana是传统的中药材,其提取物已在临床上广泛用于创面治疗,但对其中的分子机制知之甚少。本文通过构建小鼠皮肤创伤模型,并基于转录组测序(RNA-seq)深入分析美洲大蠊提取物促进小鼠创面愈合的分子机制。首先构建C57小鼠皮肤全层切除模型,并将其分为3组,其中实验组分别以2种美洲大蠊提取物(康复新液、精粉)为敷料,而对照组以75%乙醇为敷料。用药处理3 d后取伤口皮肤组织送样进行RNAseq,然后分析转录组数据找出与伤口愈合相关的差异性表达基因,并利用荧光定量PCR(Q-PCR)对伤口组织中相关基因的表达量进一步验证。实验结果显示,实验组小鼠伤口的结痂速度比对照组快,这表明了小鼠创面模型中,美洲大蠊提取物能促进伤口愈合。经转录组分析,得到显著性差异表达基因数:对照组vs.精粉组为545,对照组vs.康复新液组为938。结合生物信息分析结果和已发表的文献,发现3个可能参与调节伤口愈合的关键基因:表皮调节素(Ereg)、Gli-kruppel家族成员(Gli2)和表皮型转谷氨酰胺酶3(Tgm3)。Q-PCR实验表明,这3个基因在美洲大蠊提取物加药组中均高表达。本文研究结果表明,2种美洲大蠊提取物:康复新液、精粉可能通过诱导Ereg、Tgm3和Gli2的高表达来促进皮肤创面的愈合。
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关键词
美洲大蠊
伤口修复
转录组分析
关键基因
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职称材料
基于RNA-seq分析美洲大蠊提取物对结直肠癌细胞信号通路的影响
被引量:
2
2
作者
陈峰
陈佳松
+2 位作者
彭锐
耿福能
邹方东
《四川动物》
北大核心
2017年第6期649-656,共8页
美洲大蠊Periplaneta americana提取物能够抑制多种肿瘤细胞生长,甚至能使肿瘤细胞发生凋亡,但是其对结直肠癌细胞信号通路的影响尚不清楚。本文基于RNA-seq技术初步分析了美洲大蠊提取物联合顺铂处理结直肠癌细胞后,细胞内信号通路的...
美洲大蠊Periplaneta americana提取物能够抑制多种肿瘤细胞生长,甚至能使肿瘤细胞发生凋亡,但是其对结直肠癌细胞信号通路的影响尚不清楚。本文基于RNA-seq技术初步分析了美洲大蠊提取物联合顺铂处理结直肠癌细胞后,细胞内信号通路的变化。结果表明:30μM顺铂和0.6%康复新液联合处理组与对照组相比,共有1 901个差异基因,其中1 555个基因表达上调,346个基因表达下调;30μM顺铂和0.8%精粉酵解液联合处理组与对照组比,共有2 587个差异基因,其中2 183个基因表达上调,404个基因表达下调;30μM顺铂和100μg·m L-1精粉联合处理组与对照组相比,共有1 488个差异基因,其中1 164个基因表达上调,324个基因表达下调。用WEGO和DAVID进行差异基因的GO和KEGG富集分析发现,美洲大蠊提取物联合顺铂处理组与对照组相比,表达上调的差异基因主要富集在p53、细胞粘附分子、MAPK、细胞凋亡等信号通路;表达下调的差异基因主要富集在氨基酰-tRNA生物合成、氨基酸生物合成、抗生素生物合成、一碳代谢等信号通路。
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关键词
美洲大蠊
提取物
转录组
差异基因
信号通路
功能注释
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职称材料
大熊猫脐带间充质干细胞外泌体的分离鉴定及miRNAs富集分析
3
作者
安俊辉
李媛
+8 位作者
王东辉
陈佳松
李红艳
梁小虎
封同英
蔡志刚
侯蓉
曾长军
刘玉良
《兽类学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期33-40,共8页
大熊猫脐带间充质干细胞(Umbilical cord mesenchymal stem cells,UC-MSCs)通过旁分泌所释放的外泌体在大熊猫保健与疾病治疗方面具有一定的应用前景。本研究旨在建立大熊猫UC-MSCs外泌体分离方法,开展生物学特征分析和分子鉴定,并研究U...
大熊猫脐带间充质干细胞(Umbilical cord mesenchymal stem cells,UC-MSCs)通过旁分泌所释放的外泌体在大熊猫保健与疾病治疗方面具有一定的应用前景。本研究旨在建立大熊猫UC-MSCs外泌体分离方法,开展生物学特征分析和分子鉴定,并研究UC-MSCs外泌体中miRNAs的种类与功能。采用超速离心法从大熊猫UCMSCs培养上清中成功分离外泌体,通过透射电子显微镜进行形态学观察,纳米颗粒跟踪分析仪检测粒径大小,蛋白免疫印迹法检测特异性分子标记表达。采用Small RNA测序技术对UC-MSCs外泌体中的miRNAs进行鉴定,并对其靶基因进行了预测与功能分析。结果显示,大熊猫UC-MSCs外泌体呈圆形杯托状结构,直径为(79.15±4.81)nm,外泌体标志蛋白CD81与TSG101呈阳性表达而CALNEXIN呈阴性表达。大熊猫UC-MSCs外泌体中的miRNA主要为miR-148-3p(30.28%)与miR-21-5p(21.72%)。本研究首次从大熊猫UC-MSCs培养上清中分离出外泌体,并对其所含的miRNAs进行富集分析及功能预测,为大熊猫UC-MSCs外泌体后续的功能研究及应用奠定基础。
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关键词
大熊猫
脐带间充质干细胞
外泌体
MIRNA
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职称材料
德化县曾坂水泥用石灰岩矿体特征及矿石质量变化规律
4
作者
陈佳松
《能源与环境》
2015年第3期44-45,共2页
通过对矿体的化验成果进行数理统计,编制等值线与散点图等方法,对德化县曾坂水泥用石灰岩Ⅲ号矿体的厚度、产状、主要化学成分等特征数据,进行分析统计,总结其在水平方向与垂直方向上的变化规律,对外围找矿及矿石开采有一定的指导作用。
关键词
水泥用石灰岩矿
矿体特征
变化规律
统计分析
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职称材料
福建省泉港大林山矿区钼矿物化探异常特征及找矿效果
5
作者
陈佳松
《能源与环境》
2013年第6期118-119,共2页
福建省泉港大林山矿区地表覆盖严重,地质找矿标志不明显,综合物化探方法对发现和圈定钼矿体起到了重要作用。总结矿床的地球物理、地球化学找矿标志,对于处于同一成矿远景区的其他地段寻找该类型矿床,具有十分重要的意义。
关键词
综合物化探
异常查证
找矿标志
钼矿
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职称材料
新集三矿可采煤层的覆岩破坏分析
6
作者
陈佳松
《能源与环境》
2012年第1期82-84,共3页
从覆岩运动的规律出发,探讨导水裂隙带高度的主要影响因素和计算方法;分析采动后覆岩离层发生的位置及其扩展规律,结合新集三矿实例就煤层覆岩破坏作进一步讨论。
关键词
覆岩破坏
导水裂高
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职称材料
基于大数据的智慧城管设计方案
被引量:
8
7
作者
周宏成
陈佳松
《电子技术与软件工程》
2019年第15期158-161,共4页
本文以智慧城市管理运行管理体系为基础,以城市管理综合数据库为支撑,将城市管理数据在各层面打通。本文设计的智慧化城市管理应用平台以精细化管理、人性化服务、高效化协同、多元化参与为手段,通过管理带动服务、以服务提升为目标实...
本文以智慧城市管理运行管理体系为基础,以城市管理综合数据库为支撑,将城市管理数据在各层面打通。本文设计的智慧化城市管理应用平台以精细化管理、人性化服务、高效化协同、多元化参与为手段,通过管理带动服务、以服务提升为目标实现城市管理水平提升。
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关键词
智慧城管
指挥调度
大数据
云平台
物联网
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职称材料
泉州市地质灾害现状分析与防治建议
被引量:
1
8
作者
陈佳松
《福建地质》
2010年第A01期111-114,共4页
泉州市由于自然地理、地质和气候条件,以及人类活动频繁,地质灾害频发,危害较大,应加强对地质灾害的防治研究,实施合理的减灾措施。
关键词
地质灾害
成灾条件
影响因素
防治措施
泉州市
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职称材料
题名
基于转录组测序分析美洲大蠊提取物促进小鼠创面愈合的分子机制
被引量:
15
1
作者
陈佳松
陈峰
彭锐
耿福能
邹方东
机构
四川大学生命科学学院
四川省药用动物工程技术研究中心
药用美洲大蠊四川省重点实验室
出处
《四川动物》
北大核心
2017年第4期398-403,共6页
文摘
美洲大蠊Periplaneta americana是传统的中药材,其提取物已在临床上广泛用于创面治疗,但对其中的分子机制知之甚少。本文通过构建小鼠皮肤创伤模型,并基于转录组测序(RNA-seq)深入分析美洲大蠊提取物促进小鼠创面愈合的分子机制。首先构建C57小鼠皮肤全层切除模型,并将其分为3组,其中实验组分别以2种美洲大蠊提取物(康复新液、精粉)为敷料,而对照组以75%乙醇为敷料。用药处理3 d后取伤口皮肤组织送样进行RNAseq,然后分析转录组数据找出与伤口愈合相关的差异性表达基因,并利用荧光定量PCR(Q-PCR)对伤口组织中相关基因的表达量进一步验证。实验结果显示,实验组小鼠伤口的结痂速度比对照组快,这表明了小鼠创面模型中,美洲大蠊提取物能促进伤口愈合。经转录组分析,得到显著性差异表达基因数:对照组vs.精粉组为545,对照组vs.康复新液组为938。结合生物信息分析结果和已发表的文献,发现3个可能参与调节伤口愈合的关键基因:表皮调节素(Ereg)、Gli-kruppel家族成员(Gli2)和表皮型转谷氨酰胺酶3(Tgm3)。Q-PCR实验表明,这3个基因在美洲大蠊提取物加药组中均高表达。本文研究结果表明,2种美洲大蠊提取物:康复新液、精粉可能通过诱导Ereg、Tgm3和Gli2的高表达来促进皮肤创面的愈合。
关键词
美洲大蠊
伤口修复
转录组分析
关键基因
Keywords
Periplaneta americana
wound healing
RNA-seq
key genes
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
基于RNA-seq分析美洲大蠊提取物对结直肠癌细胞信号通路的影响
被引量:
2
2
作者
陈峰
陈佳松
彭锐
耿福能
邹方东
机构
四川大学生命科学学院
四川省药用动物工程技术研究中心
药用美洲大蠊四川省重点实验室
出处
《四川动物》
北大核心
2017年第6期649-656,共8页
文摘
美洲大蠊Periplaneta americana提取物能够抑制多种肿瘤细胞生长,甚至能使肿瘤细胞发生凋亡,但是其对结直肠癌细胞信号通路的影响尚不清楚。本文基于RNA-seq技术初步分析了美洲大蠊提取物联合顺铂处理结直肠癌细胞后,细胞内信号通路的变化。结果表明:30μM顺铂和0.6%康复新液联合处理组与对照组相比,共有1 901个差异基因,其中1 555个基因表达上调,346个基因表达下调;30μM顺铂和0.8%精粉酵解液联合处理组与对照组比,共有2 587个差异基因,其中2 183个基因表达上调,404个基因表达下调;30μM顺铂和100μg·m L-1精粉联合处理组与对照组相比,共有1 488个差异基因,其中1 164个基因表达上调,324个基因表达下调。用WEGO和DAVID进行差异基因的GO和KEGG富集分析发现,美洲大蠊提取物联合顺铂处理组与对照组相比,表达上调的差异基因主要富集在p53、细胞粘附分子、MAPK、细胞凋亡等信号通路;表达下调的差异基因主要富集在氨基酰-tRNA生物合成、氨基酸生物合成、抗生素生物合成、一碳代谢等信号通路。
关键词
美洲大蠊
提取物
转录组
差异基因
信号通路
功能注释
Keywords
Periplaneta americana
extraction
transcriptome
differentially expressed genes
signaling pathways
functional annotation
分类号
R735.34 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
大熊猫脐带间充质干细胞外泌体的分离鉴定及miRNAs富集分析
3
作者
安俊辉
李媛
王东辉
陈佳松
李红艳
梁小虎
封同英
蔡志刚
侯蓉
曾长军
刘玉良
机构
四川农业大学动物科技学院
成都大熊猫繁育研究基地
四川省大熊猫科学研究院
出处
《兽类学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期33-40,共8页
基金
成都大熊猫繁育研究基金会项目(CPF2017-16)
四川杰出青年科技人才项目(2020JDJQ0074)。
文摘
大熊猫脐带间充质干细胞(Umbilical cord mesenchymal stem cells,UC-MSCs)通过旁分泌所释放的外泌体在大熊猫保健与疾病治疗方面具有一定的应用前景。本研究旨在建立大熊猫UC-MSCs外泌体分离方法,开展生物学特征分析和分子鉴定,并研究UC-MSCs外泌体中miRNAs的种类与功能。采用超速离心法从大熊猫UCMSCs培养上清中成功分离外泌体,通过透射电子显微镜进行形态学观察,纳米颗粒跟踪分析仪检测粒径大小,蛋白免疫印迹法检测特异性分子标记表达。采用Small RNA测序技术对UC-MSCs外泌体中的miRNAs进行鉴定,并对其靶基因进行了预测与功能分析。结果显示,大熊猫UC-MSCs外泌体呈圆形杯托状结构,直径为(79.15±4.81)nm,外泌体标志蛋白CD81与TSG101呈阳性表达而CALNEXIN呈阴性表达。大熊猫UC-MSCs外泌体中的miRNA主要为miR-148-3p(30.28%)与miR-21-5p(21.72%)。本研究首次从大熊猫UC-MSCs培养上清中分离出外泌体,并对其所含的miRNAs进行富集分析及功能预测,为大熊猫UC-MSCs外泌体后续的功能研究及应用奠定基础。
关键词
大熊猫
脐带间充质干细胞
外泌体
MIRNA
Keywords
Giant panda
Umbilical cord mesenchymal stem cells
Exosomes
miRNA
分类号
Q341 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
德化县曾坂水泥用石灰岩矿体特征及矿石质量变化规律
4
作者
陈佳松
机构
福建省
出处
《能源与环境》
2015年第3期44-45,共2页
文摘
通过对矿体的化验成果进行数理统计,编制等值线与散点图等方法,对德化县曾坂水泥用石灰岩Ⅲ号矿体的厚度、产状、主要化学成分等特征数据,进行分析统计,总结其在水平方向与垂直方向上的变化规律,对外围找矿及矿石开采有一定的指导作用。
关键词
水泥用石灰岩矿
矿体特征
变化规律
统计分析
分类号
TD872.5 [矿业工程—非金属矿开采]
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职称材料
题名
福建省泉港大林山矿区钼矿物化探异常特征及找矿效果
5
作者
陈佳松
机构
福建省
出处
《能源与环境》
2013年第6期118-119,共2页
文摘
福建省泉港大林山矿区地表覆盖严重,地质找矿标志不明显,综合物化探方法对发现和圈定钼矿体起到了重要作用。总结矿床的地球物理、地球化学找矿标志,对于处于同一成矿远景区的其他地段寻找该类型矿床,具有十分重要的意义。
关键词
综合物化探
异常查证
找矿标志
钼矿
分类号
TD864.5 [矿业工程—金属矿开采]
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职称材料
题名
新集三矿可采煤层的覆岩破坏分析
6
作者
陈佳松
机构
福建省
出处
《能源与环境》
2012年第1期82-84,共3页
文摘
从覆岩运动的规律出发,探讨导水裂隙带高度的主要影响因素和计算方法;分析采动后覆岩离层发生的位置及其扩展规律,结合新集三矿实例就煤层覆岩破坏作进一步讨论。
关键词
覆岩破坏
导水裂高
分类号
TD163.1 [矿业工程—矿山地质测量]
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职称材料
题名
基于大数据的智慧城管设计方案
被引量:
8
7
作者
周宏成
陈佳松
机构
广东省电信规划设计院有限公司
出处
《电子技术与软件工程》
2019年第15期158-161,共4页
文摘
本文以智慧城市管理运行管理体系为基础,以城市管理综合数据库为支撑,将城市管理数据在各层面打通。本文设计的智慧化城市管理应用平台以精细化管理、人性化服务、高效化协同、多元化参与为手段,通过管理带动服务、以服务提升为目标实现城市管理水平提升。
关键词
智慧城管
指挥调度
大数据
云平台
物联网
分类号
TP399-C2 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
泉州市地质灾害现状分析与防治建议
被引量:
1
8
作者
陈佳松
机构
福建省煤田地质局
出处
《福建地质》
2010年第A01期111-114,共4页
文摘
泉州市由于自然地理、地质和气候条件,以及人类活动频繁,地质灾害频发,危害较大,应加强对地质灾害的防治研究,实施合理的减灾措施。
关键词
地质灾害
成灾条件
影响因素
防治措施
泉州市
Keywords
geologic hazard, disaster conditions, influencing factory, cure measures, Quanzhou City
分类号
P694 [天文地球—地质学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于转录组测序分析美洲大蠊提取物促进小鼠创面愈合的分子机制
陈佳松
陈峰
彭锐
耿福能
邹方东
《四川动物》
北大核心
2017
15
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职称材料
2
基于RNA-seq分析美洲大蠊提取物对结直肠癌细胞信号通路的影响
陈峰
陈佳松
彭锐
耿福能
邹方东
《四川动物》
北大核心
2017
2
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职称材料
3
大熊猫脐带间充质干细胞外泌体的分离鉴定及miRNAs富集分析
安俊辉
李媛
王东辉
陈佳松
李红艳
梁小虎
封同英
蔡志刚
侯蓉
曾长军
刘玉良
《兽类学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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职称材料
4
德化县曾坂水泥用石灰岩矿体特征及矿石质量变化规律
陈佳松
《能源与环境》
2015
0
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职称材料
5
福建省泉港大林山矿区钼矿物化探异常特征及找矿效果
陈佳松
《能源与环境》
2013
0
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职称材料
6
新集三矿可采煤层的覆岩破坏分析
陈佳松
《能源与环境》
2012
0
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职称材料
7
基于大数据的智慧城管设计方案
周宏成
陈佳松
《电子技术与软件工程》
2019
8
下载PDF
职称材料
8
泉州市地质灾害现状分析与防治建议
陈佳松
《福建地质》
2010
1
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职称材料
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