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三角褐指藻pds基因生物信息学与诱导表达分析 被引量:4
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作者 陈俊粤 龚一富 +4 位作者 朱帅旗 俞凯 章丽 王何瑜 严小军 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期2306-2313,共8页
岩藻黄素是一类具有重要药用价值和开发价值的新型海洋药物,八氢番茄红素脱氢酶(PDS)是三角褐指藻类岩藻黄素生物合成途径中的一个重要的限速酶。为了更好地开发和利用岩藻黄素,通过RT-PCR克隆了三角褐指藻pds基因(Ptpds,Gen Bank序号:X... 岩藻黄素是一类具有重要药用价值和开发价值的新型海洋药物,八氢番茄红素脱氢酶(PDS)是三角褐指藻类岩藻黄素生物合成途径中的一个重要的限速酶。为了更好地开发和利用岩藻黄素,通过RT-PCR克隆了三角褐指藻pds基因(Ptpds,Gen Bank序号:XM_002184476.1)c DNA全长序列,并从基因层面分析了外源诱导子对岩藻黄素生物合成的诱导机制,进一步探究Ptpds的结构和表达特性。结果表明,Ptpds基因cDNA全长2 442 bp,开放阅读框(ORF)为1 773 bp,编码589个氨基酸,并含有一个NAD(P)-binding结构域;蛋白分子结构预测结果表明,三角褐指藻PDS蛋白(PtPDS)分子呈亲水性,含有转运肽、信号肽、跨膜结构域等结构。系统进化树分析显示,PtPDS与新型微藻的PDS蛋白亲缘关系较近,且在所选取的藻类中进化地位较为原始。诱导表达结果表明,Me JA、ASA、AA、ACS等4种诱导子均能促进Ptpds基因的表达,且在4种诱导子处理下,三角褐指藻中的岩藻黄素含量变化与Ptpds基因的表达水平变化呈现高度的一致性,说明Ptpds基因是Me JA、ASA、AA、ACS等诱导子促进三角褐指藻岩藻黄素的生物积累的关键酶基因之一。本研究结果为探究藻类岩藻黄素合成机理提供了依据,并为利用代谢工程手段提高岩藻黄素含量奠定了理论基础。 展开更多
关键词 三角褐指藻 八氢番茄红素脱氢酶 岩藻黄素 生物信息学 诱导表达
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绿色杜氏藻异戊烯基焦磷酸异构酶基因(DvIPI)的生物信息学与诱导表达分析 被引量:2
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作者 陈俊粤 龚一富 +2 位作者 马颖瑞 周丽亚 王何瑜 《生命科学研究》 CAS CSCD 2017年第3期201-207,共7页
异戊烯基焦磷酸异构酶(isopentenyl diphosphate isomerase,DvIPI)是绿色杜氏藻中类胡萝卜素等萜类物质合成过程中甲羟戊酸途径(mevalonate pathway,MVA)通路上一个重要的限速酶。实验中获得绿色杜氏藻IPI基因的全长序列(Gen Bank序号:K... 异戊烯基焦磷酸异构酶(isopentenyl diphosphate isomerase,DvIPI)是绿色杜氏藻中类胡萝卜素等萜类物质合成过程中甲羟戊酸途径(mevalonate pathway,MVA)通路上一个重要的限速酶。实验中获得绿色杜氏藻IPI基因的全长序列(Gen Bank序号:KX189195),该基因全长4 641 bp,开放阅读框(ORF)为1 147 bp,编码382个氨基酸,并含有3个CBS结构域。蛋白质预测结果表明,DvIPI分子呈亲水性,不含信号肽,也不存在跨膜区域;同时,DvIPI中α-螺旋所占比例最高,中部呈现不规则的扭曲缠绕,两边各自有一个扭曲的多肽链单独远离中心。系统进化树分析显示,DvIPI与细菌IPI亲缘关系较近,而与被子植物以及其他藻类IPI亲缘关系较远。定量检测结果与RT-PCR结果表明,茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,Me JA)浓度为50~100μmol/L时,对绿色杜氏藻类中类胡萝卜素含量、叶绿素含量以及绿色杜氏藻IPI基因表达水平的影响最为明显,且三者的变化趋势基本一致,推测Me JA对绿色杜氏藻类中类胡萝卜素、叶绿素的诱导作用可能与绿色杜氏藻类IPI基因有关。 展开更多
关键词 绿色杜氏藻 异戊烯基焦磷酸异构酶基因(IPI) 生物信息学 CBS结构域蛋白(CDCP) 茉莉酸甲酯(Me JA)
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航空发动机轮盘优化设计的策略与纲要(轮盘优化设计系统TDSOS简介) 被引量:1
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作者 张东旭 程耿东 +3 位作者 隋允康 宋利民 刘湘生 陈俊粤 《航空动力学报》 EI CAS CSCD 北大核心 1992年第1期55-56,共2页
A number of strategies for optimal design of the gas turbine disks are proposed,which include separation of tenons design from disk design,rational simplification of structural model,check on local constraints,optimal... A number of strategies for optimal design of the gas turbine disks are proposed,which include separation of tenons design from disk design,rational simplification of structural model,check on local constraints,optimal design based on elastic analysis and further check based on elastoplastic analysis,multi level optimization by grouping design variables.According to the strategies a computer program TDSOS is developed for practical use.By applying the strategies and the program TDSOS,shape optimization of gas turbine disk with light mass and low stress level can be obtained and the contradiction among high performance index,reliability and long life expectation is better solved. 展开更多
关键词 航空发动机 轮盘 设计 最佳化
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花生四烯酸对三角褐指藻生长、脂质含量及相关基因表达的影响 被引量:6
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作者 周丽亚 龚一富 +4 位作者 俞凯 陈俊粤 王何瑜 章丽 严小军 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期1291-1297,共7页
为提高三角褐指藻生产生物柴油的能力,本研究利用不同浓度(0、0.5、2.5、12.5、62.5和312.5mg·L^(-1))的花生四烯酸(AA)处理三角褐指藻,探究三角褐指藻生长、总脂、游离脂肪酸的变化,并通过荧光定量PCR研究脂质生物合成途径中相关... 为提高三角褐指藻生产生物柴油的能力,本研究利用不同浓度(0、0.5、2.5、12.5、62.5和312.5mg·L^(-1))的花生四烯酸(AA)处理三角褐指藻,探究三角褐指藻生长、总脂、游离脂肪酸的变化,并通过荧光定量PCR研究脂质生物合成途径中相关基因的转录差异。结果表明,低浓度(0.1~62.5mg·L^(-1))的AA对三角褐指藻的生长有促进作用,高浓度(312.5 mg·L^(-1))则抑制其生长。游离脂肪酸与总脂含量结果表明,游离脂肪酸在AA浓度为12.5 mg·L^(-1)时达到最大值,较对照组提高了4倍;总脂则在AA浓度为62.5 mg·L^(-1)达到最大值,较对照组提高了54%。荧光定量PCR分析结果表明,在AA浓度为312.5 mg·L^(-1)时,油脂合成相关基因LPAAT、GPAT、KAS II、ACCase转录水平与对照组相比极显著提高(P<0.01)。综上,AA促进三角褐指藻油脂的积累可能是通过增加油脂生物合成相关基因表达来实现的。本研究结果为利用基因工程实现微藻油脂的能源化目的奠定了理论基础。 展开更多
关键词 花生四烯酸 三角褐指藻 生长 脂质 基因表达
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整体转子协调计算
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作者 王维岩 陈俊粤 《航空发动机》 1992年第3期57-67,共11页
关键词 转子 协调 计算 强度 航空发动机
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