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稻瘟病菌分泌复合物的生物信息学分析及MoSec15定位研究
被引量:
6
1
作者
陈四妙
陈晓峰
+2 位作者
杨成东
王宗华
周洁
《福建农林大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2014年第3期282-288,共7页
利用稻瘟病菌分泌途径相关的调控因子分泌复合物进行生物信息学分析及相关基因定位初探.经同源比对获得稻瘟病菌中分泌复合物8个亚基的同源蛋白,通过在线工具分析蛋白结构域、构建系统进化树、预测亚细胞定位;利用公共数据库获得其在稻...
利用稻瘟病菌分泌途径相关的调控因子分泌复合物进行生物信息学分析及相关基因定位初探.经同源比对获得稻瘟病菌中分泌复合物8个亚基的同源蛋白,通过在线工具分析蛋白结构域、构建系统进化树、预测亚细胞定位;利用公共数据库获得其在稻瘟病菌不同组织和发育阶段的表达情况;此外,亚细胞定位分析表明,稻瘟病菌分泌复合物亚基MoSec15可能定位于菌丝体的内膜结构中.
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关键词
分泌复合物
稻瘟病菌
生物信息学
MoSec15
定位
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职称材料
稻瘟病菌中一个假定Rho GTP酶激活蛋白与Rho族蛋白的互作关系
被引量:
1
2
作者
叶文雨
陈四妙
+6 位作者
陈晓
林艺娟
汪洋
余文英
鲁国东
陈继圣
王宗华
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期719-724,共6页
Rho族蛋白是重要的分子开关,受GTP酶激活蛋白(GAP)调控。MGG_09303在稻瘟病菌中编码一个假定的Rho GTP酶激活蛋白。为探讨其与Rho族蛋白的互作关系,本文首先将基因MGG_09303与酵母中RhoGAPs蛋白序列进行多重比对,结果表明MGG_09303与酿...
Rho族蛋白是重要的分子开关,受GTP酶激活蛋白(GAP)调控。MGG_09303在稻瘟病菌中编码一个假定的Rho GTP酶激活蛋白。为探讨其与Rho族蛋白的互作关系,本文首先将基因MGG_09303与酵母中RhoGAPs蛋白序列进行多重比对,结果表明MGG_09303与酿酒酵母中的RhoGAP蛋白的氨基酸同源性较高的有BEM3(29%)、BEM2(28%)、LRG1(27%),而相似性较高的有RGD2(53%)、LRG1(52%),还发现MGG_09303与酿酒酵母中的RhoGAP具有共同的保守的精氨酸。据此初步预测它有可能与Rho1和Rho3存在互作,本研究构建了pGADT7-MGG_09303捕获表达载体,利用酵母双杂交技术将捕获载体pGADT7-MGG_09303分别与Rho族蛋白持续激活态(CA)和失活态(DN)诱饵载体共转AH109酵母细胞,进行双杂交实验。结果表明,MGG_09303蛋白与Rho1和Rho3的持续激活态(CA)互作,而不与其负显性失活态(DN)互作,研究结果验证了预测的结果,为进一步研究RhoGAP蛋白对Rho族蛋白负调控的分子机制奠定了重要的基础。
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关键词
稻瘟病菌
酿酒酵母
RHO
GAP
序列比对
酵母双杂交
Rho族蛋白
相互作用
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职称材料
题名
稻瘟病菌分泌复合物的生物信息学分析及MoSec15定位研究
被引量:
6
1
作者
陈四妙
陈晓峰
杨成东
王宗华
周洁
机构
福建农林大学生命科学学院
福建农林大学植物保护学院
出处
《福建农林大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2014年第3期282-288,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(31070124)
福建省自然科学基金项目(2011J01073)
福建省教育厅重点项目(JA10098)
文摘
利用稻瘟病菌分泌途径相关的调控因子分泌复合物进行生物信息学分析及相关基因定位初探.经同源比对获得稻瘟病菌中分泌复合物8个亚基的同源蛋白,通过在线工具分析蛋白结构域、构建系统进化树、预测亚细胞定位;利用公共数据库获得其在稻瘟病菌不同组织和发育阶段的表达情况;此外,亚细胞定位分析表明,稻瘟病菌分泌复合物亚基MoSec15可能定位于菌丝体的内膜结构中.
关键词
分泌复合物
稻瘟病菌
生物信息学
MoSec15
定位
Keywords
exocyst complex
Magnaporthe oryzae
hioinformatics
MoSec15
localization
分类号
Q93-31 [生物学—微生物学]
S435.111.41 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
稻瘟病菌中一个假定Rho GTP酶激活蛋白与Rho族蛋白的互作关系
被引量:
1
2
作者
叶文雨
陈四妙
陈晓
林艺娟
汪洋
余文英
鲁国东
陈继圣
王宗华
机构
福建农林大学生命学院
福建农林大学植物保护学院
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期719-724,共6页
基金
国家自然科学基金(31030004
31300132)资助
文摘
Rho族蛋白是重要的分子开关,受GTP酶激活蛋白(GAP)调控。MGG_09303在稻瘟病菌中编码一个假定的Rho GTP酶激活蛋白。为探讨其与Rho族蛋白的互作关系,本文首先将基因MGG_09303与酵母中RhoGAPs蛋白序列进行多重比对,结果表明MGG_09303与酿酒酵母中的RhoGAP蛋白的氨基酸同源性较高的有BEM3(29%)、BEM2(28%)、LRG1(27%),而相似性较高的有RGD2(53%)、LRG1(52%),还发现MGG_09303与酿酒酵母中的RhoGAP具有共同的保守的精氨酸。据此初步预测它有可能与Rho1和Rho3存在互作,本研究构建了pGADT7-MGG_09303捕获表达载体,利用酵母双杂交技术将捕获载体pGADT7-MGG_09303分别与Rho族蛋白持续激活态(CA)和失活态(DN)诱饵载体共转AH109酵母细胞,进行双杂交实验。结果表明,MGG_09303蛋白与Rho1和Rho3的持续激活态(CA)互作,而不与其负显性失活态(DN)互作,研究结果验证了预测的结果,为进一步研究RhoGAP蛋白对Rho族蛋白负调控的分子机制奠定了重要的基础。
关键词
稻瘟病菌
酿酒酵母
RHO
GAP
序列比对
酵母双杂交
Rho族蛋白
相互作用
Keywords
Magnaporthe oryzae, Saccharomyces cerevisiae, RhoGAP, Sequence alignment, Yeast two-hybrid, Rho- family protein, Interaction
分类号
S435.111.41 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
稻瘟病菌分泌复合物的生物信息学分析及MoSec15定位研究
陈四妙
陈晓峰
杨成东
王宗华
周洁
《福建农林大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2014
6
下载PDF
职称材料
2
稻瘟病菌中一个假定Rho GTP酶激活蛋白与Rho族蛋白的互作关系
叶文雨
陈四妙
陈晓
林艺娟
汪洋
余文英
鲁国东
陈继圣
王宗华
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2013
1
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职称材料
已选择
0
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