基于区块链的基因数据共享平台方案研究

在生物科研领域,基因组测序是科学探索的重要手段.但由于基因组测序价格高、数据体量大,使不同研究机构之间难以共享.新兴的区块链技术由于具备透明性、可追溯性和不可篡改性,使其更加适用于无中介的多方合作场景.探讨使用区块链技术建立基因测序数据分享平台的可行性,旨在使不同研究机构之间可以去中心化地分享基因组数据,具备分享激励的同时保证公平、公正和透明,从而降低科研成本,促进重要科研成果的探索与发现.

野战医疗所快速通信系统部署的研究

目的解决野战医疗所在应急救援过程中的医疗数据业务通信、现场应急指挥调度需求。方法基于LTE 4G无线专网的技术,采用OFDM、MIMO等多种先进技术以及定制的专业宽带集群技术,建立了高速稳定的数据传输专网。结果野战救援通信系统得到快速部署。结论快速通信系统具备覆盖距离远、安装简易且不易受环境影响的特点,能够解决现有有线通信系统中难部署、易故障等问题,满足了在应急救援过程中的通信需求。

大肠杆菌基因组水平蛋白质-RNA相互作用初步研究

目的初步研究大肠杆菌中基因组水平的蛋白质-RNA相互作用(protein-RNA interactions,PRI)。方法通过RNA酶消化细菌裂解液,提取与蛋白质相互作用的RNA片段,构建cDNA文库,进行高通量测序,并通过生物信息学分析获得与蛋白质结合的转录本。结果获得了与蛋白质结合的3193条转录本,涉及2234个mRNA、47个sRNA(small regulatory RNAs)、39个tRNA、11个rRNA以及862个基因间区(intergenic region,IGR)。结论初步获得大肠杆菌中与蛋白质相互作用的转录本信息,为进一步开展PRI研究提供了支持。

变分因子分析:一种基于深度生成模型的单细胞转录组数据因子分析方法

目的提出一种基于深度生成模型的单细胞转录组数据因子分析方法,并通过从细胞和基因两个层面探索生物异质性来解释模型结果。方法采用深度生成网络,构建面向单细胞转录组数据因子分析的深度生成模型,用小鼠胚胎发育细胞转录组数据训练模型,对结果进行细胞类型注释、因子及载荷可视化等下游生物学分析。结果该模型实现了单细胞转录组数据的降维并同时保留了异质性,通过因子识别了不同细胞类型之间的特征,通过载荷鉴定出细胞特异性基因。结论基于深度生成模型构建的因子分析方法具有更好的可解释性,能从信息复杂、具有错综关系的单细胞转录组数据中提取代表性信息,并从不同层面解析其生物学含义,为单细胞数据分析开拓了新思路。