目的用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)仪构建海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌鉴定数据库,评价自建库鉴定准确性并与国外同类产品进行比...目的用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)仪构建海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌鉴定数据库,评价自建库鉴定准确性并与国外同类产品进行比较。方法海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌质谱数据库的构建:收集海南患者标本分离10株类鼻疽伯克霍尔德菌用于建库,以VITEK MS RUO模式进行图谱采集及数据库构建,每株菌平行涂布共12个靶点,得到120张质谱图;分别将10株类鼻疽伯克霍尔德菌经35℃和25℃培养24 h,每株菌每个血平板和巧克力平板分别涂3个靶点,共涂了120个靶点,每个靶点采集1次,得到120张质谱图。培养48 h,再次进行同样的靶点采集120张图谱。将采集获得240张图谱按标准精选得到优质图谱109张。通过仪器建库参数确认,控制原始波峰数量,筛选特征峰并赋权予权重,调整质量数、谱峰强度在规定范围,经过SARAMIS软件分析生成海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌数据库。数据库验证:收集海南不同地区来源患者类鼻疽伯克霍尔德菌30株及其他伯克霍尔德菌20株,以16SrRAN基因测序为金标准,比较自建数据库与VITEK MS v 4.16数据库鉴定类鼻疽伯克霍尔德菌的准确性及图谱特征。结果构建的海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌质谱数据库经30株类鼻疽伯克霍尔德菌验证菌株确认,基于自建数据库,种水平鉴定准确率为100.0%(30/30),高于VITEK MS v 4.16数据库准确率56.67%(17/30),差异有统计学意义(χ^(2)=11.08,P<0.005)。结论构建的海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌质谱数据库质量达到临床常规鉴定应用要求,就海南病原流行株的鉴定准确率优于国外同类产品。展开更多
目的：回顾性分析该院金黄色葡萄球菌在临床感染的分布调查，对其耐药性变迁情况进行调查研究，为临床抗感染治疗提供依据。方法对2012年1～12月该院送检的13175例标本中分离出406株金黄色葡萄球菌进行临床感染分布及药敏试验结果进行...目的：回顾性分析该院金黄色葡萄球菌在临床感染的分布调查，对其耐药性变迁情况进行调查研究，为临床抗感染治疗提供依据。方法对2012年1～12月该院送检的13175例标本中分离出406株金黄色葡萄球菌进行临床感染分布及药敏试验结果进行统计对比分析；分离菌株用VIT EK 2 Compact型全自动微生物鉴定及药敏系统进行鉴定，用珠海美华医疗科技有限公司生产的葡萄球菌鉴定及药敏分析系统测试板进行药敏试验。结果金黄色葡萄球菌在科室感染分布中分离率最高的是儿科和神经外科。在临床各类标本中分离率最高的标本是痰液和脓液。金黄色葡萄球菌耐药率最低的是达托霉素和万古霉素耐药率为0％，耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（M RS A ）菌株的耐药性明显高于非M RS A菌株的耐药性。金黄色葡萄球菌对万古霉素敏感性减低筛查显示耐药率存在上升趋势；结论三亚地区金黄色葡萄球菌对达托霉素和万古霉素保持较好的敏感性，仍可作为临床抗感染的治疗首选药物。应加强金黄色葡萄球菌耐药基因的检测，可避免多药耐药菌株在院内感染的流行，可指导临床选择用药。展开更多
目的调查海南地区类鼻疽伯克霍尔德菌的分子流行病学特征,为该地区类鼻疽监测防控提供参考。方法采集可疑患者的临床样本进行类鼻疽的分离培养,采用形态特征观察和染色镜检对临床分离的类鼻疽进行鉴定。采用HGDI分析菌株的遗传多态性特...目的调查海南地区类鼻疽伯克霍尔德菌的分子流行病学特征,为该地区类鼻疽监测防控提供参考。方法采集可疑患者的临床样本进行类鼻疽的分离培养,采用形态特征观察和染色镜检对临床分离的类鼻疽进行鉴定。采用HGDI分析菌株的遗传多态性特征,用MLVA_4方法调查类鼻疽伯克霍尔德菌的分子流行病学关联,并构建MST(最小生成树)揭示菌株的起源进化特征。同时,对患者的年龄、性别、职业分布、临床特征及治疗结果进行分析。结果在164株类鼻疽伯克霍尔德菌中,有66%(109/164)的菌株分布于海南省的三亚、东方和乐东等西南沿海地区。MLVA_4方法对菌株具有极高的分辨力,HGDI为0.9887。4个分型位点的多态性指数由高到低依次为0.9130(L933),0.8322(L2341),0.8237(L1788)和0.8096(L389)。164株类鼻疽聚为97个MLVA_4基因型(GT1~97),其中33个为共享基因型表明该类基因型的菌株间可能有潜在的流行病学关联。另外64个为单一基因型且每株菌代表一个独特的基因型,表明该地区多于39%的类鼻疽具有零星或散发的流行特征。在33个共享基因型中,14个共享基因型(GT6、16、18、22、33、39、41、49、50、51、58、61、85和92)由来自相同地区分离的菌株构成,证实了该地区类鼻疽呈现由多个共同传染源引发的多点流行的特征;另外,有28个共享基因型(除GT6、41、58、61和92外其他所有共享基因型)分别由2-5个不同地区分离的菌株构成,揭示了该地区类鼻疽可能存在由多个共同传染源引发的多地交叉感染,33个共享基因型包括100株类鼻疽伯克霍尔德菌,菌株聚类率为61.0%(100/164),所有共享基因型的菌株都来自2-5个不同地区,提示类鼻疽在海南省多个地区均有流行。基于MLVA_4数据的最小生成树(Minimum spanning tree MST)分析结果表明164株类鼻疽伯克霍尔德菌可分为2个地理集群,定安县的菌株是海南省类鼻疽的潜在祖先。164名患者的平均年龄为48.5岁,男女比例为5.3∶1。农民患者最多,占比81.7%(134/164)。有18例患者死亡,死亡率11%。结论海南省类鼻疽病流行趋于严重。病例主要集中在西南沿海市县,但菌株可能起源于北部的定安县,加强类鼻疽监测防控势在必行。展开更多
文摘目的用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)仪构建海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌鉴定数据库,评价自建库鉴定准确性并与国外同类产品进行比较。方法海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌质谱数据库的构建:收集海南患者标本分离10株类鼻疽伯克霍尔德菌用于建库,以VITEK MS RUO模式进行图谱采集及数据库构建,每株菌平行涂布共12个靶点,得到120张质谱图;分别将10株类鼻疽伯克霍尔德菌经35℃和25℃培养24 h,每株菌每个血平板和巧克力平板分别涂3个靶点,共涂了120个靶点,每个靶点采集1次,得到120张质谱图。培养48 h,再次进行同样的靶点采集120张图谱。将采集获得240张图谱按标准精选得到优质图谱109张。通过仪器建库参数确认,控制原始波峰数量,筛选特征峰并赋权予权重,调整质量数、谱峰强度在规定范围,经过SARAMIS软件分析生成海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌数据库。数据库验证:收集海南不同地区来源患者类鼻疽伯克霍尔德菌30株及其他伯克霍尔德菌20株,以16SrRAN基因测序为金标准,比较自建数据库与VITEK MS v 4.16数据库鉴定类鼻疽伯克霍尔德菌的准确性及图谱特征。结果构建的海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌质谱数据库经30株类鼻疽伯克霍尔德菌验证菌株确认,基于自建数据库,种水平鉴定准确率为100.0%(30/30),高于VITEK MS v 4.16数据库准确率56.67%(17/30),差异有统计学意义(χ^(2)=11.08,P<0.005)。结论构建的海南病原类鼻疽伯克霍尔德菌质谱数据库质量达到临床常规鉴定应用要求,就海南病原流行株的鉴定准确率优于国外同类产品。
文摘目的：回顾性分析该院金黄色葡萄球菌在临床感染的分布调查，对其耐药性变迁情况进行调查研究，为临床抗感染治疗提供依据。方法对2012年1～12月该院送检的13175例标本中分离出406株金黄色葡萄球菌进行临床感染分布及药敏试验结果进行统计对比分析；分离菌株用VIT EK 2 Compact型全自动微生物鉴定及药敏系统进行鉴定，用珠海美华医疗科技有限公司生产的葡萄球菌鉴定及药敏分析系统测试板进行药敏试验。结果金黄色葡萄球菌在科室感染分布中分离率最高的是儿科和神经外科。在临床各类标本中分离率最高的标本是痰液和脓液。金黄色葡萄球菌耐药率最低的是达托霉素和万古霉素耐药率为0％，耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（M RS A ）菌株的耐药性明显高于非M RS A菌株的耐药性。金黄色葡萄球菌对万古霉素敏感性减低筛查显示耐药率存在上升趋势；结论三亚地区金黄色葡萄球菌对达托霉素和万古霉素保持较好的敏感性，仍可作为临床抗感染的治疗首选药物。应加强金黄色葡萄球菌耐药基因的检测，可避免多药耐药菌株在院内感染的流行，可指导临床选择用药。
文摘目的调查海南地区类鼻疽伯克霍尔德菌的分子流行病学特征,为该地区类鼻疽监测防控提供参考。方法采集可疑患者的临床样本进行类鼻疽的分离培养,采用形态特征观察和染色镜检对临床分离的类鼻疽进行鉴定。采用HGDI分析菌株的遗传多态性特征,用MLVA_4方法调查类鼻疽伯克霍尔德菌的分子流行病学关联,并构建MST(最小生成树)揭示菌株的起源进化特征。同时,对患者的年龄、性别、职业分布、临床特征及治疗结果进行分析。结果在164株类鼻疽伯克霍尔德菌中,有66%(109/164)的菌株分布于海南省的三亚、东方和乐东等西南沿海地区。MLVA_4方法对菌株具有极高的分辨力,HGDI为0.9887。4个分型位点的多态性指数由高到低依次为0.9130(L933),0.8322(L2341),0.8237(L1788)和0.8096(L389)。164株类鼻疽聚为97个MLVA_4基因型(GT1~97),其中33个为共享基因型表明该类基因型的菌株间可能有潜在的流行病学关联。另外64个为单一基因型且每株菌代表一个独特的基因型,表明该地区多于39%的类鼻疽具有零星或散发的流行特征。在33个共享基因型中,14个共享基因型(GT6、16、18、22、33、39、41、49、50、51、58、61、85和92)由来自相同地区分离的菌株构成,证实了该地区类鼻疽呈现由多个共同传染源引发的多点流行的特征;另外,有28个共享基因型(除GT6、41、58、61和92外其他所有共享基因型)分别由2-5个不同地区分离的菌株构成,揭示了该地区类鼻疽可能存在由多个共同传染源引发的多地交叉感染,33个共享基因型包括100株类鼻疽伯克霍尔德菌,菌株聚类率为61.0%(100/164),所有共享基因型的菌株都来自2-5个不同地区,提示类鼻疽在海南省多个地区均有流行。基于MLVA_4数据的最小生成树(Minimum spanning tree MST)分析结果表明164株类鼻疽伯克霍尔德菌可分为2个地理集群,定安县的菌株是海南省类鼻疽的潜在祖先。164名患者的平均年龄为48.5岁,男女比例为5.3∶1。农民患者最多,占比81.7%(134/164)。有18例患者死亡,死亡率11%。结论海南省类鼻疽病流行趋于严重。病例主要集中在西南沿海市县,但菌株可能起源于北部的定安县,加强类鼻疽监测防控势在必行。
