色氨酸代谢与肝纤维化

肝纤维化是一种肝脏组织在长期炎症状态下持续损伤和自我修复形成纤维化瘢痕的过程,以细胞外基质过度沉积为特征的病理综合征.目前肝纤维化常见的病因包括酒精性脂肪肝炎、非酒精性肝炎、胆汁淤积性肝病、化学性肝损伤、病毒性肝炎等.肝纤维化是肝硬化和肝功能衰竭的主要前期阶段,在持续炎症刺激下,若不加以控制,可能会进一步发展成肝硬化,乃至肝癌,对患者的治疗负担和生存质量产生重要影响.近年来,研究表明色氨酸及其代谢产物在肝纤维化的发生和进展中起着重要的调控作用,本文将综述色氨酸代谢与肝纤维化的相关研究进展,以期深入了解其潜在的治疗价值.

基于生物信息分析方法探究ADME基因在肝癌的表达及潜在调控机制

目的基于生物信息学分析方法,了解肝癌状态下肝脏中与药物吸收、分布、代谢及排泄(ADME)相关的基因表达及调控情况。方法首先通过GEO数据获取240个肿瘤组织和193个正常组织的基因芯片数据,利用鉴定显著差异的ADME基因。并进一步使用JASPER数据库获取转录因子基因集,使用WGCNA分析转录因子与差异ADME基因调控关联性。结果与正常肝组织相比,肿瘤组织中有66个ADME基因表达水平发生显著改变,其中6个上调60个下调。通过构建WGCNA共表达网络,并对blue模块和turqu oise模块分析,其中SLC39A1、NAT2、CYP39A1和CYP1A2主要分布在blue模块,与转录因子CA T、VEZF1、FOS和CEBPG高度相关;SLC12A9和SLC25A39主要分布在turquoise模块,与转录因子IRF3、GMEB2、PRDM4、SOX13高度相关。结论我们通过生物信息学分析发现多个ADME基因在肝癌中患者中异常表达,并通过WGCNA分析发现与之表达高度相关转录因子,为肝癌组织中ADME基因异常表达及其调控研究提供理论基础。