四川牦牛PPARGC1B基因SNP位点筛选及生物信息学分析

采用PCR产物直接测序法检测四川牦牛过氧化物酶增殖激活受体γ辅激活因子-1β(peroxisome proliferator-activated receptor gamma,coactivator 1 beta,PPARGC1B)基因SNP位点,同时通过PCR扩增和测序获得四川牦牛PPARGC1B基因编码区,并对编码蛋白和mRNA二级结构进行了生物信息学预测分析。结果显示,本试验通过四川牦牛PPARGC1B基因的单核苷酸多态性检测结果,筛选出E9-189 A→C、E9-387 G→A、E9-542 C→T和E9-554 T→C共4个外显子SNP突变位点,其中E9-387 G→A和E9-554 T→C位点与四川牦牛肉品质性状中的剪切力和背膘厚具有显著相关性;对4个突变位点的生物信息学分析结果显示,PPARGC1B蛋白属于酸性、不稳定、非跨膜和非分泌型亲水蛋白,有卷曲螺旋结构,不存在信号肽和跨膜区域,主要在细胞核中发挥生物学作用,有106个磷酸化位点和1个糖基化位点,1个保守结构RRM结构,二级结构主要α-螺旋和无规则卷曲为主;PPARGC1B基因突变前后蛋白结构未发生变化,mRNA二级结构出现了显著差异。结果表明,PPARGC1B基因SNP位点可作为影响四川牦牛肉品质性状的分子标记,并应用于肉牛的标记辅助选择,同时对PPARGC1B基因相关SNP位点的生物信息学分析也为深入探讨该基因的生物学功能奠定基础。

绿原酸和咖啡酸对雷州山羊精液冷冻保存效果的影响

为了提高冻-解后精液品质,探讨绿原酸和咖啡酸对雷州山羊精液冷冻保存效果的影响,笔者在冷冻保存稀释液中分别添加100μmol/L的绿原酸(CGA)和咖啡酸(CA),并以无添加组为对照,实施了冷冻保存实验。通过检测冻-解后精子活率、活力、生存率、质膜完整性、顶体完整性等指标评估精液品质,并检测了活性氧(ROS)水平、过氧化氢酶(CAT)、超氧化物歧化酶(SOD)、谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-PX)、氧化产物丙二醛(MDA)、线粒体膜电位(MMP)等抗氧化指标。结果显示,在冷冻保存稀释液中添加CGA和CA可显著(P<0.05)提高冻-解雷州山羊精液品质(精子活率、活力、生存率等),有效提高SOD、GSH-PX、CAT等酶活性和MMP(P<0.05),降低了精子ROS水平和MDA的含量(P<0.05),从而提高了雷州山羊精液冷冻保存效果。结果表明,在冷冻保存稀释液中添加CGA和CA能显著提高冻-解后雷州山羊精液品质和抗氧化性能,进而提高雷州山羊精液冷冻保存效果。