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TIMP1与EFEMP1在直肠癌中的表达水平及预后意义
被引量:
3
1
作者
谭莹
练国达
+4 位作者
陈少杰
李佳佳
陈尚祥
黄开红
陈茵婷
《岭南现代临床外科》
2020年第2期161-166,共6页
目的运用TCGA数据库,分析组织金属蛋白酶抑制剂-1(TIMP1)在直肠癌中的表达情况,及与直肠癌预后的关系。分析与TIMP1高表达组与低表达组差异基因的分子功能及生物学功能。分析TIMP1与EFEMP1的关系,EFEMP1与直肠癌预后的关系。方法下载TCG...
目的运用TCGA数据库,分析组织金属蛋白酶抑制剂-1(TIMP1)在直肠癌中的表达情况,及与直肠癌预后的关系。分析与TIMP1高表达组与低表达组差异基因的分子功能及生物学功能。分析TIMP1与EFEMP1的关系,EFEMP1与直肠癌预后的关系。方法下载TCGA数据库中直肠癌相关数据,分析TIMP1在癌旁组织与直肠癌组织中的表达差异。分析不同临床分期患者的TIMP1表达水平。Kaplan-Meier生存曲线分析TIMP1表达量与直肠癌患者总体生存时间(OS)和无瘤生存时间(PFS)的关系。根据TIMP1表达水平,将直肠癌病人分为TIMP1高表达与低表达组,分析两组差异基因。对差异基因进行富集分析及通路分析,从而探索TIMP1相关基因的功能。寻找与TIMP1密切相关的基因,分析其与TIMP1的相关性,分析其与直肠癌预后的关系。结果与癌旁组织比较,TIMP1在直肠癌组织中呈高表达,Ⅰ期、Ⅱ期、Ⅲ期和Ⅳ期患者的TIMP1水平比对照组高。TIMP1表达水平越高,患者总体生存时间与无瘤生存时间越短,预后越差。基因富集结果显示,TIMP1高表达组与低表达组的差异基因,大多参与细胞黏附,维持细胞外基质稳定性等生物学过程。通路分析结果显示,差异基因在功能上与参与上皮-间质转化(EMT)的基因存在密切关联。其中含表皮生长因子的纤维蛋白样细胞外基质蛋白1(EFEMP1)基因与TIMP1呈正相关,EFEMP1表达越高,直肠癌患者总体生存时间和无瘤生存时间越短,预后越差。结论TIMP1在直肠癌中高表达,与预后呈负相关。TIMP1与EFEMP1呈正相关;EFEMP1基因在直肠癌中与预后呈负相关。
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关键词
TCGA
TIMP1
EFEMP1
EMT
直肠癌
预后
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职称材料
240例胰腺癌肝转移临床特征及预后分析
被引量:
2
2
作者
李宣娜
陈尚祥
+2 位作者
练国达
陈少杰
黄开红
《岭南现代临床外科》
2020年第2期151-154,160,共5页
目的研究胰腺导管腺癌(PDAC)肝转移患者临床与病理特征,并分析影响患者预后危险因素。方法回顾性分析2007年1月至2014年10月中山大学孙逸仙纪念医院具有完整临床病理资料PDAC肝转移病例共240例,并随访本组患者。采用Kaplan-Meier统计学...
目的研究胰腺导管腺癌(PDAC)肝转移患者临床与病理特征,并分析影响患者预后危险因素。方法回顾性分析2007年1月至2014年10月中山大学孙逸仙纪念医院具有完整临床病理资料PDAC肝转移病例共240例,并随访本组患者。采用Kaplan-Meier统计学方法评估患者生存情况,并用Cox单因素分析、多因素回归模型筛选影响患者预后的独立危险因素。结果在纳入本研究患者中,截至随访终点,共有227名患者死亡(94.58%),中位生存时间为5.34月。6个月,1年,3年生存率分别为36.50%、16.36%和5.39%。单因素生存分析提示年龄、CA19-9、肿瘤分化程度、T分期、化疗为预后危险因素。多因素分析显示T4分期、肿瘤低分化、未接受化疗为胰腺癌肝转移患者预后独立危险因素。结论T4分期、肿瘤低分化程度、未接受化疗为胰腺癌肝转移患者预后独立危险因素。
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关键词
胰腺癌
临床资料
预后
危险因素
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职称材料
胰腺癌预后相关铁死亡基因筛选及预后预测模型构建
3
作者
何冲
周姝睿
+4 位作者
李雅晴
陈少杰
练国达
陈尚祥
黄开红
《岭南现代临床外科》
2022年第1期14-23,共10页
目的探讨铁死亡相关基因对胰腺癌患者预后预测的价值,并进一步探索其分子机制。方法从公共数据库中下载胰腺癌患者的基因表达及相应的临床病理数据,采用R软件"limma"包筛选胰腺癌组织中差异表达基因,使用单因素COX回归分析筛...
目的探讨铁死亡相关基因对胰腺癌患者预后预测的价值,并进一步探索其分子机制。方法从公共数据库中下载胰腺癌患者的基因表达及相应的临床病理数据,采用R软件"limma"包筛选胰腺癌组织中差异表达基因,使用单因素COX回归分析筛选预后相关的铁死亡相关基因,利用LASSO COX回归分析构建预后模型。通过Kaplan-Meier生存分析检验该模型在预测胰腺癌预后中的意义,用ROC曲线评估模型预测胰腺癌预后的准确性。在ICGC验证队列中通过Kaplan-Meier生存分析、ROC曲线评估该模型在外部队列中的预测价值。依照风险值中位数,将TCGA训练队列分为两组,比较其基因表达差异、差异基因富集通路差异,评估免疫细胞浸润丰度。结果通过单因素COX回归分析,37个铁死亡相关基因被鉴定为预后基因(P<0.05)。利用LASSO COX回归分析,构建了一个基于15个铁死亡相关基因的预后预测模型。根据模型计算将队列中所有患者分为高风险组和低风险组,Kaplan-Meier生存分析表明高风险组的胰腺癌患者较低风险组生存时间短(HR=2.16,P<0.05)。ROC曲线分析证明了预测模型在胰腺癌预后预测中的准确性:ROC曲线下面积值分别为0.74(1年)、0.82(3年)、0.88(5年)。对高低风险组差异表达基因进行功能富集分析,发现两组胰腺癌患者免疫微环境之间存在差异,高风险组中幼稚B细胞、浆细胞、CD8^(+)T细胞浸润程度较低风险组低,但M0和M1巨噬细胞的浸润程度高(P<0.05)。此外,在PD-1和CTLA4在TCGA-PAAD队列低危组和高危组中的表达中,TCGA-PAAD队列低风险组患者中PD-1和CTLA4的表达水平较高风险组患者更高(P<0.05)。结论本研究构建了胰腺癌中铁死亡相关基因预后预测模型,具有预测胰腺癌患者预后的作用,并发现TCGA队列中高低风险组免疫微环境存在差异,可为免疫治疗提供参考。
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关键词
胰腺癌
铁死亡
预后
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职称材料
腹腔镜联合内镜治疗胃部肿瘤
4
作者
韩方海
陈尚祥
周声宁
《中华胃肠外科杂志》
CSCD
北大核心
2023年第8期745-752,共8页
随着医疗技术的飞速发展和人们卫生健康意识的增强,良性胃部肿瘤和早期胃癌的检出比例显著增加。如何在保证肿瘤学安全性的前提下,根据胃部肿瘤特征、采用精准合理的治疗方案以实现个体化和精准化治疗、最大限度减少手术创伤及并发症从...
随着医疗技术的飞速发展和人们卫生健康意识的增强,良性胃部肿瘤和早期胃癌的检出比例显著增加。如何在保证肿瘤学安全性的前提下,根据胃部肿瘤特征、采用精准合理的治疗方案以实现个体化和精准化治疗、最大限度减少手术创伤及并发症从而改善患者术后生活质量,是胃肠外科医生面临的新挑战。腹腔镜手术和消化内镜手术是当前治疗胃部肿瘤的两种主要手段,但是两者均有其优缺点。而腹腔镜结合内镜治疗胃部肿瘤,已成为治疗胃部肿瘤的新方式。该术式在发挥腹腔镜和内镜优势的同时,也实现了对两种手术的优势互补。本文讨论了腹腔镜联合内镜治疗胃部肿瘤的手术技术类别、适应证以及技术改进和展望。
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关键词
胃肿瘤
双镜联合手术
腹腔镜
内镜
适应证
原文传递
题名
TIMP1与EFEMP1在直肠癌中的表达水平及预后意义
被引量:
3
1
作者
谭莹
练国达
陈少杰
李佳佳
陈尚祥
黄开红
陈茵婷
机构
中山大学孙逸仙纪念医院消化科
出处
《岭南现代临床外科》
2020年第2期161-166,共6页
基金
国家自然科学基金(81972741,81672408)
广东省自然科学基金(2020A1515010341)
+3 种基金
中大青年教师培养项目(19ykpy109)
广东省自然科学基金博士科研启动项目(2018A030310227)
中央高校基本科研业务费资助项目(18zxxt59)
广东省医学科学技术研究基金项目(A2018012)。
文摘
目的运用TCGA数据库,分析组织金属蛋白酶抑制剂-1(TIMP1)在直肠癌中的表达情况,及与直肠癌预后的关系。分析与TIMP1高表达组与低表达组差异基因的分子功能及生物学功能。分析TIMP1与EFEMP1的关系,EFEMP1与直肠癌预后的关系。方法下载TCGA数据库中直肠癌相关数据,分析TIMP1在癌旁组织与直肠癌组织中的表达差异。分析不同临床分期患者的TIMP1表达水平。Kaplan-Meier生存曲线分析TIMP1表达量与直肠癌患者总体生存时间(OS)和无瘤生存时间(PFS)的关系。根据TIMP1表达水平,将直肠癌病人分为TIMP1高表达与低表达组,分析两组差异基因。对差异基因进行富集分析及通路分析,从而探索TIMP1相关基因的功能。寻找与TIMP1密切相关的基因,分析其与TIMP1的相关性,分析其与直肠癌预后的关系。结果与癌旁组织比较,TIMP1在直肠癌组织中呈高表达,Ⅰ期、Ⅱ期、Ⅲ期和Ⅳ期患者的TIMP1水平比对照组高。TIMP1表达水平越高,患者总体生存时间与无瘤生存时间越短,预后越差。基因富集结果显示,TIMP1高表达组与低表达组的差异基因,大多参与细胞黏附,维持细胞外基质稳定性等生物学过程。通路分析结果显示,差异基因在功能上与参与上皮-间质转化(EMT)的基因存在密切关联。其中含表皮生长因子的纤维蛋白样细胞外基质蛋白1(EFEMP1)基因与TIMP1呈正相关,EFEMP1表达越高,直肠癌患者总体生存时间和无瘤生存时间越短,预后越差。结论TIMP1在直肠癌中高表达,与预后呈负相关。TIMP1与EFEMP1呈正相关;EFEMP1基因在直肠癌中与预后呈负相关。
关键词
TCGA
TIMP1
EFEMP1
EMT
直肠癌
预后
Keywords
TCGA
TIMP1
EFEMP1
EMT
rectum cancer
prognosis
分类号
R735.37 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
240例胰腺癌肝转移临床特征及预后分析
被引量:
2
2
作者
李宣娜
陈尚祥
练国达
陈少杰
黄开红
机构
中山大学孙逸仙纪念医院消化内科
出处
《岭南现代临床外科》
2020年第2期151-154,160,共5页
基金
国家自然科学基金面上项目(81572396,81874057)
广东省自然科学基金博士科研启动项目(2018A030310227)
+1 种基金
中央高校基本科研业务费资助项目(18zxxt59)
广东省医学科学技术研究基金项目(A2018012)。
文摘
目的研究胰腺导管腺癌(PDAC)肝转移患者临床与病理特征,并分析影响患者预后危险因素。方法回顾性分析2007年1月至2014年10月中山大学孙逸仙纪念医院具有完整临床病理资料PDAC肝转移病例共240例,并随访本组患者。采用Kaplan-Meier统计学方法评估患者生存情况,并用Cox单因素分析、多因素回归模型筛选影响患者预后的独立危险因素。结果在纳入本研究患者中,截至随访终点,共有227名患者死亡(94.58%),中位生存时间为5.34月。6个月,1年,3年生存率分别为36.50%、16.36%和5.39%。单因素生存分析提示年龄、CA19-9、肿瘤分化程度、T分期、化疗为预后危险因素。多因素分析显示T4分期、肿瘤低分化、未接受化疗为胰腺癌肝转移患者预后独立危险因素。结论T4分期、肿瘤低分化程度、未接受化疗为胰腺癌肝转移患者预后独立危险因素。
关键词
胰腺癌
临床资料
预后
危险因素
Keywords
Pancreatic cancer
Clinical features
Prognosis
Risk factors
分类号
R735.9 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
胰腺癌预后相关铁死亡基因筛选及预后预测模型构建
3
作者
何冲
周姝睿
李雅晴
陈少杰
练国达
陈尚祥
黄开红
机构
中山大学孙逸仙纪念医院消化内科
出处
《岭南现代临床外科》
2022年第1期14-23,共10页
基金
国家自然科学基金面上项目(81874057)
国家自然科学基金青年项目(82103142)
+8 种基金
国家自然科学基金青年项目(82003175)
国家自然科学基金青年项目(82002505)
中国博士后科学基金第70批面上项目(2021M703701)
广东省医学科学技术研究基金(A2016210)
广东省医学科学技术研究基金(A2019447)
广东省医学科学技术研究基金(A2021158)
广东省自然区域联合基金-青年基金项目(2020A1515110841)
广州市科技计划项目(202102020082)
广州市科技计划项目(202102020161)。
文摘
目的探讨铁死亡相关基因对胰腺癌患者预后预测的价值,并进一步探索其分子机制。方法从公共数据库中下载胰腺癌患者的基因表达及相应的临床病理数据,采用R软件"limma"包筛选胰腺癌组织中差异表达基因,使用单因素COX回归分析筛选预后相关的铁死亡相关基因,利用LASSO COX回归分析构建预后模型。通过Kaplan-Meier生存分析检验该模型在预测胰腺癌预后中的意义,用ROC曲线评估模型预测胰腺癌预后的准确性。在ICGC验证队列中通过Kaplan-Meier生存分析、ROC曲线评估该模型在外部队列中的预测价值。依照风险值中位数,将TCGA训练队列分为两组,比较其基因表达差异、差异基因富集通路差异,评估免疫细胞浸润丰度。结果通过单因素COX回归分析,37个铁死亡相关基因被鉴定为预后基因(P<0.05)。利用LASSO COX回归分析,构建了一个基于15个铁死亡相关基因的预后预测模型。根据模型计算将队列中所有患者分为高风险组和低风险组,Kaplan-Meier生存分析表明高风险组的胰腺癌患者较低风险组生存时间短(HR=2.16,P<0.05)。ROC曲线分析证明了预测模型在胰腺癌预后预测中的准确性:ROC曲线下面积值分别为0.74(1年)、0.82(3年)、0.88(5年)。对高低风险组差异表达基因进行功能富集分析,发现两组胰腺癌患者免疫微环境之间存在差异,高风险组中幼稚B细胞、浆细胞、CD8^(+)T细胞浸润程度较低风险组低,但M0和M1巨噬细胞的浸润程度高(P<0.05)。此外,在PD-1和CTLA4在TCGA-PAAD队列低危组和高危组中的表达中,TCGA-PAAD队列低风险组患者中PD-1和CTLA4的表达水平较高风险组患者更高(P<0.05)。结论本研究构建了胰腺癌中铁死亡相关基因预后预测模型,具有预测胰腺癌患者预后的作用,并发现TCGA队列中高低风险组免疫微环境存在差异,可为免疫治疗提供参考。
关键词
胰腺癌
铁死亡
预后
Keywords
pancreatic cancer
ferroptosis
prognosis
分类号
R735.9 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
腹腔镜联合内镜治疗胃部肿瘤
4
作者
韩方海
陈尚祥
周声宁
机构
中山大学孙逸仙纪念医院胃肠外科
出处
《中华胃肠外科杂志》
CSCD
北大核心
2023年第8期745-752,共8页
文摘
随着医疗技术的飞速发展和人们卫生健康意识的增强,良性胃部肿瘤和早期胃癌的检出比例显著增加。如何在保证肿瘤学安全性的前提下,根据胃部肿瘤特征、采用精准合理的治疗方案以实现个体化和精准化治疗、最大限度减少手术创伤及并发症从而改善患者术后生活质量,是胃肠外科医生面临的新挑战。腹腔镜手术和消化内镜手术是当前治疗胃部肿瘤的两种主要手段,但是两者均有其优缺点。而腹腔镜结合内镜治疗胃部肿瘤,已成为治疗胃部肿瘤的新方式。该术式在发挥腹腔镜和内镜优势的同时,也实现了对两种手术的优势互补。本文讨论了腹腔镜联合内镜治疗胃部肿瘤的手术技术类别、适应证以及技术改进和展望。
关键词
胃肿瘤
双镜联合手术
腹腔镜
内镜
适应证
Keywords
Stomach neoplasms
Laparoscopy and endoscopy cooperative surgery
Laparoscopy
Endoscopy
Indications
分类号
R735.2 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
TIMP1与EFEMP1在直肠癌中的表达水平及预后意义
谭莹
练国达
陈少杰
李佳佳
陈尚祥
黄开红
陈茵婷
《岭南现代临床外科》
2020
3
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职称材料
2
240例胰腺癌肝转移临床特征及预后分析
李宣娜
陈尚祥
练国达
陈少杰
黄开红
《岭南现代临床外科》
2020
2
下载PDF
职称材料
3
胰腺癌预后相关铁死亡基因筛选及预后预测模型构建
何冲
周姝睿
李雅晴
陈少杰
练国达
陈尚祥
黄开红
《岭南现代临床外科》
2022
0
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职称材料
4
腹腔镜联合内镜治疗胃部肿瘤
韩方海
陈尚祥
周声宁
《中华胃肠外科杂志》
CSCD
北大核心
2023
0
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