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广东烟区育种材料遗传性状及群体结构分析
1
作者
宗钊辉
陈帧禄
+4 位作者
贺广生
王军
曾涛
陈泽鹏
赵伟才
《安徽农业科学》
CAS
2023年第19期31-35,57,共6页
为明确广东烟草主要育种材料间的遗传关系,通过对广东烟草的5个主要育种材料(YY98、HY1、NX002、NX212与K326)重测序,进行遗传多样性及群体结构分析。平均测序深度高达25.10X,R_q30>95%,基因组平均覆盖度为92.88%,通过筛选分析,最终...
为明确广东烟草主要育种材料间的遗传关系,通过对广东烟草的5个主要育种材料(YY98、HY1、NX002、NX212与K326)重测序,进行遗传多样性及群体结构分析。平均测序深度高达25.10X,R_q30>95%,基因组平均覆盖度为92.88%,通过筛选分析,最终获得26728180 SNPs,不同染色体间SNP数量分布差异较大,SNP密度在7.4~11.1个/kb,其中17号染色体上数量最多。不同品种间在Chr3、Chr4、Chr8、Chr12、Chr14和Chr22上分化程度较大,其中Chr3染色体分化程度最大,平均杂合度为0.4715。K326、NX002、NX212群体的杂合度大于0.5000,具备较高的遗传多样性。系统发育树与主成分分析均认为NX002与K326,HY1与YY98亲缘关系接近,聚为一类,NX212单独分支。该研究为广东烟草亲本选配、优良育种材料利用提供技术支持。
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关键词
烟草品种
重测序
SNP
群体分析
多样性分析
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职称材料
题名
广东烟区育种材料遗传性状及群体结构分析
1
作者
宗钊辉
陈帧禄
贺广生
王军
曾涛
陈泽鹏
赵伟才
机构
广东省烟草科学研究所
广东烟草韶关市有限公司
中国烟草总公司广东省公司
出处
《安徽农业科学》
CAS
2023年第19期31-35,57,共6页
基金
广东省烟草专卖局科技项目(粤烟科中长期项201801,粤烟科202108)。
文摘
为明确广东烟草主要育种材料间的遗传关系,通过对广东烟草的5个主要育种材料(YY98、HY1、NX002、NX212与K326)重测序,进行遗传多样性及群体结构分析。平均测序深度高达25.10X,R_q30>95%,基因组平均覆盖度为92.88%,通过筛选分析,最终获得26728180 SNPs,不同染色体间SNP数量分布差异较大,SNP密度在7.4~11.1个/kb,其中17号染色体上数量最多。不同品种间在Chr3、Chr4、Chr8、Chr12、Chr14和Chr22上分化程度较大,其中Chr3染色体分化程度最大,平均杂合度为0.4715。K326、NX002、NX212群体的杂合度大于0.5000,具备较高的遗传多样性。系统发育树与主成分分析均认为NX002与K326,HY1与YY98亲缘关系接近,聚为一类,NX212单独分支。该研究为广东烟草亲本选配、优良育种材料利用提供技术支持。
关键词
烟草品种
重测序
SNP
群体分析
多样性分析
Keywords
Tobacco varieties
Resequencing
SNP
Population analysis
Diversity analysis
分类号
S572 [农业科学—烟草工业]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
广东烟区育种材料遗传性状及群体结构分析
宗钊辉
陈帧禄
贺广生
王军
曾涛
陈泽鹏
赵伟才
《安徽农业科学》
CAS
2023
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职称材料
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