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基于基因数据库分析CD44在胶质瘤中的表达及意义
1
作者
郭秋云
胡广原
+4 位作者
韩娜
石磊
于洋
陈承奇
张孟贤
《华中科技大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期241-247,共7页
目的研究CD44在胶质瘤中的表达和临床意义,以及CD44下调对胶质瘤细胞增殖、侵袭和凋亡的影响。方法检索Oncomine数据库中关于CD44的信息,对其在各类型肿瘤及胶质瘤中的表达情况进行检索。利用R2基因分析可视化平台及TCGA数据库中下载的...
目的研究CD44在胶质瘤中的表达和临床意义,以及CD44下调对胶质瘤细胞增殖、侵袭和凋亡的影响。方法检索Oncomine数据库中关于CD44的信息,对其在各类型肿瘤及胶质瘤中的表达情况进行检索。利用R2基因分析可视化平台及TCGA数据库中下载的胶质瘤基因芯片数据集,分析CD44的表达水平与胶质瘤患者预后的关系。通过siRNA抑制CD44的表达,通过CCK-8试验、Transwell小室、流式细胞术检测CD44下调对胶质瘤U251细胞增殖、侵袭和凋亡的影响。结果 Oncomine数据库中共收集了467项不同肿瘤类型的关于CD44的研究结果,对比正常组织,有统计学差异的结果有68项,其中CD44表达增高的有51项,表达降低的有17项。胶质瘤中高表达的有10项,未搜索到低表达的项目,10项研究共包括955例样本。分析R2基因分析可视化平台(包含504例胶质母细胞瘤)及TCGA数据库(包含529例低级别胶质瘤)的基因芯片数据发现,CD44高表达患者预后更差。在胶质母细胞瘤中CD44高、低表达组患者2年生存率分别为13%和25%(P=0.000 1),在低级别胶质瘤中CD44高、低表达组患者5年生存率分别为47%和61%(P=0.001 0)。采用特异性针对CD44基因的siRNA转染U251胶质瘤细胞可显著抑制CD44的表达,与阴性对照组和空白对照组相比,转染组的细胞增殖和侵袭明显受到抑制,且流式细胞学显示转染组对比阴性对照组细胞凋亡率增加,分别为7.10%和4.11%(P<0.05)。结论 CD44在胶质瘤中高表达,可作为胶质瘤预后判断指标及潜在的治疗靶点。
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关键词
胶质瘤
CD44
Oncomine数据库
SIRNA
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职称材料
题名
基于基因数据库分析CD44在胶质瘤中的表达及意义
1
作者
郭秋云
胡广原
韩娜
石磊
于洋
陈承奇
张孟贤
机构
华中科技大学同济医学院附属同济医院肿瘤中心
出处
《华中科技大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期241-247,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.81272780)
文摘
目的研究CD44在胶质瘤中的表达和临床意义,以及CD44下调对胶质瘤细胞增殖、侵袭和凋亡的影响。方法检索Oncomine数据库中关于CD44的信息,对其在各类型肿瘤及胶质瘤中的表达情况进行检索。利用R2基因分析可视化平台及TCGA数据库中下载的胶质瘤基因芯片数据集,分析CD44的表达水平与胶质瘤患者预后的关系。通过siRNA抑制CD44的表达,通过CCK-8试验、Transwell小室、流式细胞术检测CD44下调对胶质瘤U251细胞增殖、侵袭和凋亡的影响。结果 Oncomine数据库中共收集了467项不同肿瘤类型的关于CD44的研究结果,对比正常组织,有统计学差异的结果有68项,其中CD44表达增高的有51项,表达降低的有17项。胶质瘤中高表达的有10项,未搜索到低表达的项目,10项研究共包括955例样本。分析R2基因分析可视化平台(包含504例胶质母细胞瘤)及TCGA数据库(包含529例低级别胶质瘤)的基因芯片数据发现,CD44高表达患者预后更差。在胶质母细胞瘤中CD44高、低表达组患者2年生存率分别为13%和25%(P=0.000 1),在低级别胶质瘤中CD44高、低表达组患者5年生存率分别为47%和61%(P=0.001 0)。采用特异性针对CD44基因的siRNA转染U251胶质瘤细胞可显著抑制CD44的表达,与阴性对照组和空白对照组相比,转染组的细胞增殖和侵袭明显受到抑制,且流式细胞学显示转染组对比阴性对照组细胞凋亡率增加,分别为7.10%和4.11%(P<0.05)。结论 CD44在胶质瘤中高表达,可作为胶质瘤预后判断指标及潜在的治疗靶点。
关键词
胶质瘤
CD44
Oncomine数据库
SIRNA
Keywords
glioma
CD44
Oncomine database
siRNA
分类号
R739.4 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于基因数据库分析CD44在胶质瘤中的表达及意义
郭秋云
胡广原
韩娜
石磊
于洋
陈承奇
张孟贤
《华中科技大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017
0
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