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重庆南川区道地药材玄参遗传多样性ISSR分析
被引量:
3
1
作者
马腾蛟
陈杰
+2 位作者
丁显平
陈泓翰
包善飞
《四川大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期1119-1124,共6页
本研究利用ISSR—PCR分子标记技术分析研究了重庆市南川区五个地方人工种植玄参的遗传多样性,利用7条UBC引物共扩增出了61条DNA片段,其中多态性片段为48条.片段长度约为250~2000bp,每条引物扩增出的DNA片段数为4~14条.同时采用NT...
本研究利用ISSR—PCR分子标记技术分析研究了重庆市南川区五个地方人工种植玄参的遗传多样性,利用7条UBC引物共扩增出了61条DNA片段,其中多态性片段为48条.片段长度约为250~2000bp,每条引物扩增出的DNA片段数为4~14条.同时采用NTSYS_pc2.1软件计算出五个区域之间和区域内部子区域的玄参的Nei’S遗传距离,并用UPGMA法分别构建了系统树.结果表明五个地方人工种植玄参存在一定的遗传多态性,但其地方之间差异并不明显,其遗传多样性主要在同一地方内的子区域间被观察到.
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关键词
玄参
种植中药材
ISSR
遗传多样性
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职称材料
滇重楼环阿屯醇合酶基因的克隆及序列分析
被引量:
6
2
作者
袁梦求
丁春邦
+3 位作者
陶亮
陈泓翰
陈惠
吴琦
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第11期2250-2256,共7页
目的获取滇重楼甾体皂苷合成途径关键酶环阿屯醇合酶基因(PpCAS)的全长cDNA序列,并进行序列分析。方法利用同源克隆和RT-PCR技术获得PpCAS基因保守片段,采用RACE技术获得PpCAS基因的3’及5’末端序列,并采用生物信息学方法进行序列分析...
目的获取滇重楼甾体皂苷合成途径关键酶环阿屯醇合酶基因(PpCAS)的全长cDNA序列,并进行序列分析。方法利用同源克隆和RT-PCR技术获得PpCAS基因保守片段,采用RACE技术获得PpCAS基因的3’及5’末端序列,并采用生物信息学方法进行序列分析。结果 PpCAS基因全长cDNA为2 309 bp,其开放阅读框(ORF)为2 283 bp,可编码760个氨基酸的蛋白质;PpCAS推导的蛋白质相对分子质量为8.69×104,等电点(pI)为6.54;其氨基酸序列与GenBank中其他植物CAS的同源性在60%~83%PpCAS蛋白。结论从滇重楼中首次获得PpCAS基因cDNA全长序列,该基因具有CAS同源基因的典型特征。
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关键词
滇重楼
环阿屯醇合酶
基因克隆
序列分析
开放阅读框(ORF)
原文传递
题名
重庆南川区道地药材玄参遗传多样性ISSR分析
被引量:
3
1
作者
马腾蛟
陈杰
丁显平
陈泓翰
包善飞
机构
四川大学生命科学学院遗传医学研究所
重庆市南川生物技术研究院
出处
《四川大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期1119-1124,共6页
基金
国家工信部中药材生产项目(2013-37)
文摘
本研究利用ISSR—PCR分子标记技术分析研究了重庆市南川区五个地方人工种植玄参的遗传多样性,利用7条UBC引物共扩增出了61条DNA片段,其中多态性片段为48条.片段长度约为250~2000bp,每条引物扩增出的DNA片段数为4~14条.同时采用NTSYS_pc2.1软件计算出五个区域之间和区域内部子区域的玄参的Nei’S遗传距离,并用UPGMA法分别构建了系统树.结果表明五个地方人工种植玄参存在一定的遗传多态性,但其地方之间差异并不明显,其遗传多样性主要在同一地方内的子区域间被观察到.
关键词
玄参
种植中药材
ISSR
遗传多样性
Keywords
Scrophularia ningpoensis Hemsl.
Cultural Chinese medicine herb.
Inter-simple sequencerepeat
Genetic diversity
分类号
Q346 [生物学—遗传学]
下载PDF
职称材料
题名
滇重楼环阿屯醇合酶基因的克隆及序列分析
被引量:
6
2
作者
袁梦求
丁春邦
陶亮
陈泓翰
陈惠
吴琦
机构
四川农业大学生命科学与理学院
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第11期2250-2256,共7页
文摘
目的获取滇重楼甾体皂苷合成途径关键酶环阿屯醇合酶基因(PpCAS)的全长cDNA序列,并进行序列分析。方法利用同源克隆和RT-PCR技术获得PpCAS基因保守片段,采用RACE技术获得PpCAS基因的3’及5’末端序列,并采用生物信息学方法进行序列分析。结果 PpCAS基因全长cDNA为2 309 bp,其开放阅读框(ORF)为2 283 bp,可编码760个氨基酸的蛋白质;PpCAS推导的蛋白质相对分子质量为8.69×104,等电点(pI)为6.54;其氨基酸序列与GenBank中其他植物CAS的同源性在60%~83%PpCAS蛋白。结论从滇重楼中首次获得PpCAS基因cDNA全长序列,该基因具有CAS同源基因的典型特征。
关键词
滇重楼
环阿屯醇合酶
基因克隆
序列分析
开放阅读框(ORF)
Keywords
Parispolyphylla var. yunnanensis (Franch.) Hand. - Mazz.
cycloartenol synthase (CAS)
gene cloning
sequence analysis
open reading frame (ORF)
分类号
R282.12 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
重庆南川区道地药材玄参遗传多样性ISSR分析
马腾蛟
陈杰
丁显平
陈泓翰
包善飞
《四川大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2016
3
下载PDF
职称材料
2
滇重楼环阿屯醇合酶基因的克隆及序列分析
袁梦求
丁春邦
陶亮
陈泓翰
陈惠
吴琦
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2012
6
原文传递
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