运用计算机模拟对当归中具有抗肿瘤活性的化学成分进行虚拟筛选.使用Sybyl软件的Surflex-dock模块对小分子与血管内皮生长因子受体进行分子对接,通过Total Score函数分值判断配体分子结合能力,筛选活性化合物.根据Lipinski五法则,使用Di...运用计算机模拟对当归中具有抗肿瘤活性的化学成分进行虚拟筛选.使用Sybyl软件的Surflex-dock模块对小分子与血管内皮生长因子受体进行分子对接,通过Total Score函数分值判断配体分子结合能力,筛选活性化合物.根据Lipinski五法则,使用Discovery Studio 2019 Client的Filter by Lipinski模块进行类药性预筛选评估.使用Swiss ADME和Discovery Studio 2019 Client软件中ADMET descriptors预测所研究化合物的药动学特性.最后利用分子对接预测化合物与靶点蛋白的相互作用模式.结果显示化合物37(阿魏酸)具有最佳药物样特性,与VEGFR具有较高的结合能力,通过体外Biacore分析得到进一步验证.展开更多
目的运用计算机辅助药物设计对银杏叶酚酸的抗肿瘤活性进行虚拟筛选。方法使用Sybyl软件的Surflex-dock模块对小分子与靶蛋白进行分子对接,通过Total Score函数分值判断配体分子结合能力,筛选活性化合物,将筛选出的化合物通过MVD软件进...目的运用计算机辅助药物设计对银杏叶酚酸的抗肿瘤活性进行虚拟筛选。方法使用Sybyl软件的Surflex-dock模块对小分子与靶蛋白进行分子对接,通过Total Score函数分值判断配体分子结合能力,筛选活性化合物,将筛选出的化合物通过MVD软件进一步验证结合能力;根据Lipinski五法则,使用Discovery Studio 2019 Client的Filter by Lipinski模块进行类药性预筛选评估;并进行ADMET(吸收,分布,代谢,排泄,毒性)预测;最后利用分子对接预测化合物与靶标蛋白的相互作用模式。结果银杏酸和漆树酸与肿瘤靶标蛋白具有较高的结合能力和良好的类药活性。分子对接显示,银杏酸和漆树酸中多个结构能与血小板源生长因子受体和磷脂酰肌醇3-激酶的氨基酸残基以氢键结合。结论此研究为中药银杏叶化学成分银杏酸和漆树酸的抗肿瘤研究提供了参考,也为新药研发提供了理论基础。展开更多
文摘运用计算机模拟对当归中具有抗肿瘤活性的化学成分进行虚拟筛选.使用Sybyl软件的Surflex-dock模块对小分子与血管内皮生长因子受体进行分子对接,通过Total Score函数分值判断配体分子结合能力,筛选活性化合物.根据Lipinski五法则,使用Discovery Studio 2019 Client的Filter by Lipinski模块进行类药性预筛选评估.使用Swiss ADME和Discovery Studio 2019 Client软件中ADMET descriptors预测所研究化合物的药动学特性.最后利用分子对接预测化合物与靶点蛋白的相互作用模式.结果显示化合物37(阿魏酸)具有最佳药物样特性,与VEGFR具有较高的结合能力,通过体外Biacore分析得到进一步验证.
文摘目的运用计算机辅助药物设计对银杏叶酚酸的抗肿瘤活性进行虚拟筛选。方法使用Sybyl软件的Surflex-dock模块对小分子与靶蛋白进行分子对接,通过Total Score函数分值判断配体分子结合能力,筛选活性化合物,将筛选出的化合物通过MVD软件进一步验证结合能力;根据Lipinski五法则,使用Discovery Studio 2019 Client的Filter by Lipinski模块进行类药性预筛选评估;并进行ADMET(吸收,分布,代谢,排泄,毒性)预测;最后利用分子对接预测化合物与靶标蛋白的相互作用模式。结果银杏酸和漆树酸与肿瘤靶标蛋白具有较高的结合能力和良好的类药活性。分子对接显示,银杏酸和漆树酸中多个结构能与血小板源生长因子受体和磷脂酰肌醇3-激酶的氨基酸残基以氢键结合。结论此研究为中药银杏叶化学成分银杏酸和漆树酸的抗肿瘤研究提供了参考,也为新药研发提供了理论基础。