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H1N1流感病毒感染原代人视网膜色素上皮细胞的转录组学研究
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作者 冉红利 田金珉 +6 位作者 韩阳 陈章馥 赵迎泽 蓝雨 刘军 周翔天 高福 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2022年第5期535-540,共6页
目的利用高通量转录组测序技术研究H1N1流感病毒感染原代人视网膜色素上皮(retinal pigment epithelial,RPE)细胞后的差异表达基因(differential expressed genes,DEGs)及其参与的相关调控信号通路。方法H1N1流感病毒分别感染原代人RPE... 目的利用高通量转录组测序技术研究H1N1流感病毒感染原代人视网膜色素上皮(retinal pigment epithelial,RPE)细胞后的差异表达基因(differential expressed genes,DEGs)及其参与的相关调控信号通路。方法H1N1流感病毒分别感染原代人RPE细胞2 h或12 h,以H1N1未感染为对照组,提取总RNA,构建文库,进行转录组测序。利用DESeq2软件筛选DEGs,DEGs进行基因本体(gene ontology,GO)功能注释与京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析。结果与对照组相比,H1N1流感病毒感染2 h组共鉴定出1830个DEGs,感染12 h组共鉴定出2847个DEGs;H1N1流感病毒感染动力学过程中(2 h:12 h),共鉴定出1213个DEGs。对H1N1流感病毒感染12 h组的DEGs进行GO功能注释分析,结果表明DEGs广泛存在多种细胞组分中,并参与细胞过程、生物调节、代谢过程等多种生物学过程。KEGG通路富集分析表明,在H1N1流感病毒感染2 h组中,DEGs主要富集在PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、癌症MicroRNAs、细胞因子-细胞因子受体相互作用;在H1N1流感病毒感染12 h组中,DEGs主要富集在PI3K-Akt信号通路、癌症MicroRNAs、AGE-RAGE信号通路以及免疫炎症通路;在H1N1流感病毒感染动力学过程中(2 h:12 h),DEGs主要富集在细胞因子-细胞因子受体相互作用、TGF-β信号通路。结论H1N1流感病毒感染导致RPE细胞的转录组发生显著改变,这些数据为阐明流感病毒等呼吸道病毒感染眼部的分子机制提供了科学参考。 展开更多
关键词 H1N1流感病毒 视网膜色素上皮细胞 转录组 差异表达基因
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COVID-19康复者持续恢复趋势下的部分异常:一项2年随访研究 被引量:1
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作者 林浩 刘雪媛 +20 位作者 孙合 张杰 董少波 刘茂顺 李蕾 田金珉 郭雅欣 甘金籼 陈章馥 王鑫 林颖 张丹妮 刘亚宁 张小山 刘培培 徐柯 周翔天 梁浩 高福 刘军 武桂珍 《Science Bulletin》 SCIE EI CAS CSCD 2022年第15期1556-1561,M0004,共7页
对COVID-19康复患者健康水平和康复后生活质量的评估是值得关注的重要问题.本研究建立了COVID-19康复者的随访队列,进行问卷调查和血液样本检测,血液指标共55项.参与者为2020年初大流行早期阶段湖北省麻城市的COVID-19患者(n=136),同时... 对COVID-19康复患者健康水平和康复后生活质量的评估是值得关注的重要问题.本研究建立了COVID-19康复者的随访队列,进行问卷调查和血液样本检测,血液指标共55项.参与者为2020年初大流行早期阶段湖北省麻城市的COVID-19患者(n=136),同时纳入对照人群(n=125).康复1年后,60.5%报告至少存在一种不适症状,2年后该比例下降至47.5%.在急性期异常的白细胞、血小板、胆红素等指标,1年后基本恢复正常并在2年随访时保持.部分康复者血红蛋白、肌酐等在1年后异常,但多在2年后恢复.少数康复者肌红蛋白、碱性磷酸酶等指标在康复2年仍未完全恢复正常.本研究结果提示,对于新冠康复者需要合理的健康干预措施和较长的后续行动以促进康复. 展开更多
关键词 康复者 随访研究 康复患者 健康干预 后续行动 肌红蛋白 碱性磷酸酶 血液指标
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