图像处理在线虫实验中的应用

在科学实验中,秀丽隐杆线虫是一种广泛使用的模式生物。随着生物图像处理技术的发展,在以线虫为模式生物的研究中图像处理的应用越来越多。图像处理用于从实验过程中拍摄得到的图像或视频中自动识别出线虫,并自动定量线虫的大小、形状等表型。有的实验中还通过图像处理技术对实验视频中的线虫进行动态跟踪,进而分析线虫在各种刺激下的应激反应。一些研究中还通过图像处理技术来测量荧光表达模式以及构建高分辨率的线虫细胞三维数字图谱等。对使用线虫作为模式生物的实验中图像处理技术的应用作了综述。

1种基于信息理论的新分子序列度量法

传统的方法度量序列之间的距离需要序列比对,使一些主观因素破坏数据的原始状态,导致计算结果因人而异。本文拟介绍一些基于信息理论的度量法,提出1种类似的新度量法,建立数学依据。这些度量法度量序列之间的距离不需要序列比对,没有主观因素干涉。同时,选取了20种胎生哺乳动物的线粒体全基因序列,分别使用这些度量法计算出他们的距离,再利用NEIGHBOR法构建系统树。由比较结果看来,新方法用较少时间构建的系统树完全不逊色于以往的方法。这为研究分子序列的差异性提供了1种新方法。