期刊导航
期刊开放获取
河南省图书馆
退出
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
1
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式:
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
Graves眼病中预测性ceRNA网络的构建及免疫细胞浸润模式的鉴定
1
作者
曹家敏
陈海燕
+3 位作者
谢冰雨
陈艺枝
熊炜
李明渊
《中南大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期1185-1196,共12页
目的:Graves眼病(Graves’ophthalmopathy,GO)是一种多因素疾病,其非编码RNA相互作用的机制及炎症细胞浸润模式尚不完全清楚。本研究旨在构建GO的竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络并明确眼眶组织中炎症细胞浸润模式...
目的:Graves眼病(Graves’ophthalmopathy,GO)是一种多因素疾病,其非编码RNA相互作用的机制及炎症细胞浸润模式尚不完全清楚。本研究旨在构建GO的竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络并明确眼眶组织中炎症细胞浸润模式以进一步探究GO的发病机制。方法:使用GEO2R工具鉴定差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),对DEGs进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)和基因本体分析,并从RNA相互作用数据库中提取RNA的相互作用关系;使用STRING数据库鉴定蛋白质之间的相互作用,并通过Cytoscape进行可视化;基于StarBase、miRcode和DIANALncBase Experimental v.2数据库中相互作用的非编码RNA来构建ceRNA网络;采用CIBERSORT算法和R语言检测并描述GO中免疫细胞的浸润模式。结果:共获得114个DEGs,通过KEGG和基因本体分析明确121条通路。使用Cytoscape中的cytoHubba从蛋白质-蛋白质相互作用中提取了4个Hub基因(SRSF6、DDX5、HNRNPC和HNRNPM),共提取104个节点和142条连接,构建出1个ceRNA网络(MALAT1-MIR21-DDX5)。免疫细胞分析结果显示:GO中CD8+T细胞和CD4+静止型记忆T细胞的比例分别上调和下调。CD4+静止型记忆T细胞的比例与MALAT1、MIR21和DDX5的表达呈正相关(均P<0.05)。结论:成功构建出GO眼眶组织内的ceRNA调节网络(MALAT1-MIR21-DDX5),明确在GO中CD4+静止型记忆T细胞的比例下调且与ceRNA组成成分存在正向调节关系,进一步揭示了GO的发病机制。
展开更多
关键词
GRAVES眼病
生物信息学分析
竞争性内源RNA
免疫细胞
下载PDF
职称材料
题名
Graves眼病中预测性ceRNA网络的构建及免疫细胞浸润模式的鉴定
1
作者
曹家敏
陈海燕
谢冰雨
陈艺枝
熊炜
李明渊
机构
中南大学湘雅三医院眼科
出处
《中南大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期1185-1196,共12页
基金
国家自然科学基金(82071006)。
文摘
目的:Graves眼病(Graves’ophthalmopathy,GO)是一种多因素疾病,其非编码RNA相互作用的机制及炎症细胞浸润模式尚不完全清楚。本研究旨在构建GO的竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络并明确眼眶组织中炎症细胞浸润模式以进一步探究GO的发病机制。方法:使用GEO2R工具鉴定差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),对DEGs进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)和基因本体分析,并从RNA相互作用数据库中提取RNA的相互作用关系;使用STRING数据库鉴定蛋白质之间的相互作用,并通过Cytoscape进行可视化;基于StarBase、miRcode和DIANALncBase Experimental v.2数据库中相互作用的非编码RNA来构建ceRNA网络;采用CIBERSORT算法和R语言检测并描述GO中免疫细胞的浸润模式。结果:共获得114个DEGs,通过KEGG和基因本体分析明确121条通路。使用Cytoscape中的cytoHubba从蛋白质-蛋白质相互作用中提取了4个Hub基因(SRSF6、DDX5、HNRNPC和HNRNPM),共提取104个节点和142条连接,构建出1个ceRNA网络(MALAT1-MIR21-DDX5)。免疫细胞分析结果显示:GO中CD8+T细胞和CD4+静止型记忆T细胞的比例分别上调和下调。CD4+静止型记忆T细胞的比例与MALAT1、MIR21和DDX5的表达呈正相关(均P<0.05)。结论:成功构建出GO眼眶组织内的ceRNA调节网络(MALAT1-MIR21-DDX5),明确在GO中CD4+静止型记忆T细胞的比例下调且与ceRNA组成成分存在正向调节关系,进一步揭示了GO的发病机制。
关键词
GRAVES眼病
生物信息学分析
竞争性内源RNA
免疫细胞
Keywords
Graves’ophthalmopathy
bioinformatics analysis
competing endogenous RNA
immune cells
分类号
R581 [医药卫生—内分泌]
R771.3 [医药卫生—眼科]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Graves眼病中预测性ceRNA网络的构建及免疫细胞浸润模式的鉴定
曹家敏
陈海燕
谢冰雨
陈艺枝
熊炜
李明渊
《中南大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部