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基于生物信息学分析肝细胞癌中潜在的核心基因和关键通路
1
作者
何雅慧
陈芝涛
林胜璋
《中国医药科学》
2024年第9期26-30,共5页
目的基于生物信息学分析探索肝细胞癌(HCC)中潜在的核心基因和关键通路,为HCC的诊断和治疗提供新思路。方法本研究使用基因表达数据库(GEO数据库)下载数据集,通过GEO2R在线工具和韦恩图工具筛选出差异表达基因(DEGs),利用STRING数据库和...
目的基于生物信息学分析探索肝细胞癌(HCC)中潜在的核心基因和关键通路,为HCC的诊断和治疗提供新思路。方法本研究使用基因表达数据库(GEO数据库)下载数据集,通过GEO2R在线工具和韦恩图工具筛选出差异表达基因(DEGs),利用STRING数据库和Cytoscape软件进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析并筛选出核心DEGs,并利用GEPIA2在线网站工具分析与预后相关的核心基因。结果本研究在3个数据集中共筛选出210个差异表达基因(DEGs),包括143个共下调基因和67个共上调基因。对共有的DEGs进行蛋白互作(PPI)网络分析,筛选出10个核心基因。GEPIA2分析结果表明,核心基因不仅与HCC免疫细胞浸润相关,也与HCC组织中不同病理阶段的表达水平相关(P<0.05)。将筛选出的10个核心基因进行生存分析,结果显示有6个基因与HCC预后相关。结论本研究筛选出的核心基因和通路可能作为HCC潜在的预后生物标志物和免疫治疗靶点的选择。
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关键词
肝细胞癌
差异表达基因
核心基因
关键通路
生物信息学分析
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职称材料
基于多尺度上下文特征学习的胆管及胆结石图像分割
被引量:
1
2
作者
陈芝涛
《现代计算机》
2021年第25期74-78,共5页
肝胆管结石病是外科的常见病、多发病,实现对CT序列图像中的胆管及胆结石的自动化精准分割具有重要的意义。本文提出一种基于改进卷积神经网络的医学图像分割网络,充分考虑了CT切片间的上下文信息。网络由两对编码器-解码器组构成,包含...
肝胆管结石病是外科的常见病、多发病,实现对CT序列图像中的胆管及胆结石的自动化精准分割具有重要的意义。本文提出一种基于改进卷积神经网络的医学图像分割网络,充分考虑了CT切片间的上下文信息。网络由两对编码器-解码器组构成,包含多尺度上下文特征提取和多尺度特征融合等过程。多尺度卷积可以捕捉胆管及结石的局部细节信息和全局位置信息;ConvLSTM引入相邻切片间的上下文信息以提升分割精度。实验结果表明,该算法在胆管及胆结石的分割任务上具有较好的性能。
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关键词
肝胆管结石
分割
多尺度上下文特征学习
多尺度特征融合
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职称材料
环状RNA特性及其在原发性肝癌中的研究进展
3
作者
陈芝涛
黄佳程
+2 位作者
张乐乐
万大龙
林胜璋
《临床医学进展》
2020年第10期2424-2431,共8页
原发性肝癌是一种常见的肝脏恶性肿瘤,发病率和死亡率较高,且由于早期难以被诊断,以致于错失有效治疗机会。环状RNA (circRNA)是内源性长链非编码RNA家族中的一员,因其具有稳定性,高度保守性和时间、空间特异性等特征,故其广泛累积表达...
原发性肝癌是一种常见的肝脏恶性肿瘤,发病率和死亡率较高,且由于早期难以被诊断,以致于错失有效治疗机会。环状RNA (circRNA)是内源性长链非编码RNA家族中的一员,因其具有稳定性,高度保守性和时间、空间特异性等特征,故其广泛累积表达于真核细胞的细胞质中。近年来发现circRNA在原发性肝癌的细胞增殖、凋亡、侵袭转移及预后等多方面发挥着巨大作用。目前circRNA已是继LncRNA后作为多种肿瘤早期诊断标志物和新治疗靶点的研究热点。本文对circRNA特征及其在原发性肝癌中的相关研究进展进行概述,以便于进一步探究其在原发性肝癌的临床诊疗过程中的潜在应用。
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关键词
环状RNA
原发性肝癌
研究进展
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职称材料
低压零线中存在“线档负荷高峰”
4
作者
陈芝涛
《电世界》
1991年第4期16-17,共2页
关键词
低压电网
零线
线档
负荷高峰
电网
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职称材料
早期原发性肝脏肉瘤样癌1例报告
5
作者
鲍利
黄佳程
+2 位作者
陈芝涛
万大龙
林胜璋
《临床医学进展》
2020年第3期284-288,共5页
肝脏肉瘤样癌临床上少见,目前病因不明,可能与乙型肝炎病毒感染和术前抗癌治疗有关。患者临床表现和影像学表现缺乏特征性,术前诊断此病比较困难,确诊依赖病理学和免疫组织化学检查。肝脏肉瘤样癌预后差,缺乏有效的治疗方法,目前手术仍...
肝脏肉瘤样癌临床上少见,目前病因不明,可能与乙型肝炎病毒感染和术前抗癌治疗有关。患者临床表现和影像学表现缺乏特征性,术前诊断此病比较困难,确诊依赖病理学和免疫组织化学检查。肝脏肉瘤样癌预后差,缺乏有效的治疗方法,目前手术仍是有望延长患者生存时间的治疗方法。本研究报道了1例预后相对较好的早期原发性肝脏肉瘤样癌。
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关键词
肉瘤样癌
肝脏
乙型肝炎病毒
预后
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职称材料
以免疫治疗联合化疗为中心的肝内胆管癌转化治疗1例
6
作者
顾杨军
肖慜
+1 位作者
陈芝涛
李启勇
《中华外科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期526-528,共3页
患者女性,71岁,因"检查发现肝内胆管癌1个月余"于2021年8月11日收入我科。患者1个月前检查发现肝内占位,于当地医院行影像学检查提示肝内多发占位伴门静脉右前支癌栓形成。予穿刺活检,病理学检查结果提示胆管癌,外院予以经肝...
患者女性,71岁,因"检查发现肝内胆管癌1个月余"于2021年8月11日收入我科。患者1个月前检查发现肝内占位,于当地医院行影像学检查提示肝内多发占位伴门静脉右前支癌栓形成。予穿刺活检,病理学检查结果提示胆管癌,外院予以经肝动脉栓塞化疗(transcatheter arterial chemoembolization,TACE)联合替雷利珠单抗免疫治疗。患者既往因心房颤动伴缓慢心室率植入心脏起搏器,5年前患脑梗死,高血压2级(高危),口服缬沙坦氢氯噻嗪片控制可;2型糖尿病,口服二甲双胍控制可;三叉神经痛。无肾脏疾病史,无吸烟、饮酒史,无家族病史。
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关键词
肝内胆管癌
三叉神经痛
家族病史
联合化疗
穿刺活检
肾脏疾病
ARTERIAL
免疫治疗
原文传递
题名
基于生物信息学分析肝细胞癌中潜在的核心基因和关键通路
1
作者
何雅慧
陈芝涛
林胜璋
机构
浙江中医药大学研究生院
树兰(杭州)医院肝胆胰外科
出处
《中国医药科学》
2024年第9期26-30,共5页
文摘
目的基于生物信息学分析探索肝细胞癌(HCC)中潜在的核心基因和关键通路,为HCC的诊断和治疗提供新思路。方法本研究使用基因表达数据库(GEO数据库)下载数据集,通过GEO2R在线工具和韦恩图工具筛选出差异表达基因(DEGs),利用STRING数据库和Cytoscape软件进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析并筛选出核心DEGs,并利用GEPIA2在线网站工具分析与预后相关的核心基因。结果本研究在3个数据集中共筛选出210个差异表达基因(DEGs),包括143个共下调基因和67个共上调基因。对共有的DEGs进行蛋白互作(PPI)网络分析,筛选出10个核心基因。GEPIA2分析结果表明,核心基因不仅与HCC免疫细胞浸润相关,也与HCC组织中不同病理阶段的表达水平相关(P<0.05)。将筛选出的10个核心基因进行生存分析,结果显示有6个基因与HCC预后相关。结论本研究筛选出的核心基因和通路可能作为HCC潜在的预后生物标志物和免疫治疗靶点的选择。
关键词
肝细胞癌
差异表达基因
核心基因
关键通路
生物信息学分析
Keywords
Hepatocellular carcinoma
Differentially expressed genes
Core gene
Key pathway
Bioinformatics analysis
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
基于多尺度上下文特征学习的胆管及胆结石图像分割
被引量:
1
2
作者
陈芝涛
机构
广东工业大学信息工程学院
出处
《现代计算机》
2021年第25期74-78,共5页
文摘
肝胆管结石病是外科的常见病、多发病,实现对CT序列图像中的胆管及胆结石的自动化精准分割具有重要的意义。本文提出一种基于改进卷积神经网络的医学图像分割网络,充分考虑了CT切片间的上下文信息。网络由两对编码器-解码器组构成,包含多尺度上下文特征提取和多尺度特征融合等过程。多尺度卷积可以捕捉胆管及结石的局部细节信息和全局位置信息;ConvLSTM引入相邻切片间的上下文信息以提升分割精度。实验结果表明,该算法在胆管及胆结石的分割任务上具有较好的性能。
关键词
肝胆管结石
分割
多尺度上下文特征学习
多尺度特征融合
Keywords
hepatolithiasis
segmentation
multi-scale context feature learning
multi-scale feature fusion
分类号
R575.7 [医药卫生—消化系统]
TP391.41 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
环状RNA特性及其在原发性肝癌中的研究进展
3
作者
陈芝涛
黄佳程
张乐乐
万大龙
林胜璋
机构
浙江大学医学院
出处
《临床医学进展》
2020年第10期2424-2431,共8页
文摘
原发性肝癌是一种常见的肝脏恶性肿瘤,发病率和死亡率较高,且由于早期难以被诊断,以致于错失有效治疗机会。环状RNA (circRNA)是内源性长链非编码RNA家族中的一员,因其具有稳定性,高度保守性和时间、空间特异性等特征,故其广泛累积表达于真核细胞的细胞质中。近年来发现circRNA在原发性肝癌的细胞增殖、凋亡、侵袭转移及预后等多方面发挥着巨大作用。目前circRNA已是继LncRNA后作为多种肿瘤早期诊断标志物和新治疗靶点的研究热点。本文对circRNA特征及其在原发性肝癌中的相关研究进展进行概述,以便于进一步探究其在原发性肝癌的临床诊疗过程中的潜在应用。
关键词
环状RNA
原发性肝癌
研究进展
Keywords
Cyclic RNA
Primary Liver Cancer
Research Progress
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
低压零线中存在“线档负荷高峰”
4
作者
陈芝涛
出处
《电世界》
1991年第4期16-17,共2页
关键词
低压电网
零线
线档
负荷高峰
电网
分类号
TM727 [电气工程—电力系统及自动化]
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职称材料
题名
早期原发性肝脏肉瘤样癌1例报告
5
作者
鲍利
黄佳程
陈芝涛
万大龙
林胜璋
机构
浙江大学医学院附属第一医院肝胆胰外科
出处
《临床医学进展》
2020年第3期284-288,共5页
文摘
肝脏肉瘤样癌临床上少见,目前病因不明,可能与乙型肝炎病毒感染和术前抗癌治疗有关。患者临床表现和影像学表现缺乏特征性,术前诊断此病比较困难,确诊依赖病理学和免疫组织化学检查。肝脏肉瘤样癌预后差,缺乏有效的治疗方法,目前手术仍是有望延长患者生存时间的治疗方法。本研究报道了1例预后相对较好的早期原发性肝脏肉瘤样癌。
关键词
肉瘤样癌
肝脏
乙型肝炎病毒
预后
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
以免疫治疗联合化疗为中心的肝内胆管癌转化治疗1例
6
作者
顾杨军
肖慜
陈芝涛
李启勇
机构
浙江树人大学树兰国际医学院附属树兰杭州医院肝胆胰外科
出处
《中华外科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期526-528,共3页
文摘
患者女性,71岁,因"检查发现肝内胆管癌1个月余"于2021年8月11日收入我科。患者1个月前检查发现肝内占位,于当地医院行影像学检查提示肝内多发占位伴门静脉右前支癌栓形成。予穿刺活检,病理学检查结果提示胆管癌,外院予以经肝动脉栓塞化疗(transcatheter arterial chemoembolization,TACE)联合替雷利珠单抗免疫治疗。患者既往因心房颤动伴缓慢心室率植入心脏起搏器,5年前患脑梗死,高血压2级(高危),口服缬沙坦氢氯噻嗪片控制可;2型糖尿病,口服二甲双胍控制可;三叉神经痛。无肾脏疾病史,无吸烟、饮酒史,无家族病史。
关键词
肝内胆管癌
三叉神经痛
家族病史
联合化疗
穿刺活检
肾脏疾病
ARTERIAL
免疫治疗
分类号
R735.8 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物信息学分析肝细胞癌中潜在的核心基因和关键通路
何雅慧
陈芝涛
林胜璋
《中国医药科学》
2024
0
下载PDF
职称材料
2
基于多尺度上下文特征学习的胆管及胆结石图像分割
陈芝涛
《现代计算机》
2021
1
下载PDF
职称材料
3
环状RNA特性及其在原发性肝癌中的研究进展
陈芝涛
黄佳程
张乐乐
万大龙
林胜璋
《临床医学进展》
2020
0
下载PDF
职称材料
4
低压零线中存在“线档负荷高峰”
陈芝涛
《电世界》
1991
0
下载PDF
职称材料
5
早期原发性肝脏肉瘤样癌1例报告
鲍利
黄佳程
陈芝涛
万大龙
林胜璋
《临床医学进展》
2020
0
下载PDF
职称材料
6
以免疫治疗联合化疗为中心的肝内胆管癌转化治疗1例
顾杨军
肖慜
陈芝涛
李启勇
《中华外科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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