基于生物信息学的溃疡性结肠炎相关结直肠癌核心基因的筛选和特征分析

目的:通过筛选溃疡性结肠炎相关性结直肠癌核心基因并对其进行特征分析,探究其在溃疡性结肠炎相关性结直肠癌发生发展中的作用。方法:从GEO数据库下载基因芯片数据集GSE37283,GSE4183,筛选出差异表达基因,结合GEPIA数据库中结直肠癌上调的差异表达基因矩阵,筛选出三者的交集基因。构建蛋白质-蛋白质相互作用模型,找出核心基因,进一步检验其在癌组织中的表达水平。运用TIMER数据库分析结直肠癌组织中的免疫细胞浸润情况。应用CMAP数据库筛选与IL-1β表达呈负性相关的药物。结果:总共获得63个差异基因,核心基因为IL-1β,其在结直肠癌组织中的表达水平显著升高。IL-1β主要对中性粒细胞起聚集作用。筛选出10个与IL-1β基因关联度最高的小分子化合物。结论:IL-1β在溃疡性结肠炎相关性结直肠癌发生发展中起重要作用,可为溃疡性结肠炎相关性结直肠癌的早期诊断及治疗提供参考。